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菜豆响应盐胁迫的转录组分析
1
作者
于思佳
于太飞
+9 位作者
孙现军
王世佳
武书羽
姜雪敏
胡正
常玉洁
武晶
陈锐
张辉
姜奇彦
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第7期1398-1415,共18页
菜豆是我国重要的可食用豆类,具有丰富的营养成分和广泛的使用价值。盐胁迫对菜豆的生长发育影响显著。本研究以菜豆F0006591为材料,用0.2 mol/L NaCl溶液对苗期菜豆进行盐胁迫处理。利用RNA-seq测序技术,对盐胁迫处理0 h、6 h、9 h、1...
菜豆是我国重要的可食用豆类,具有丰富的营养成分和广泛的使用价值。盐胁迫对菜豆的生长发育影响显著。本研究以菜豆F0006591为材料,用0.2 mol/L NaCl溶液对苗期菜豆进行盐胁迫处理。利用RNA-seq测序技术,对盐胁迫处理0 h、6 h、9 h、12 h、24 h的菜豆根系中的差异表达基因进行系统分析。结果表明:盐胁迫处理后,相较于对照组(0 h),不同盐胁迫处理时间的样本基因表达量都发生显著变化,其中盐胁迫处理不同时间点都差异表达的基因共3383个。对这些基因进行GO和KEGG富集分析发现,它们主要参与到盐胁迫响应、氧化应激、细胞防御等生物过程中,涉及植物激素信号传导、谷胱甘肽代谢、糖酵解等多种代谢途径。对盐胁迫下所有上调表达的关键基因进行共表达网络关联分析发现,脱落酸信号传导途径核心组分与抗氧化胁迫和能量代谢途径中的相关基因之间存在显著相关性,经RT-qPCR验证,4个激素信号途径相关基因、6个能量代谢相关基因及2个抗氧化相关基因随盐胁迫处理时间的增加,其表达量的动态变化呈逐渐上升趋势且与RNA-seq分析结果一致。该结果暗示ABA信号传导途径可能在菜豆盐胁迫响应调控网络中发挥重要作用。本研究为菜豆耐盐分子机制的研究提供参考依据。
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关键词
菜豆
盐胁迫
转录组分析
差异表达基因
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职称材料
题名
菜豆响应盐胁迫的转录组分析
1
作者
于思佳
于太飞
孙现军
王世佳
武书羽
姜雪敏
胡正
常玉洁
武晶
陈锐
张辉
姜奇彦
机构
南开大学生命
科学
学院
中国
农业
科学院
作物
科学
研究所/
农业
农村部粮食作物基因资源评价利用
重点
实验室
中国
农业
科学院
作物
科学
研究所/作物基因资源与
育种
全国
重点
实验室
天津市农业科学院/蔬菜生物育种全国重点实验室
国家盐碱地综合利用技术创新中心
出处
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025年第7期1398-1415,共18页
基金
山东省重点研发计划项目(ZDYF2023LZGC001,2024SFGC0404)
中国农业科学院科技创新工程项目(ASTIP No.CAAS ZDRW202201,01-ICS-02)
江苏省现代作物生产协同创新中心和现代作物生产省部共建协同创新中心项目(CIC-MCP)。
文摘
菜豆是我国重要的可食用豆类,具有丰富的营养成分和广泛的使用价值。盐胁迫对菜豆的生长发育影响显著。本研究以菜豆F0006591为材料,用0.2 mol/L NaCl溶液对苗期菜豆进行盐胁迫处理。利用RNA-seq测序技术,对盐胁迫处理0 h、6 h、9 h、12 h、24 h的菜豆根系中的差异表达基因进行系统分析。结果表明:盐胁迫处理后,相较于对照组(0 h),不同盐胁迫处理时间的样本基因表达量都发生显著变化,其中盐胁迫处理不同时间点都差异表达的基因共3383个。对这些基因进行GO和KEGG富集分析发现,它们主要参与到盐胁迫响应、氧化应激、细胞防御等生物过程中,涉及植物激素信号传导、谷胱甘肽代谢、糖酵解等多种代谢途径。对盐胁迫下所有上调表达的关键基因进行共表达网络关联分析发现,脱落酸信号传导途径核心组分与抗氧化胁迫和能量代谢途径中的相关基因之间存在显著相关性,经RT-qPCR验证,4个激素信号途径相关基因、6个能量代谢相关基因及2个抗氧化相关基因随盐胁迫处理时间的增加,其表达量的动态变化呈逐渐上升趋势且与RNA-seq分析结果一致。该结果暗示ABA信号传导途径可能在菜豆盐胁迫响应调控网络中发挥重要作用。本研究为菜豆耐盐分子机制的研究提供参考依据。
关键词
菜豆
盐胁迫
转录组分析
差异表达基因
Keywords
common bean
salt stress
transcriptome analysis
differentially expressed genes(DEGs)
分类号
S643.1 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
菜豆响应盐胁迫的转录组分析
于思佳
于太飞
孙现军
王世佳
武书羽
姜雪敏
胡正
常玉洁
武晶
陈锐
张辉
姜奇彦
《植物遗传资源学报》
北大核心
2025
0
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