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题名野大麦肌动蛋白基因片段的克隆及其表达特征分析
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作者
袁惠君
关玉晨
王春梅
冯欢
张欢欢
袁毅君
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机构
兰州理工大学生命科学与工程学院
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
天水师范学院生物工程与生物技术学院
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出处
《中国草食动物科学》
CAS
北大核心
2024年第4期30-38,共9页
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基金
甘肃省自然科学基金项目(22JR5RA040)
国家自然科学基金项目(32060390)。
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文摘
野大麦(Hordeum brevisubulatum)是重要的野生禾本科牧草,具有多种抗逆性。为深入挖掘野大麦的抗逆基因,本研究以RT-PCR法克隆了野大麦肌动蛋白基因(Actin,ACT)的核心片段。采用BLAST序列比对,qRT-PCR实时定量方法对其序列特征和表达特性进行了分析。结果表明,野大麦ACT的基因片段长518 bp,编码171个氨基酸。BLAST分析表明,野大麦的肌动蛋白基因片段与大麦(Hordeum vulgare)ACT基因核苷酸序列的一致性达97%,与ACT蛋白氨基酸序列的同源性达91%,并将其命名为HbACT。与11种相关植物进行ACT氨基酸序列比对发现,HbACT含152个保守氨基酸和19个非保守氨基酸,说明HbACT蛋白具有高度保守性。qRT-PCR分析表明,在不同盐浓度处理条件下,不同处理时间野大麦各器官的HbACT的Ct平均值为19.30,地上部的变异系数为3.5,峰度系数为0.262;地下部的变异系数为5.3,峰度系数为0.409,均属于尖峰分布,Ct值的稳定系数均小于1.7。综上所述,HbACT基因表达稳定,可作为内参基因用于研究野大麦功能基因的表达模式分析。
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关键词
野大麦
肌动蛋白基因
克隆
表达模式分析
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Keywords
Hordeum brevisubulatum
ACT gene
cloning
expression pattern analysis
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分类号
S54
[农业科学—作物学]
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