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烟草丙酮酸脱羧酶家族生物信学分析
1
作者
王天龙
梁永标
+5 位作者
何俊龙
李江美
李春荣
高文佑
官崇植
苏家恩
《湖南农业科学》
2020年第3期4-7,共4页
为研究烟草丙酮酸脱羧酶家族特性,运用ProtScale、CDD、Interpro、Muscle、phyml和TreeDyn等工具分析烟草丙酮酸脱羧酶家族各成员的亲疏水性、结构域和进化树。结果表明:NtPDC_1和NtPDC_2具有亲水性,属于可溶性蛋白,NtPDC_3,NtPDC_4,NtP...
为研究烟草丙酮酸脱羧酶家族特性,运用ProtScale、CDD、Interpro、Muscle、phyml和TreeDyn等工具分析烟草丙酮酸脱羧酶家族各成员的亲疏水性、结构域和进化树。结果表明:NtPDC_1和NtPDC_2具有亲水性,属于可溶性蛋白,NtPDC_3,NtPDC_4,NtPDC_5和NtPDC_6具有疏水性,为非可溶性蛋白;烟草丙酮酸脱羧酶属于硫胺素焦磷酸(TPP)依赖性酶超家族,各成员均含有3组结构域,分别为N-末端TPP结构域、中心域和C-末端TPP结构域;烟草、拟南芥、水稻、薏苡和玉米的丙酮酸脱羧酶聚类为4组,其中烟草丙酮酸脱羧酶主要聚集在Ⅰ组和Ⅱ组,其进化相对保守。
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关键词
烟草
丙酮酸脱羧酶
蛋白特性
聚类分析
生物信息学
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题名
烟草丙酮酸脱羧酶家族生物信学分析
1
作者
王天龙
梁永标
何俊龙
李江美
李春荣
高文佑
官崇植
苏家恩
机构
大理
州
烟草公司
永平县
分公司
大理
州
烟草公司
鹤庆县
分公司
大理
州
烟草公司
剑川县
分公司
大理州烟草公司魏山县分公司
云南省
烟草公司
大理
州
公司
出处
《湖南农业科学》
2020年第3期4-7,共4页
文摘
为研究烟草丙酮酸脱羧酶家族特性,运用ProtScale、CDD、Interpro、Muscle、phyml和TreeDyn等工具分析烟草丙酮酸脱羧酶家族各成员的亲疏水性、结构域和进化树。结果表明:NtPDC_1和NtPDC_2具有亲水性,属于可溶性蛋白,NtPDC_3,NtPDC_4,NtPDC_5和NtPDC_6具有疏水性,为非可溶性蛋白;烟草丙酮酸脱羧酶属于硫胺素焦磷酸(TPP)依赖性酶超家族,各成员均含有3组结构域,分别为N-末端TPP结构域、中心域和C-末端TPP结构域;烟草、拟南芥、水稻、薏苡和玉米的丙酮酸脱羧酶聚类为4组,其中烟草丙酮酸脱羧酶主要聚集在Ⅰ组和Ⅱ组,其进化相对保守。
关键词
烟草
丙酮酸脱羧酶
蛋白特性
聚类分析
生物信息学
Keywords
tobacco
pyruvate decarboxylase
protein characteristics
cluster analysis
bioinformatics
分类号
Q557.9 [生物学—生物化学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草丙酮酸脱羧酶家族生物信学分析
王天龙
梁永标
何俊龙
李江美
李春荣
高文佑
官崇植
苏家恩
《湖南农业科学》
2020
0
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