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一般罚分(或得分)矩阵下的SPA算法
被引量:
1
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作者
沈世镒
张拓
王奎
《应用数学》
CSCD
北大核心
2007年第3期627-632,共6页
本文在一般罚分(或得分)矩阵条件下推广SPA(Super Pairwise Alignment)算法,该算法是一种次优算法,与Smith-Waterman算法比较,计算速度有明显改进(计算复杂度随序列长度线性增长).
关键词
一般罚分(或得分)矩阵
SPA算法
线性复杂度
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职称材料
题名
一般罚分(或得分)矩阵下的SPA算法
被引量:
1
1
作者
沈世镒
张拓
王奎
机构
天津市南开大学数学科学学院与lpmc
出处
《应用数学》
CSCD
北大核心
2007年第3期627-632,共6页
基金
国家自然科学基金(10271061
90208022)
+1 种基金
天南大联合研究项目
刘徽应用数学研究中心资助
文摘
本文在一般罚分(或得分)矩阵条件下推广SPA(Super Pairwise Alignment)算法,该算法是一种次优算法,与Smith-Waterman算法比较,计算速度有明显改进(计算复杂度随序列长度线性增长).
关键词
一般罚分(或得分)矩阵
SPA算法
线性复杂度
Keywords
General penalty/score matrix
SPA algorithm
Linear complexity
分类号
O212.3 [理学—概率论与数理统计]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一般罚分(或得分)矩阵下的SPA算法
沈世镒
张拓
王奎
《应用数学》
CSCD
北大核心
2007
1
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