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基于16S rDNA对滑顶薄壳鸟蛤和加州扁鸟蛤的分类地位研究
1
作者
解耀宇
贾梦豪
+1 位作者
才林暄
田莹
《黑龙江水产》
2025年第2期122-127,共6页
该研究测定了滑顶薄壳鸟蛤(Fulvia mutica)和加州扁鸟蛤(Clinocardium californiense)各形态性状和重量性状(壳长、壳宽、壳高、湿重及软体部重),研究了二者各数量性状间的关系。通过PCR扩增技术获得两者的16S rDNA基因序列,并从NCBI上...
该研究测定了滑顶薄壳鸟蛤(Fulvia mutica)和加州扁鸟蛤(Clinocardium californiense)各形态性状和重量性状(壳长、壳宽、壳高、湿重及软体部重),研究了二者各数量性状间的关系。通过PCR扩增技术获得两者的16S rDNA基因序列,并从NCBI上获得的其他17种鸟尾蛤科(Cardiidae)的16S rDNA序列,使用MEGA 7.0采用NJ邻接法对这19种鸟蛤构建系统进化树。结果表明,加州扁鸟蛤的各数量性状(壳宽、壳长、壳高、湿重和软体部重)均低于滑顶薄壳鸟蛤,出肉率也低于滑顶薄壳鸟蛤。加州扁鸟蛤和滑顶薄壳鸟蛤的16S片段长度相近,分别为482 bp和490 bp,各碱基组成的百分比近似,加州扁鸟蛤的碱基A占29.05%、碱基T占28.84%、碱基C占15.56%、碱基G占26.57%,滑顶薄壳鸟蛤的碱基A占29.80%、碱基T占29.80%、碱基C占15.31%、碱基G占25.10%;基于16S序列系统发育树发现,加州扁鸟蛤与滑顶薄壳鸟蛤亲缘关系较远,其中加州扁鸟蛤与大篮鸟蛤(Clinocardium nuttallii)和方舟尾鸟蛤亲(Laevicardium oblongum)缘关系较近;滑顶薄壳鸟蛤与薄壳鸟蛤(Fulvia aperta)、澳洲薄壳鸟蛤(Fulvia australis)、波纹薄壳鸟蛤(Fulvia undatopicta)等关系更近。
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关键词
滑顶薄壳鸟蛤(Fulvia
mutica)
加州扁鸟蛤(Clinocardium
californiense)
形态测量
16S基因
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职称材料
角蝾螺体尺性状对体质量性状的影响效果分析
2
作者
贾梦豪
才林暄
+1 位作者
田莹
郝振林
《黑龙江水产》
2025年第2期128-135,共8页
为研究角蝾螺(Turbo cornutus)体尺性状对体质量性状的影响,随机选取相同年龄的113只角蝾螺,测量其体尺形状与质量性状,利用描述性统计、相关性分析、通径分析和多元回归分析,探究其表现型的6个性状对其体质量性状的影响。结果表明:性...
为研究角蝾螺(Turbo cornutus)体尺性状对体质量性状的影响,随机选取相同年龄的113只角蝾螺,测量其体尺形状与质量性状,利用描述性统计、相关性分析、通径分析和多元回归分析,探究其表现型的6个性状对其体质量性状的影响。结果表明:性状之间的相关性均为极显著正相关(P<0.01),其中壳高和壳重之间的相关系数最高为0.945。通径分析结果显示,影响角蝾螺湿重的主要因素为壳高,影响角蝾螺软体部重的主要因素是壳长和壳口宽,通径系数分别为0.769、0.506、0.428。对角蝾螺湿重和软体部重间接作用最大的均为壳口宽,总间接通径系数分别为1.324、1.142,对壳重间接作用最大的是壳长,总间接通径系数为1.128。利用逐步回归分析,建立3个体质量性状的最优回归方程,回归系数均达到了极显著水平(P<0.01)。该研究结果可以为角蝾螺的育种工作提供参考。
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关键词
角蝾螺(Turbo
cornutus)
体尺性状
通径分析
体质量
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职称材料
不同水深养殖栉孔扇贝的形态测量学研究和比较
被引量:
10
3
作者
舒予
史令
+2 位作者
赖思琦
田莹
常亚青
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期132-139,共8页
为了探究远岸深水海区和近岸浅水海区养殖的栉孔扇贝(Chlamys farreri)形态上的差异,运用传统形态测量学和几何形态测量学的方法,对来自近岸浅水海区(15 m水深)和远岸深水海区(30 m水深)底栖养殖的2龄栉孔扇贝进行形态测量学研究和比较...
为了探究远岸深水海区和近岸浅水海区养殖的栉孔扇贝(Chlamys farreri)形态上的差异,运用传统形态测量学和几何形态测量学的方法,对来自近岸浅水海区(15 m水深)和远岸深水海区(30 m水深)底栖养殖的2龄栉孔扇贝进行形态测量学研究和比较分析。结果表明:深水养殖的栉孔扇贝的壳高(SH)、壳长(SL)和壳宽(SW)都极显著大于浅水养殖的栉孔扇贝(P<0.01);通过界标点(Landmarks)和半界标点(Semi-landmarks)的方法,及广义普鲁克分析(GPA)、主成分分析(PCA)和典型变量分析(CVA),结果表明深水养殖的栉孔扇贝的整体壳形尺寸大于浅水养殖的栉孔扇贝,除去尺寸大小因素后两者的壳耳和壳体扇形边缘存在显著差异。文章为栉孔扇贝深水养殖的选育和增养殖工作提供基于形态学研究的理论依据,同时比较分析了传统形态测量学和几何形态测量学的原理和分析方法,为研究生物体形态差异时选择合适的研究方法提供新参考。
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关键词
栉孔扇贝
深水养殖
多变量形态测量学
几何形态测量学
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职称材料
几何形态学对8种扇贝的形态分类的应用
被引量:
1
4
作者
舒予
史令
+4 位作者
郝振林
毛俊霞
王许波
田莹
常亚青
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期61-69,共9页
几何形态学(morphometrics)是基于笛卡尔地标点的统计分析方法,主要运用广义普鲁克分析(GPA)、薄板样条分析(TPS)、主成分分析(PCA)、典型变量分析(CVA)等方法,定量的对形态变化进行识别,结果更为客观。本研究运用几何形态学方法对8种...
几何形态学(morphometrics)是基于笛卡尔地标点的统计分析方法,主要运用广义普鲁克分析(GPA)、薄板样条分析(TPS)、主成分分析(PCA)、典型变量分析(CVA)等方法,定量的对形态变化进行识别,结果更为客观。本研究运用几何形态学方法对8种常见扇贝(栉孔扇贝Azumapecten farreri、虾夷盘扇贝Mizuhopecten yessoensis、海湾扇贝Argopecten irradians、平濑掌扇贝Volachlamys hirasei、北海道扇贝Swiftopecten swiftii、荣套扇贝Gloripallium pallium、华贵类栉孔扇贝Mimachlamys nobilis、美丽环扇贝Annachlamys striatula)间形态关系进行研究,运用界标点和半界标点对扇贝的壳盘和壳耳进行数字化标点,利用PCA、CVA、TPS方法,获得8种扇贝的形态差异并进一步分析,建立系统发育树。PCA和CVA分析结果表明可以通过几何形态测量学分析方法将8种扇贝基于形态差异进行有效区分。此外,结合TPS的分析结果,发现壳耳和壳盘在扇贝中具有种间规律性差异。通过其形态分异进行表型聚类,从结果可知:美丽环扇贝、虾夷盘扇贝和海湾扇贝距离较近,壳型有共同的特征:扇贝壳盘较椭圆,壳耳相对较小;荣套扇贝和华贵类栉孔扇贝距离较近,壳型有共同的特征:扇贝壳盘更扁平,前耳相对较大;北海道扇贝、平濑掌扇贝和栉孔扇贝与其他种类没有交集。在聚类过程中,华贵类栉孔扇贝和荣套扇贝有交集,10个标本混淆,其他标本均成功聚类,正确率为95.5%。
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关键词
几何形态测量学(morphometrics)
扇贝科
形态分类
系统发育
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职称材料
珠海长肋日月贝形态性状对体质量的影响
被引量:
1
5
作者
郭岳鹏
宋坚
+3 位作者
李雯佳
郝振林
田莹
常亚青
《水产养殖》
CAS
2022年第8期13-18,共6页
2021年5月于珠海采集34枚野生长肋日月贝(Amusium pleuronectes),测定其壳长、壳宽、壳高、湿质量、软体部质量、壳质量、闭壳肌质量和性腺质量,利用相关性分析、通径分析以及多元回归分析,探究其表型3个形态性状对体质量的影响。在此...
2021年5月于珠海采集34枚野生长肋日月贝(Amusium pleuronectes),测定其壳长、壳宽、壳高、湿质量、软体部质量、壳质量、闭壳肌质量和性腺质量,利用相关性分析、通径分析以及多元回归分析,探究其表型3个形态性状对体质量的影响。在此基础上,将结果与已发表的广西北海、海南儋州、陵水、三亚以及琼海5个群体的长肋日月贝的参数进行对比。结果表明:珠海湾长肋日月贝除性腺质量外,湿质量、软体部质量、闭壳肌质量以及壳质量的复相关系数分别为0.956,0.945,0.856和0.878,均大于0.85,说明选取的3个形态性状(壳长、壳宽、壳高)是影响体质量的主要性状。逐步回归分析结果显示,对珠海长肋日月贝质量有影响的主要性状是壳长和壳宽,其中壳长直接影响性腺质量,与广西北海群体结果一致,壳宽影响湿质量、软体部质量、闭壳肌质量、壳质量,与其他群体结果不同。提出,珠海长肋日月贝以体质量为选育目标进行良种选育时,应关注壳宽,同时加强对壳长的协同选择,进而提高育种效率。
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关键词
珠海
长肋日月贝
形态性状
体质量
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职称材料
题名
基于16S rDNA对滑顶薄壳鸟蛤和加州扁鸟蛤的分类地位研究
1
作者
解耀宇
贾梦豪
才林暄
田莹
机构
大连
海洋大学
大连贝壳博物馆贝类研究所
出处
《黑龙江水产》
2025年第2期122-127,共6页
基金
辽宁省科技重大专项2025北方海洋经济动物种质创新与应用。
文摘
该研究测定了滑顶薄壳鸟蛤(Fulvia mutica)和加州扁鸟蛤(Clinocardium californiense)各形态性状和重量性状(壳长、壳宽、壳高、湿重及软体部重),研究了二者各数量性状间的关系。通过PCR扩增技术获得两者的16S rDNA基因序列,并从NCBI上获得的其他17种鸟尾蛤科(Cardiidae)的16S rDNA序列,使用MEGA 7.0采用NJ邻接法对这19种鸟蛤构建系统进化树。结果表明,加州扁鸟蛤的各数量性状(壳宽、壳长、壳高、湿重和软体部重)均低于滑顶薄壳鸟蛤,出肉率也低于滑顶薄壳鸟蛤。加州扁鸟蛤和滑顶薄壳鸟蛤的16S片段长度相近,分别为482 bp和490 bp,各碱基组成的百分比近似,加州扁鸟蛤的碱基A占29.05%、碱基T占28.84%、碱基C占15.56%、碱基G占26.57%,滑顶薄壳鸟蛤的碱基A占29.80%、碱基T占29.80%、碱基C占15.31%、碱基G占25.10%;基于16S序列系统发育树发现,加州扁鸟蛤与滑顶薄壳鸟蛤亲缘关系较远,其中加州扁鸟蛤与大篮鸟蛤(Clinocardium nuttallii)和方舟尾鸟蛤亲(Laevicardium oblongum)缘关系较近;滑顶薄壳鸟蛤与薄壳鸟蛤(Fulvia aperta)、澳洲薄壳鸟蛤(Fulvia australis)、波纹薄壳鸟蛤(Fulvia undatopicta)等关系更近。
关键词
滑顶薄壳鸟蛤(Fulvia
mutica)
加州扁鸟蛤(Clinocardium
californiense)
形态测量
16S基因
Keywords
Fulvia mutica
Clinocardium californiense
morphometry
16S rDNA gene
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
角蝾螺体尺性状对体质量性状的影响效果分析
2
作者
贾梦豪
才林暄
田莹
郝振林
机构
大连
海洋大学
大连贝壳博物馆贝类研究所
出处
《黑龙江水产》
2025年第2期128-135,共8页
基金
国家重点研发计划项目(2021YFB2600200)。
文摘
为研究角蝾螺(Turbo cornutus)体尺性状对体质量性状的影响,随机选取相同年龄的113只角蝾螺,测量其体尺形状与质量性状,利用描述性统计、相关性分析、通径分析和多元回归分析,探究其表现型的6个性状对其体质量性状的影响。结果表明:性状之间的相关性均为极显著正相关(P<0.01),其中壳高和壳重之间的相关系数最高为0.945。通径分析结果显示,影响角蝾螺湿重的主要因素为壳高,影响角蝾螺软体部重的主要因素是壳长和壳口宽,通径系数分别为0.769、0.506、0.428。对角蝾螺湿重和软体部重间接作用最大的均为壳口宽,总间接通径系数分别为1.324、1.142,对壳重间接作用最大的是壳长,总间接通径系数为1.128。利用逐步回归分析,建立3个体质量性状的最优回归方程,回归系数均达到了极显著水平(P<0.01)。该研究结果可以为角蝾螺的育种工作提供参考。
关键词
角蝾螺(Turbo
cornutus)
体尺性状
通径分析
体质量
Keywords
Turbo cornutus
morphological traits
path analysis
body mass
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
不同水深养殖栉孔扇贝的形态测量学研究和比较
被引量:
10
3
作者
舒予
史令
赖思琦
田莹
常亚青
机构
大连
海洋大学农业农村部北方海水增养殖重点实验室
大连贝壳博物馆贝类研究所
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期132-139,共8页
基金
大连市创新基金(2018J11CY029)
中国科学院战略性先导科技专项(B类)(XDB26000000)
国家自然科学基金(42076101)资助。
文摘
为了探究远岸深水海区和近岸浅水海区养殖的栉孔扇贝(Chlamys farreri)形态上的差异,运用传统形态测量学和几何形态测量学的方法,对来自近岸浅水海区(15 m水深)和远岸深水海区(30 m水深)底栖养殖的2龄栉孔扇贝进行形态测量学研究和比较分析。结果表明:深水养殖的栉孔扇贝的壳高(SH)、壳长(SL)和壳宽(SW)都极显著大于浅水养殖的栉孔扇贝(P<0.01);通过界标点(Landmarks)和半界标点(Semi-landmarks)的方法,及广义普鲁克分析(GPA)、主成分分析(PCA)和典型变量分析(CVA),结果表明深水养殖的栉孔扇贝的整体壳形尺寸大于浅水养殖的栉孔扇贝,除去尺寸大小因素后两者的壳耳和壳体扇形边缘存在显著差异。文章为栉孔扇贝深水养殖的选育和增养殖工作提供基于形态学研究的理论依据,同时比较分析了传统形态测量学和几何形态测量学的原理和分析方法,为研究生物体形态差异时选择合适的研究方法提供新参考。
关键词
栉孔扇贝
深水养殖
多变量形态测量学
几何形态测量学
Keywords
Chlamys farreri
Deep-water aquaculture
Multivariate morphometry
Geometrical morphology
分类号
Q174 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
几何形态学对8种扇贝的形态分类的应用
被引量:
1
4
作者
舒予
史令
郝振林
毛俊霞
王许波
田莹
常亚青
机构
大连
海洋大学农业农村部北方海水增养殖重点实验室
大连贝壳博物馆贝类研究所
柏林自由大学
出处
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期61-69,共9页
基金
国家重点研发计划(SQ2021YFB2600031)
大连市“揭榜挂帅”项目(2021JB11SN035)
国家自然科学基金(31702342)。
文摘
几何形态学(morphometrics)是基于笛卡尔地标点的统计分析方法,主要运用广义普鲁克分析(GPA)、薄板样条分析(TPS)、主成分分析(PCA)、典型变量分析(CVA)等方法,定量的对形态变化进行识别,结果更为客观。本研究运用几何形态学方法对8种常见扇贝(栉孔扇贝Azumapecten farreri、虾夷盘扇贝Mizuhopecten yessoensis、海湾扇贝Argopecten irradians、平濑掌扇贝Volachlamys hirasei、北海道扇贝Swiftopecten swiftii、荣套扇贝Gloripallium pallium、华贵类栉孔扇贝Mimachlamys nobilis、美丽环扇贝Annachlamys striatula)间形态关系进行研究,运用界标点和半界标点对扇贝的壳盘和壳耳进行数字化标点,利用PCA、CVA、TPS方法,获得8种扇贝的形态差异并进一步分析,建立系统发育树。PCA和CVA分析结果表明可以通过几何形态测量学分析方法将8种扇贝基于形态差异进行有效区分。此外,结合TPS的分析结果,发现壳耳和壳盘在扇贝中具有种间规律性差异。通过其形态分异进行表型聚类,从结果可知:美丽环扇贝、虾夷盘扇贝和海湾扇贝距离较近,壳型有共同的特征:扇贝壳盘较椭圆,壳耳相对较小;荣套扇贝和华贵类栉孔扇贝距离较近,壳型有共同的特征:扇贝壳盘更扁平,前耳相对较大;北海道扇贝、平濑掌扇贝和栉孔扇贝与其他种类没有交集。在聚类过程中,华贵类栉孔扇贝和荣套扇贝有交集,10个标本混淆,其他标本均成功聚类,正确率为95.5%。
关键词
几何形态测量学(morphometrics)
扇贝科
形态分类
系统发育
Keywords
geometrical morphology
Pectinidae
morphological taxonomy
phylogeny
分类号
Q954.1 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
珠海长肋日月贝形态性状对体质量的影响
被引量:
1
5
作者
郭岳鹏
宋坚
李雯佳
郝振林
田莹
常亚青
机构
大连
海洋大学农业农村部北方海水增养殖重点实验室
大连贝壳博物馆贝类研究所
出处
《水产养殖》
CAS
2022年第8期13-18,共6页
基金
国家重点研发计划(SQ2021YFB2600031)
大连市揭榜挂帅项目(2021JB11SN035)
大学生创新创业训练计划项目(A202110158005)。
文摘
2021年5月于珠海采集34枚野生长肋日月贝(Amusium pleuronectes),测定其壳长、壳宽、壳高、湿质量、软体部质量、壳质量、闭壳肌质量和性腺质量,利用相关性分析、通径分析以及多元回归分析,探究其表型3个形态性状对体质量的影响。在此基础上,将结果与已发表的广西北海、海南儋州、陵水、三亚以及琼海5个群体的长肋日月贝的参数进行对比。结果表明:珠海湾长肋日月贝除性腺质量外,湿质量、软体部质量、闭壳肌质量以及壳质量的复相关系数分别为0.956,0.945,0.856和0.878,均大于0.85,说明选取的3个形态性状(壳长、壳宽、壳高)是影响体质量的主要性状。逐步回归分析结果显示,对珠海长肋日月贝质量有影响的主要性状是壳长和壳宽,其中壳长直接影响性腺质量,与广西北海群体结果一致,壳宽影响湿质量、软体部质量、闭壳肌质量、壳质量,与其他群体结果不同。提出,珠海长肋日月贝以体质量为选育目标进行良种选育时,应关注壳宽,同时加强对壳长的协同选择,进而提高育种效率。
关键词
珠海
长肋日月贝
形态性状
体质量
Keywords
Zhuhai
Amusium pleuronectes
Morphological traits
Body mass
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于16S rDNA对滑顶薄壳鸟蛤和加州扁鸟蛤的分类地位研究
解耀宇
贾梦豪
才林暄
田莹
《黑龙江水产》
2025
0
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职称材料
2
角蝾螺体尺性状对体质量性状的影响效果分析
贾梦豪
才林暄
田莹
郝振林
《黑龙江水产》
2025
0
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职称材料
3
不同水深养殖栉孔扇贝的形态测量学研究和比较
舒予
史令
赖思琦
田莹
常亚青
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
10
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职称材料
4
几何形态学对8种扇贝的形态分类的应用
舒予
史令
郝振林
毛俊霞
王许波
田莹
常亚青
《海洋科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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职称材料
5
珠海长肋日月贝形态性状对体质量的影响
郭岳鹏
宋坚
李雯佳
郝振林
田莹
常亚青
《水产养殖》
CAS
2022
1
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