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患红斑病中间球海胆肠道菌群结构和功能特征研究
1
作者 陈东升 王荦 +3 位作者 邢腾宇 陈宇辰 陈新垚 丁君 《南方水产科学》 北大核心 2025年第1期77-84,共8页
红斑病是海胆养殖过程中最常见的细菌性疾病之一,具有发病速度快、传染性强、致死率高等特点。为揭示机体患病和肠道菌群间的相关性,基于16S rRNA测序技术,开展了患红斑病中间球海胆(Strongylocentroyus intermedius)肠道菌群结构和功... 红斑病是海胆养殖过程中最常见的细菌性疾病之一,具有发病速度快、传染性强、致死率高等特点。为揭示机体患病和肠道菌群间的相关性,基于16S rRNA测序技术,开展了患红斑病中间球海胆(Strongylocentroyus intermedius)肠道菌群结构和功能特征研究。结果显示,与健康组海胆相比,患病组海胆肠道菌群可操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs)数量减少,Alpha多样性显著下降(p<0.05)。门水平上,患病组海胆肠道菌群结构特征表现为变形菌门和拟杆菌门的相对丰度显著上升,以及厚壁菌门的相对丰度显著下降(p<0.05)。属水平上,Burkholderia_Caballeronia_Paraburkholderia、短波单胞菌属(Brevundimonas)、弧菌属(Vibrio)、假单胞菌属(Pseudomonas)等的相对丰度显著增加(p<0.05)。功能分析进一步揭示了患病组海胆肠道菌群代谢通路的变化,具体表现为肾素-血管紧张素系统、蛋白质消化、吸收、霍乱弧菌(V.cholerae)感染等相关代谢通路丰度显著增加,而叶酸生物合成途径通路丰度显著降低(p<0.05)。研究表明,红斑病扰乱了中间球海胆肠道微生态平衡,降低了肠道菌群的稳定性。 展开更多
关键词 中间球海胆 红斑病 16SrRNA 肠道菌群
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无脊椎动物脂肪酸结合蛋白的研究进展 被引量：1
2
作者 王姮 刚德报 +3 位作者 魏仁杰 马晓芸 李元鑫 丁君 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期3100-3113,共14页
脂肪酸结合蛋白(Fatty acid binding proteins,FABPs)是一类来自共同祖先基因的小分子蛋白,广泛存在于动物肠道、心脏、脑、脂肪和肌肉等多种组织中,能特异性结合脂肪酸并将脂肪酸输送到过氧化物酶体、线粒体和细胞核等细胞器中,进而调... 脂肪酸结合蛋白(Fatty acid binding proteins,FABPs)是一类来自共同祖先基因的小分子蛋白,广泛存在于动物肠道、心脏、脑、脂肪和肌肉等多种组织中,能特异性结合脂肪酸并将脂肪酸输送到过氧化物酶体、线粒体和细胞核等细胞器中,进而调控脂肪酸氧化和甘油三酯及磷脂合成等脂代谢过程。文章通过综述FABPs的分类、结构特征、生物学功能及典型无脊椎动物(原生动物、节肢动物、软体动物和棘皮动物)FABPs的研究进展,发现无脊椎动物的FABPs分子结构缺少糖、水分子、氨基和巯基等官能团,其功能更具复杂性,且主要与生长发育及脂肪酸转运等相关。相对于脊椎动物,无脊椎动物的FABPs研究尚处于起步阶段,今后需要进一步探究其基因结构、蛋白构造及其生物学功能等,包括如FABPs作为脂肪酸的细胞内载体以确定无脊椎动物特定膜供体和受体位点的识别,阐明FABPs分子结构是否具有捕获或释放配体的构象能力,分析配体结合特异性应与β-桶折叠定义空腔表面涂层的理化特性关系,以及不同类型FABPs是否具有不同的结构特点及生物学功能等。此外,从无脊椎动物分离获得的某些FABPs对生物疫苗制备具有一定促进作用,因此可应用于水产动物育种和代谢性疾病防治等生产实践中,为当前集约化养殖模式下的生物营养代谢性疾病预防和治疗提供新的视角。 展开更多
关键词 无脊椎动物 脂肪酸结合蛋白(FABPs) 脂肪酸 分类 生物学功能
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中间球海胆CS基因克隆及其响应急性高温胁迫的表达模式
3
作者 孙继红 任丽媛 +3 位作者 崔东遥 赵谭军 常亚青 湛垚垚 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期586-597,共12页
【目的】明确中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)柠檬酸合酶(CS)基因(SiCS)的序列特征、组织表达情况及其应对急性高温胁迫的响应规律,为研究SiCS基因功能及揭示其参与中间球海胆高温应答的分子机制提供理论依据。【方法】利用... 【目的】明确中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)柠檬酸合酶(CS)基因(SiCS)的序列特征、组织表达情况及其应对急性高温胁迫的响应规律,为研究SiCS基因功能及揭示其参与中间球海胆高温应答的分子机制提供理论依据。【方法】利用RACE克隆SiCS基因cDNA序列,通过BLASTx、EXPASY Proteomics Server、HMMER、PSIRED v3.3及SWISS-MODEL等在线软件进行生物信息学分析;然后采用分光光度法检测中间球海胆管足和性腺线粒体肿胀度,运用实时荧光定量PCR检测SiCS基因的组织表达规律,并以Epoch酶标仪测定中间球海胆管足和性腺总SiCS活性变化情况。【结果】SiCS基因cDNA序列全长2971 bp,5'端非编码区(5'-UTR)和3'端非编码区(3'-UTR)分别为96和1480 bp,开放阅读框(ORF)为1395 bp,共编码464个氨基酸残基。SiCS蛋白分子量约51.48 kD,理论等电点(pI)为6.09,总平均亲水性(GRAVY)为-0.178,为稳定的温和疏水性蛋白;SiCS蛋白不存在信号肽和跨膜结构域,其二级结构中α-螺旋占43.86%、β-折叠占7.02%、无规则卷曲占49.12%,三维结构模型与野猪CS蛋白晶体结构的一致性为73.97%。SiCS氨基酸序列与紫球海胆(S.purpuratus)的CS氨基酸序列相似性最高,为92.90%。SiCS基因在中间球海胆的5种组织中均有表达,其相对表达量排序为体腔细胞>围口膜>性腺>管足>肠道;总SiCS活性排序则为管足>肠道>围口膜>性腺>体腔细胞;与对照组(20℃)相比,经23和26℃急性高温胁迫后中间球海胆管足和性腺的SiCS基因相对表达量及总SiCS活性均呈波动变化规律,但在不同高湿胁迫下和不同组织中有所差异。【结论】中间球海胆可能通过调整组织中的SiCS基因相对表达及SiCS活性来响应急性高温胁迫,且这种响应策略存在一定的组织和温度特异性,具体表现为性腺对急性高温胁迫较管足更敏感。 展开更多
关键词 中间球海胆 柠檬酸合酶(CS) 急性高温胁迫 表达模式 酶活性
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养水机对刺参池塘理化参数和细菌丰度的影响 被引量：2
4
作者 张东升 王祖峰 周玮 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期85-92,共8页
养水机是一套能打破温、盐跃层的水质改良设备。为评价养水机对池塘水质的改良效果,该研究于大连庄河刺参(Apostichopus japonicus)养殖场,以自然纳潮和微孔曝气池塘为对照,对养水机池塘8项理化参数[温度、盐度、pH、溶解氧(DO)、总氨氮... 养水机是一套能打破温、盐跃层的水质改良设备。为评价养水机对池塘水质的改良效果,该研究于大连庄河刺参(Apostichopus japonicus)养殖场,以自然纳潮和微孔曝气池塘为对照,对养水机池塘8项理化参数[温度、盐度、pH、溶解氧(DO)、总氨氮(TAN)、亚硝态氮(NO_(2)^(−)-N)、活性磷酸盐(PO_(4)^(3+)-P)和沉积物有机质(TOM)]以及环境中活的异养菌、可培养弧菌的周年动态进行了监测,旨在对养水机净化水质效能进行评价。结果表明,与对照组相比,养水机池塘水中TAN、NO_(2)^(−)-N质量浓度在3—11月均最低(NO_(2)^(−)-N质量浓度6月除外),PO_(4)^(3+)-P质量浓度在3—8月最高,沉积物中TOM各月质量分数均最低(P<0.05),在温、盐跃层期,养水机能显著提高水体溶解氧质量浓度(P<0.05);与微孔曝气池塘相比,在8~9个月期间养水机均能促进池塘中活的异养菌生长,抑制弧菌生长。养水机在春、夏、秋季具有改善刺参养殖池塘水质和显著降低水中弧菌的良好效果,以及显著降低全年沉积物TOM的能力,在刺参养殖场具有较好的应用前景。 展开更多
关键词 养水机 总氨氮 亚硝态氮 异养菌 弧菌 水质净化 刺参养殖
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不同饵料对中间球海胆摄食与生长及硫酸软骨素积累的影响
5
作者 张淑鑫 崔东遥 +1 位作者 常亚青 宋坚 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期2732-2740,共9页
【目的】明确海带、江蓠和石莼3种饵料对中间球海胆摄食、壳径增长、体质量增长、性腺颜色及硫酸软骨素积累的影响,为筛选适宜的养殖海胆饵料及合理制定鲜饵料匮乏期的中间球海胆投喂计划提供理论依据。【方法】将中间球海胆按投喂饵料... 【目的】明确海带、江蓠和石莼3种饵料对中间球海胆摄食、壳径增长、体质量增长、性腺颜色及硫酸软骨素积累的影响,为筛选适宜的养殖海胆饵料及合理制定鲜饵料匮乏期的中间球海胆投喂计划提供理论依据。【方法】将中间球海胆按投喂饵料分为海带投喂组、江蓠投喂组和石莼投喂组,在投喂第30、60和90 d,利用游标卡尺测定海胆壳径和壳高,使用天平测定海胆体质量和性腺重量,计算日平均摄食率、饵料系数、壳径特定生长率、体质量特定生长率和性腺指数;通过色度计测定性腺颜色并计算色差;采用酶联免疫分析法(ELISA)测定中间球海胆性腺硫酸软骨素含量和硫酸软骨素合酶活性。【结果】随着投喂时间的推移,各处理组中间球海胆的日平均摄食率呈下降趋势,江蓠投喂组日平均摄食率最高,其次是海带投喂组,石莼投喂组中间球海胆的日平均摄食率最低;在各时间段,饵料系数最高的是江蓠投喂组,其次是海带投喂组,最低的是石莼投喂组,且三者差异显著(P<0.05,下同);随投喂时间的推移,各处理组中间球海胆的壳径特定生长率和体质量特定生长率均呈下降趋势,在相同投喂时间下,各处理组的海胆壳径特定生长率和体质量特定生长率均差异显著,排序均为海带投喂组>石莼投喂组>江蓠投喂组;3个处理组的中间球海胆性腺指数存在一定差异,排序为海带投喂组>石莼投喂组>江蓠投喂组;江蓠投喂组和海带投喂组中间球海胆性腺颜色较优,江蓠投喂组性腺红度在各投喂时间段均最高,且在第90 d江蓠投喂组性腺黄度显著高于其余处理组,海带投喂组性腺亮黄色差在各投喂时间段均最低;江蓠投喂组的中间球海胆性腺硫酸软骨素含量和硫酸软骨素合酶活性最低,海带投喂组和石莼投喂组无显著差异(P>0.05)。【结论】不同饵料对中间球海胆摄食、壳径增长、体质量增长、性腺发育和品质及硫酸软骨素积累存在不同影响,在海带匮乏期可通过投喂石莼和江蓠进行有效补充,从而保障中间球海胆的生长和发育。 展开更多
关键词 中间球海胆 饵料 摄食 生长 硫酸软骨素含量 硫酸软骨素合酶活性
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