为了获得p53突变体的稳定剂,依次利用利宾斯基五原则,通过2次分子对接和全原子分子动力学(MD)模拟从Drug Bank 4.0数据库中筛选获得了潜在的稳定剂他克林.利用MD模拟进一步验证他克林和目标蛋白质之间的亲和作用.结果表明,他克林能够紧...为了获得p53突变体的稳定剂,依次利用利宾斯基五原则,通过2次分子对接和全原子分子动力学(MD)模拟从Drug Bank 4.0数据库中筛选获得了潜在的稳定剂他克林.利用MD模拟进一步验证他克林和目标蛋白质之间的亲和作用.结果表明,他克林能够紧密结合到Y220C突变所形成的疏水空腔之中;他克林和目标蛋白质之间的主要作用力为疏水和静电相互作用,其中疏水相互作用占主导地位.此外,他克林分别与目标蛋白质的残基Leu145,Val147和Asp228形成3个氢键.基于MD模拟轨迹分析了他克林与p53CY220C的结合过程.由硫黄素T荧光光谱进一步证明他克林能够提高p53C-Y220C突变体的稳定性.展开更多
文摘为了获得p53突变体的稳定剂,依次利用利宾斯基五原则,通过2次分子对接和全原子分子动力学(MD)模拟从Drug Bank 4.0数据库中筛选获得了潜在的稳定剂他克林.利用MD模拟进一步验证他克林和目标蛋白质之间的亲和作用.结果表明,他克林能够紧密结合到Y220C突变所形成的疏水空腔之中;他克林和目标蛋白质之间的主要作用力为疏水和静电相互作用,其中疏水相互作用占主导地位.此外,他克林分别与目标蛋白质的残基Leu145,Val147和Asp228形成3个氢键.基于MD模拟轨迹分析了他克林与p53CY220C的结合过程.由硫黄素T荧光光谱进一步证明他克林能够提高p53C-Y220C突变体的稳定性.
