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盐藻新基因DsSTPK的克隆及生物信息学分析
被引量：
12
1
作者
薛飞
柴晓杰
+2 位作者
余祝君
张晓琳
张婷
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期289-295,共7页
采用RT-PCR和RACE技术克隆了杜氏盐藻DsSTPK的1种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因(GenBank accession No.JN625213),命名为DsSTPK,并对其进行了生物信息学分析.结果表明,盐藻DsSTPK基因的cDNA全长为3 129 bp,可阅读框为2 184 bp,编码727个氨...
采用RT-PCR和RACE技术克隆了杜氏盐藻DsSTPK的1种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因(GenBank accession No.JN625213),命名为DsSTPK,并对其进行了生物信息学分析.结果表明,盐藻DsSTPK基因的cDNA全长为3 129 bp,可阅读框为2 184 bp,编码727个氨基酸.该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜区域,为非跨膜蛋白,且定位于细胞质基质,二级结构的主要元件为无规卷曲和α螺旋,三维建模成功,在167～190位有1个蛋白激酶的ATP结合区、293～305位1个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区,存在多个潜在的磷酸化位点.进一步的进化分析表明,其与衣藻、团藻亲缘关系最近.这些研究结果为进一步阐明DsSTPK的功能及作用机制奠定了基础.
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关键词
杜氏盐藻
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶
全长CDNA
生物信息学分析
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职称材料
盐藻蛋白质组的研究进展
被引量：
1
2
作者
张永攀
柴晓杰
+1 位作者
王晓庆
徐文琦
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期17-20,30,共5页
盐藻是一种公认的能耐受高盐度的海藻,是研究植物高盐适应的模式生物。高通量的蛋白质组学为人们深入探讨盐藻的耐盐机制提供了强有力的工具。就蛋白质组及其主要技术、盐藻蛋白质组的研究概况和研究展望作一简要综述。
关键词
蛋白质组学
盐藻
双向电泳
耐盐机制
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职称材料
题名
盐藻新基因DsSTPK的克隆及生物信息学分析
被引量：
12
1
作者
薛飞
柴晓杰
余祝君
张晓琳
张婷
机构
大连海洋大学海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期289-295,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.30972240)
辽宁省教育厅科学技术研究项目(No.2008T023)~~
文摘
采用RT-PCR和RACE技术克隆了杜氏盐藻DsSTPK的1种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因(GenBank accession No.JN625213),命名为DsSTPK,并对其进行了生物信息学分析.结果表明,盐藻DsSTPK基因的cDNA全长为3 129 bp,可阅读框为2 184 bp,编码727个氨基酸.该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜区域,为非跨膜蛋白,且定位于细胞质基质,二级结构的主要元件为无规卷曲和α螺旋,三维建模成功,在167～190位有1个蛋白激酶的ATP结合区、293～305位1个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区,存在多个潜在的磷酸化位点.进一步的进化分析表明,其与衣藻、团藻亲缘关系最近.这些研究结果为进一步阐明DsSTPK的功能及作用机制奠定了基础.
关键词
杜氏盐藻
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶
全长CDNA
生物信息学分析
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
盐藻蛋白质组的研究进展
被引量：
1
2
作者
张永攀
柴晓杰
王晓庆
徐文琦
机构
大连海洋大学海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期17-20,30,共5页
基金
国家自然科学基金项目(30972240)
文摘
盐藻是一种公认的能耐受高盐度的海藻,是研究植物高盐适应的模式生物。高通量的蛋白质组学为人们深入探讨盐藻的耐盐机制提供了强有力的工具。就蛋白质组及其主要技术、盐藻蛋白质组的研究概况和研究展望作一简要综述。
关键词
蛋白质组学
盐藻
双向电泳
耐盐机制
Keywords
Proteomics Dunaliella salina Two-dimensional electrophoresis Salt-tolerant mechanism
分类号
Q946.1 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
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1
盐藻新基因DsSTPK的克隆及生物信息学分析
薛飞
柴晓杰
余祝君
张晓琳
张婷
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
12
在线阅读
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职称材料
2
盐藻蛋白质组的研究进展
张永攀
柴晓杰
王晓庆
徐文琦
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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