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基于全蛋白质组的微生物系统发育树构建 被引量:1
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作者 张文 唐焕文 +2 位作者 方伟武 蔡旭 张伟伟 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期925-930,共6页
新近出现的信息离散性度量方法(简称FDOD方法)已在多个领域获得成功的应用,是一种非比对距离方法.随着越来越多的微生物全基因组测序任务的完成,人们开始在整个基因组水平上探讨物种的系统发育关系.因此,将FDOD方法应用于微生物系统发... 新近出现的信息离散性度量方法(简称FDOD方法)已在多个领域获得成功的应用,是一种非比对距离方法.随着越来越多的微生物全基因组测序任务的完成,人们开始在整个基因组水平上探讨物种的系统发育关系.因此,将FDOD方法应用于微生物系统发育分析是一项很有意义的工作.因为氨基酸序列比DNA序列更为保守,能为物种的进化分析提供更为有用的信息.对收集到的163个原核生物和5个真核生物,从完全蛋白质组出发去分析推断其系统的发育关系,所得的系统发育树包括145个细菌、18个古细菌和5个真核细菌,这与三界进化理论符合,大部分低层分支与权威的《伯杰氏系统细菌学手册》相同.并且对高层分支关系提出了一些新建议. 展开更多
关键词 微生物 原核生物 古细菌 系统发育 信息离散性度量
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fMRI信号盲分离的一种独立成分分析算法 被引量:6
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作者 潘丽丽 史振威 +2 位作者 唐焕文 唐一源 张伟伟 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第4期607-611,共5页
建立了独立成分分析(independentcomponentanalysis,ICA)的一个优化模型,在此基础上,给出了一个新的梯度算法,称之为Orth-ExtBS算法.该算法结合了ExtBS算法和FastICA算法,兼顾两者的优点,形式简单,易于应用,能有效地盲分离具有超高斯和... 建立了独立成分分析(independentcomponentanalysis,ICA)的一个优化模型,在此基础上,给出了一个新的梯度算法,称之为Orth-ExtBS算法.该算法结合了ExtBS算法和FastICA算法,兼顾两者的优点,形式简单,易于应用,能有效地盲分离具有超高斯和亚高斯分布源的混合信号,获得更准确的分离效果和较快的收敛速度.将新的算法与其他两个算法(FastICA和ExtBS)分别应用到大型fMRI数据中,通过比较发现,新算法在估计激活的时间动力学准确性上要优于其他两个算法. 展开更多
关键词 独立成分分析 盲源分离 梯度算法 功能磁共振成像
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新的ICA算法实现成组fMRI信号盲分离 被引量:4
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作者 唐焕文 张伟伟 +2 位作者 史振威 潘丽丽 唐一源 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第5期773-776,共4页
独立成分分析(ICA)方法已被成功地用于处理功能磁共振成像(fMRI)信号,但主要是用于处理单个被试的fMRI信号,对于多个被试的情况却很少考虑.为此利用一种扩展的ICA方法——Group ICA来处理多个被试的fMRI信号,结果表明这种方法在保证结... 独立成分分析(ICA)方法已被成功地用于处理功能磁共振成像(fMRI)信号,但主要是用于处理单个被试的fMRI信号,对于多个被试的情况却很少考虑.为此利用一种扩展的ICA方法——Group ICA来处理多个被试的fMRI信号,结果表明这种方法在保证结果准确性的前提下,可以大大减少计算量,快速获得统计结果.计算中应用的是NewFP算法,统计结果表明这种算法在估计激活的时间动力学准确性上优于FastICA算法. 展开更多
关键词 独立成分分析 盲源分离 功能磁共振成像
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利用独立成分分析实现成组的fMRI信号的盲分离 被引量:4
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作者 张伟伟 史振威 +2 位作者 阎芬 唐焕文 唐一源 《中国医学影像技术》 CSCD 北大核心 2005年第3期333-335,共3页
独立成分分析(ICA)作为盲源分离的一种有效方法已经被成功的用于处理功能磁共振成像(fMRI)数据,但是通常人们只是考虑处理单个被试的数据,对于多个被试的情况却很少有人考虑,本文中分析了目前国际上比较流行的三种用 ICA来处理多个被试... 独立成分分析(ICA)作为盲源分离的一种有效方法已经被成功的用于处理功能磁共振成像(fMRI)数据,但是通常人们只是考虑处理单个被试的数据,对于多个被试的情况却很少有人考虑,本文中分析了目前国际上比较流行的三种用 ICA来处理多个被试的 fMRI数据的方法,并且利用其中最好的一种方法对我们实验中获得的 fMRI数据进行处理,结果表明这种方法可以快速有效地处理多个被试的 fMRI数据。 展开更多
关键词 盲源分离 独立成分分析 功能磁共振成像
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一种新的结构正割法在时间序列图像配准中应用 被引量:2
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作者 孙少燕 唐焕文 唐一源 《大连理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第2期301-304,共4页
脑功能成像是进行神经科学研究的一项重要技术.在脑功能图像的数据分析中,时间序列图像的配准精度是对脑功能图像进行统计分析成功与否的关键.针对一种典型的非线性最小二乘形式的配准测度,引进一种新的结构正割法来计算其极小值.该方... 脑功能成像是进行神经科学研究的一项重要技术.在脑功能图像的数据分析中,时间序列图像的配准精度是对脑功能图像进行统计分析成功与否的关键.针对一种典型的非线性最小二乘形式的配准测度,引进一种新的结构正割法来计算其极小值.该方法给出了目标函数海森阵二阶信息项的一种新的较佳近似,而并非像高斯-牛顿法那样将其直接舍去,从而提高了计算精度;并且在近似的过程中,校正矩阵始终保持对称正定,所以在搜索下降方向的时候,总会找到一个解.模拟计算结果表明该方法配准精度高,计算时间较短,可以较好地解决图像配准问题. 展开更多
关键词 图像配准 测度 结构正割法 拟牛顿方程 BFGS校正 FMRI
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