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基于GEO数据库分析影响口腔鳞状细胞癌的关键基因
被引量:
4
1
作者
赵军
刘丽娜
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期819-823,共5页
目的:筛选口腔鳞状细胞癌(OSCC)潜在的关键基因。方法:从GEO数据库下载基因表达数集GSE74530、GSE78060和GSE138206,利用生物信息学的方法鉴定影响OSCC发生、发展的关键基因。结果:FN1、COL1A1、COL1A2、COL3A1、CD44、COL4A1、COL5A1、...
目的:筛选口腔鳞状细胞癌(OSCC)潜在的关键基因。方法:从GEO数据库下载基因表达数集GSE74530、GSE78060和GSE138206,利用生物信息学的方法鉴定影响OSCC发生、发展的关键基因。结果:FN1、COL1A1、COL1A2、COL3A1、CD44、COL4A1、COL5A1、CXCL8、POSTN和CXCL10被鉴定为hub基因。生存分析显示FN1、CD44、COL5A1、CXCL8的高表达和COL3A1的低表达与预后不良相关。结论:FN1、CD44、COL5A1、CXCL8和COL3A1可作为OSCC诊断和治疗的潜在生物标志物。
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关键词
GEO
口腔鳞状细胞癌
hub基因
生存分析
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题名
基于GEO数据库分析影响口腔鳞状细胞癌的关键基因
被引量:
4
1
作者
赵军
刘丽娜
机构
天津市口腔医院修复一科·南开大学医学院·天津市口腔功能重建重点实验室
出处
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期819-823,共5页
基金
天津市口腔医院博硕士重点项目(编号:2019BSZD06)。
文摘
目的:筛选口腔鳞状细胞癌(OSCC)潜在的关键基因。方法:从GEO数据库下载基因表达数集GSE74530、GSE78060和GSE138206,利用生物信息学的方法鉴定影响OSCC发生、发展的关键基因。结果:FN1、COL1A1、COL1A2、COL3A1、CD44、COL4A1、COL5A1、CXCL8、POSTN和CXCL10被鉴定为hub基因。生存分析显示FN1、CD44、COL5A1、CXCL8的高表达和COL3A1的低表达与预后不良相关。结论:FN1、CD44、COL5A1、CXCL8和COL3A1可作为OSCC诊断和治疗的潜在生物标志物。
关键词
GEO
口腔鳞状细胞癌
hub基因
生存分析
Keywords
GEO
Oral squamous cell carcinoma
Hub genes
Survival analysis
分类号
R739.8 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于GEO数据库分析影响口腔鳞状细胞癌的关键基因
赵军
刘丽娜
《实用口腔医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
4
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