目的揭示结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）北京基因型菌株的进化路径，在进化过程中产生的各个进化分支，以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB...目的揭示结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）北京基因型菌株的进化路径，在进化过程中产生的各个进化分支，以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株，首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207（RD207）的缺失情况，以鉴定收集的菌株是否为北京基因型；然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况，以及菌株基因组NTF（noise transfer function）区中插入序列6110（IS6110）的存在情况。结果567株临床分离的MTB菌株中，517株（91．2％）为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中，447株（86．5％）为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株；70株（13．5％）为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析，北京基因型菌株被分为5个亚型，其中RD181（＋）的北京基因型菌株为22株（4．3％），且全部为北京基因型古代株。RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的北京基因型古代株分别为41株（7．9％）和7株（1．4％）。447株现代菌株中，RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的分别为404株（78．1％）和43株（8．3％）。结论MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株；北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支，其中RD181（-）／RD150（＋）的北京基因型现代株为主要的流行分支。展开更多
文摘目的揭示结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）北京基因型菌株的进化路径，在进化过程中产生的各个进化分支，以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株，首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207（RD207）的缺失情况，以鉴定收集的菌株是否为北京基因型；然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况，以及菌株基因组NTF（noise transfer function）区中插入序列6110（IS6110）的存在情况。结果567株临床分离的MTB菌株中，517株（91．2％）为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中，447株（86．5％）为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株；70株（13．5％）为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析，北京基因型菌株被分为5个亚型，其中RD181（＋）的北京基因型菌株为22株（4．3％），且全部为北京基因型古代株。RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的北京基因型古代株分别为41株（7．9％）和7株（1．4％）。447株现代菌株中，RD181（-）／RD150（＋）和RD181（-）／RD150（-）的分别为404株（78．1％）和43株（8．3％）。结论MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株；北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支，其中RD181（-）／RD150（＋）的北京基因型现代株为主要的流行分支。
