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小麦TaWRKY71a基因克隆、生物信息学及表达分析
被引量：
11
1
作者
王俊斌
杨文丽
+3 位作者
丁博
吴天文
王海凤
谢晓东
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2018年第3期7-13,共7页
WRKY蛋白是主要存在于植物体内一类转录因子家族,在植物的生长发育和逆境应答中发挥重要作用。为了揭示小麦WRKY基因功能,从普通小麦中克隆出Ta WRKY71a基因后进行氨基酸序列分析,并对Ta WRKY71a基因在不同组织及不同胁迫条件下的表达...
WRKY蛋白是主要存在于植物体内一类转录因子家族,在植物的生长发育和逆境应答中发挥重要作用。为了揭示小麦WRKY基因功能,从普通小麦中克隆出Ta WRKY71a基因后进行氨基酸序列分析,并对Ta WRKY71a基因在不同组织及不同胁迫条件下的表达模式进行分析。结果表明,Ta WRKY71a基因编码一个含有355个氨基酸的蛋白质。氨基酸序列分析显示,Ta WRKY71a蛋白含有1个WRKY结构域及1个C2H2锌指结构。预测分析表明,Ta WRKY71a蛋白定位在细胞核;其二级结构包含28.17%的α-螺旋、16.34%的延伸链、4.79%的β-转角和50.70%的无规则卷曲。不同物种间WRKY蛋白的同源性分析比较表明,Ta WRKY71a与粗山羊草WRKY71、水稻WRKY71、高粱WRKY71和拟南芥WRKY40的氨基酸序列之间具有高度的保守性。q RT-PCR分析表明,Ta WRKY71a在叶、根、茎、花和种子中均有不同程度表达,并受ABA、Na Cl和PEG诱导表达,推测该基因可能参与小麦逆境胁迫应答。研究结果为进一步研究Ta WRKY71a的生物学功能奠定了基础。
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关键词
小麦
TaWRKY71a基因
克隆
基因表达
生物信息学
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职称材料
小麦磷脂酶Dα的基因克隆及其编码序列的生物信息学分析
被引量：
4
2
作者
王俊斌
李明
+3 位作者
丁博
包曙光
王锐
谢晓东
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2013年第1期117-122,共6页
为获得更多小麦抗逆基因资源,利用RT-PCR方法克隆了磷脂酶D基因(PLD),命名为TaPLDα,并对基因及其蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,TaPLDα开放阅读框为2 394 bp,编码812个氨基酸残基,等电点5.30,分子量为92 kDa。序列分析显示,TaPL...
为获得更多小麦抗逆基因资源,利用RT-PCR方法克隆了磷脂酶D基因(PLD),命名为TaPLDα,并对基因及其蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,TaPLDα开放阅读框为2 394 bp,编码812个氨基酸残基,等电点5.30,分子量为92 kDa。序列分析显示,TaPLDα基因编码的氨基酸序列含有N端C2结构域及2个保守的活性中心。预测TaPLDα蛋白是一个亲水性稳定蛋白且定位于细胞质,其二级结构含28.82%的α-螺旋、20.07%的延伸链、6.03%的β-转角和45.07%的不规则卷曲。该蛋白不存在信号肽,无跨膜区。TaPLDα与水稻、玉米和拟南芥的PLDα氨基酸序列之间具有高度的保守性,进化分析显示,小麦PLDα序列与毒麦、水稻和玉米PLD序列亲缘关系密切。
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关键词
小麦
磷脂酶Dα
基因克隆
生物信息学
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职称材料
题名
小麦TaWRKY71a基因克隆、生物信息学及表达分析
被引量：
11
1
作者
王俊斌
杨文丽
丁博
吴天文
王海凤
谢晓东
机构
天津农学院天津-布里斯托环境变化对农作物影响研究中心
天津农学院
基础科学
学院
天津农学院
农业分析测试
中心
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2018年第3期7-13,共7页
基金
天津市应用基础与前沿技术研究计划项目(14JCYBJC30600)
国家自然科学基金项目(31671611)
文摘
WRKY蛋白是主要存在于植物体内一类转录因子家族,在植物的生长发育和逆境应答中发挥重要作用。为了揭示小麦WRKY基因功能,从普通小麦中克隆出Ta WRKY71a基因后进行氨基酸序列分析,并对Ta WRKY71a基因在不同组织及不同胁迫条件下的表达模式进行分析。结果表明,Ta WRKY71a基因编码一个含有355个氨基酸的蛋白质。氨基酸序列分析显示,Ta WRKY71a蛋白含有1个WRKY结构域及1个C2H2锌指结构。预测分析表明,Ta WRKY71a蛋白定位在细胞核;其二级结构包含28.17%的α-螺旋、16.34%的延伸链、4.79%的β-转角和50.70%的无规则卷曲。不同物种间WRKY蛋白的同源性分析比较表明,Ta WRKY71a与粗山羊草WRKY71、水稻WRKY71、高粱WRKY71和拟南芥WRKY40的氨基酸序列之间具有高度的保守性。q RT-PCR分析表明,Ta WRKY71a在叶、根、茎、花和种子中均有不同程度表达,并受ABA、Na Cl和PEG诱导表达,推测该基因可能参与小麦逆境胁迫应答。研究结果为进一步研究Ta WRKY71a的生物学功能奠定了基础。
关键词
小麦
TaWRKY71a基因
克隆
基因表达
生物信息学
Keywords
Wheat
TaWRKY71a gene；Cloning；Gene expression；Bioinformatics
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
S512.03 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
小麦磷脂酶Dα的基因克隆及其编码序列的生物信息学分析
被引量：
4
2
作者
王俊斌
李明
丁博
包曙光
王锐
谢晓东
机构
天津农学院天津-布里斯托环境变化对农作物影响研究中心
天津农学院
基础科学系
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2013年第1期117-122,共6页
基金
国家"863"计划项目(2011AA100104)
天津市应用基础与前沿技术研究计划项目(11JCYBJC09100)
国家转基因新品种培育重大专项(2009ZX08009-084B)
文摘
为获得更多小麦抗逆基因资源,利用RT-PCR方法克隆了磷脂酶D基因(PLD),命名为TaPLDα,并对基因及其蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,TaPLDα开放阅读框为2 394 bp,编码812个氨基酸残基,等电点5.30,分子量为92 kDa。序列分析显示,TaPLDα基因编码的氨基酸序列含有N端C2结构域及2个保守的活性中心。预测TaPLDα蛋白是一个亲水性稳定蛋白且定位于细胞质,其二级结构含28.82%的α-螺旋、20.07%的延伸链、6.03%的β-转角和45.07%的不规则卷曲。该蛋白不存在信号肽,无跨膜区。TaPLDα与水稻、玉米和拟南芥的PLDα氨基酸序列之间具有高度的保守性,进化分析显示,小麦PLDα序列与毒麦、水稻和玉米PLD序列亲缘关系密切。
关键词
小麦
磷脂酶Dα
基因克隆
生物信息学
Keywords
Wheat
Phospholipase Dα
Gene cloning
Bioinformatics
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦TaWRKY71a基因克隆、生物信息学及表达分析
王俊斌
杨文丽
丁博
吴天文
王海凤
谢晓东
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2018
11
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
小麦磷脂酶Dα的基因克隆及其编码序列的生物信息学分析
王俊斌
李明
丁博
包曙光
王锐
谢晓东
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2013
4
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职称材料
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