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内含子源性长链非编码RNA SOS1-IT1对肝癌细胞的调控
被引量：
2
1
作者
付楠楠
刘蕊
刘涛
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2021年第19期2447-2452,2457,共7页
目的探寻内含子来源的长链非编码RNA(lncRNA)SOS1-IT1对肝癌细胞的影响及分子机制。方法用人肝癌细胞系QGY-7703作为细胞模型,CCK-8实验检测细胞活性,EdU实验检测细胞DNA复制活性。生物信息学预测RNA序列中的miR-124潜在结合位点(MRE)...
目的探寻内含子来源的长链非编码RNA(lncRNA)SOS1-IT1对肝癌细胞的影响及分子机制。方法用人肝癌细胞系QGY-7703作为细胞模型,CCK-8实验检测细胞活性,EdU实验检测细胞DNA复制活性。生物信息学预测RNA序列中的miR-124潜在结合位点(MRE)。用真核表达质粒pcDNA3.1(+)作为SOS1-IT1及其MRE,以及miR-124的过表达载体。将MRE克隆插入增强型绿色荧光蛋白(EGFP)的编码区下游,构建荧光报告基因质粒。荧光报告基因实验检测miR-124对MRE序列的特异性结合和调控。结果在人肝癌QGY-7703细胞系中,过表达lncRNA SOS1-IT1能够增强细胞的活性[(1.184±0.114)vs.(0.928±0.104),P<0.05]并加速DNA复制[(0.625±0.013)vs.(0.206±0.016),P<0.05],抑制SOS1-IT1则降低细胞活性[(0.648±0.062)vs.(0.870±0.091),P<0.05]并减缓DNA复制[(0.126±0.022)vs.(0.271±0.033),P<0.05]。生物信息学预测发现,SOS1 mRNA及SOS1-IT1分别包含3个和1个潜在的miR-124的MRE。荧光报告基因实验确定,SOS1 mRNA的前2个MRE,以及SOS1-IT1的MRE均为miR-124的有效结合位点。用包含SOS1-MRE的荧光报告基因质粒转染QGY-7703细胞,同时表达SOS1-IT1的MRE能够增强荧光强度[(3.68±0.315)vs.(2.71±0.180),P<0.05]。进一步过表达miR-124后,荧光强度发生回落[(1.09±0.143)vs.(4.04±0.079),P<0.05]。若将任意一个MRE序列突变,荧光强度不再发生变化[(2.57±0.244)vs.(2.71±0.180);(2.66±0.200)vs.(2.88±0.169),均P>0.05]。结论内含子来源的lncRNA SOS1-IT1能够与宿主基因SOS1竞争性结合细胞内源性miR-124,通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制促进SOS1的表达,并促进肝癌细胞的活性和DNA复制。
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关键词
肝细胞癌
长链非编码RNA
微RNA
竞争性内源RNA
内含子
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职称材料
超基因:基因表达的“多面手”
2
作者
刘涛
王树森
+2 位作者
杨磊
时乔
沈中阳
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期265-270,共6页
真核生物基因组的转录是基因表达的重要环节,转录产物不仅包括编码蛋白的信使RNA,还包括众多类型的非编码RNA。在转录过程中,有些基因位点可生成不止一种RNA分子,其中可能包括编码RNA分子,但更多的是非编码RNA分子,这类可转录生成多种RN...
真核生物基因组的转录是基因表达的重要环节,转录产物不仅包括编码蛋白的信使RNA,还包括众多类型的非编码RNA。在转录过程中,有些基因位点可生成不止一种RNA分子,其中可能包括编码RNA分子,但更多的是非编码RNA分子,这类可转录生成多种RNA分子的基因位点被命名为超基因。根据转录模式的不同,超基因分为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型。本文结合实例,对各型超基因的转录特点及其在细胞中的调控作用进行综述。
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关键词
超基因
非编码RNA
转录
基因调控
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职称材料
题名
内含子源性长链非编码RNA SOS1-IT1对肝癌细胞的调控
被引量：
2
1
作者
付楠楠
刘蕊
刘涛
机构
天津市
儿童
医院
(
天津
大学儿童
医院
)消化科
天津市第一中心医院国家卫生健康委员会危重病急救医学重点实验室
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2021年第19期2447-2452,2457,共7页
基金
国家自然科学基金项目(编号:81402322)
天津市第一中心医院科技基金项目(编号:2020CM01)。
文摘
目的探寻内含子来源的长链非编码RNA(lncRNA)SOS1-IT1对肝癌细胞的影响及分子机制。方法用人肝癌细胞系QGY-7703作为细胞模型,CCK-8实验检测细胞活性,EdU实验检测细胞DNA复制活性。生物信息学预测RNA序列中的miR-124潜在结合位点(MRE)。用真核表达质粒pcDNA3.1(+)作为SOS1-IT1及其MRE,以及miR-124的过表达载体。将MRE克隆插入增强型绿色荧光蛋白(EGFP)的编码区下游,构建荧光报告基因质粒。荧光报告基因实验检测miR-124对MRE序列的特异性结合和调控。结果在人肝癌QGY-7703细胞系中,过表达lncRNA SOS1-IT1能够增强细胞的活性[(1.184±0.114)vs.(0.928±0.104),P<0.05]并加速DNA复制[(0.625±0.013)vs.(0.206±0.016),P<0.05],抑制SOS1-IT1则降低细胞活性[(0.648±0.062)vs.(0.870±0.091),P<0.05]并减缓DNA复制[(0.126±0.022)vs.(0.271±0.033),P<0.05]。生物信息学预测发现,SOS1 mRNA及SOS1-IT1分别包含3个和1个潜在的miR-124的MRE。荧光报告基因实验确定,SOS1 mRNA的前2个MRE,以及SOS1-IT1的MRE均为miR-124的有效结合位点。用包含SOS1-MRE的荧光报告基因质粒转染QGY-7703细胞,同时表达SOS1-IT1的MRE能够增强荧光强度[(3.68±0.315)vs.(2.71±0.180),P<0.05]。进一步过表达miR-124后,荧光强度发生回落[(1.09±0.143)vs.(4.04±0.079),P<0.05]。若将任意一个MRE序列突变,荧光强度不再发生变化[(2.57±0.244)vs.(2.71±0.180);(2.66±0.200)vs.(2.88±0.169),均P>0.05]。结论内含子来源的lncRNA SOS1-IT1能够与宿主基因SOS1竞争性结合细胞内源性miR-124,通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制促进SOS1的表达,并促进肝癌细胞的活性和DNA复制。
关键词
肝细胞癌
长链非编码RNA
微RNA
竞争性内源RNA
内含子
Keywords
hepatocellular carcinoma
long non-coding RNA
microRNA
competing endogenous RNA
intron
分类号
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
超基因:基因表达的“多面手”
2
作者
刘涛
王树森
杨磊
时乔
沈中阳
机构
天津市第一中心医院
中国
医学
科学院移植
医学
重点
实验室
天津市第一中心医院国家卫生健康委员会危重病急救医学重点实验室
天津市第一中心医院
天津市
器官移植临床
医学
研究
中心
天津市第一中心医院
器官移植
中心
天津市第一中心医院
检验科
天津
中医药大学研究生院
出处
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期265-270,共6页
基金
国家自然科学基金(81402322)
中国医学科学院重点实验室项目基金(2018PT32021)。
文摘
真核生物基因组的转录是基因表达的重要环节,转录产物不仅包括编码蛋白的信使RNA,还包括众多类型的非编码RNA。在转录过程中,有些基因位点可生成不止一种RNA分子,其中可能包括编码RNA分子,但更多的是非编码RNA分子,这类可转录生成多种RNA分子的基因位点被命名为超基因。根据转录模式的不同,超基因分为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型。本文结合实例,对各型超基因的转录特点及其在细胞中的调控作用进行综述。
关键词
超基因
非编码RNA
转录
基因调控
Keywords
supergene
non-coding RNA
transcription
gene regulation
分类号
R394.3 [医药卫生—医学遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
内含子源性长链非编码RNA SOS1-IT1对肝癌细胞的调控
付楠楠
刘蕊
刘涛
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2021
2
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职称材料
2
超基因:基因表达的“多面手”
刘涛
王树森
杨磊
时乔
沈中阳
《中国医学科学院学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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