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大别山牛瘤胃大小比较及其相关调控基因表达分析
1
作者
章会斌
王博
+7 位作者
金磊
金海
杜欣怡
李倩
李庆岗
赵拴平
朱勇
徐磊
《中国畜禽种业》
2025年第9期76-85,共10页
该研究旨在解析大别山牛瘤胃大小的关键调控基因及分子机制,为地方牛种质改良提供理论依据。选取24月龄、体重相近的大别山牛母牛20头,测定宰前活重及瘤胃重量,根据瘤胃重量及其占比,筛选出瘤胃重量较高组(H组)和较低组(L组)各3头,采集...
该研究旨在解析大别山牛瘤胃大小的关键调控基因及分子机制,为地方牛种质改良提供理论依据。选取24月龄、体重相近的大别山牛母牛20头,测定宰前活重及瘤胃重量,根据瘤胃重量及其占比,筛选出瘤胃重量较高组(H组)和较低组(L组)各3头,采集瘤胃组织样本。利用Illumina Hiseq 2000平台进行转录组测序。结果显示,H组瘤胃重量及占宰前活重比例均显著高于L组(P<0.05),两组宰前活重无显著差异(P>0.05)。在两组中共鉴定出449个差异表达基因,其中348个在H组上调,101个下调。GO功能注释显示差异表达基因显著富集于代谢、免疫、催化活性、转运蛋白活性、转录因子结合等条目。KEGG通路富集分析表明差异表达基因显著富集于免疫相关通路、代谢功能调控通路、昼夜节律调控通路以及参与细胞组织结构和功能的通路。基于PPI网络分析和degree算法,鉴定出PTGS2、BCL2、GRO1、IL6R和INSR 5个关键节点基因可能参与大别山牛瘤胃免疫-代谢-组织结构的调控。该研究通过比较分析瘤胃大小差异的大别山牛瘤胃转录组,建立了与大别山牛瘤胃免疫-代谢-组织结构相关的调控网络,并筛选出PTGS2、BCL2、GRO1、IL6R和INSR这5个网络核心基因,它们可能通过协同调控瘤胃发育。
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关键词
大别山牛
瘤胃
转录组
调控网络
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职称材料
题名
大别山牛瘤胃大小比较及其相关调控基因表达分析
1
作者
章会斌
王博
金磊
金海
杜欣怡
李倩
李庆岗
赵拴平
朱勇
徐磊
机构
安徽省
农业
科学院畜牧兽医研究所/安徽省畜禽产品安全重点实验室
太湖县久鸿农业综合开发有限责任公司
出处
《中国畜禽种业》
2025年第9期76-85,共10页
基金
国家肉牛牦牛产业技术体系合肥综合试验站(CARS-37)
安徽省科技攻坚计划项目子课题(202423m10050001)
+1 种基金
安徽省肉牛良种联合攻关项目
安徽省农业科学院新进博士项目(XJBS-202432)。
文摘
该研究旨在解析大别山牛瘤胃大小的关键调控基因及分子机制,为地方牛种质改良提供理论依据。选取24月龄、体重相近的大别山牛母牛20头,测定宰前活重及瘤胃重量,根据瘤胃重量及其占比,筛选出瘤胃重量较高组(H组)和较低组(L组)各3头,采集瘤胃组织样本。利用Illumina Hiseq 2000平台进行转录组测序。结果显示,H组瘤胃重量及占宰前活重比例均显著高于L组(P<0.05),两组宰前活重无显著差异(P>0.05)。在两组中共鉴定出449个差异表达基因,其中348个在H组上调,101个下调。GO功能注释显示差异表达基因显著富集于代谢、免疫、催化活性、转运蛋白活性、转录因子结合等条目。KEGG通路富集分析表明差异表达基因显著富集于免疫相关通路、代谢功能调控通路、昼夜节律调控通路以及参与细胞组织结构和功能的通路。基于PPI网络分析和degree算法,鉴定出PTGS2、BCL2、GRO1、IL6R和INSR 5个关键节点基因可能参与大别山牛瘤胃免疫-代谢-组织结构的调控。该研究通过比较分析瘤胃大小差异的大别山牛瘤胃转录组,建立了与大别山牛瘤胃免疫-代谢-组织结构相关的调控网络,并筛选出PTGS2、BCL2、GRO1、IL6R和INSR这5个网络核心基因,它们可能通过协同调控瘤胃发育。
关键词
大别山牛
瘤胃
转录组
调控网络
Keywords
Dabieshan cattle
Rumen
RNA-seq
Regulatory network
分类号
S823.81 [农业科学—畜牧学]
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
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操作
1
大别山牛瘤胃大小比较及其相关调控基因表达分析
章会斌
王博
金磊
金海
杜欣怡
李倩
李庆岗
赵拴平
朱勇
徐磊
《中国畜禽种业》
2025
0
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