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基于生物信息学分析人类线粒体转录终止因子1基因启动子
被引量：
4
1
作者
杨勇琴
孙美涛
+3 位作者
李月
王昀
张晓娟
熊伟
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2016年第4期348-353,共6页
目的线粒体转录终止因子1(mitchondrial transcription termination factor 1,MTERF1)编码蛋白质是调控线粒体基因表达和氧化磷酸化的重要因子。文中旨在分析人类MTERF1基因的转录调控序列、转录因子及其结合位点。方法采用进化足迹法,...
目的线粒体转录终止因子1(mitchondrial transcription termination factor 1,MTERF1)编码蛋白质是调控线粒体基因表达和氧化磷酸化的重要因子。文中旨在分析人类MTERF1基因的转录调控序列、转录因子及其结合位点。方法采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件对人类MTERF1基因5'端上游的启动子分布、Cp G岛、转录因子及其结合位点进行分析。结果人类MTERF1基因定位于7q21.2,基因全长7845 bp,含有4个外显子和3个内含子。基因上游5'端2500bp的核苷酸序列至少存在2个启动子,其中1878-2447 bp之间可能包含核心启动子。启动子区序列中存在1个长为812 bp的Cp G岛。人类和小鼠MTERF1同源基因存在26个共同的转录因子结合位点。结论生物信息学在线软件能预测人类MTERF1基因启动子和转录因子结合位点,提高了针对该基因启动子的研究效率。
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关键词
生物信息学
线粒体转录终止因子1
启动子
CP
G岛
转录因子
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职称材料
题名
基于生物信息学分析人类线粒体转录终止因子1基因启动子
被引量：
4
1
作者
杨勇琴
孙美涛
李月
王昀
张晓娟
熊伟
机构
大理大学基础医学院/云南省昆虫生物医药研发重点实验室
大理
市第一人民医院呼吸内科
出处
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2016年第4期348-353,共6页
基金
国家自然科学基金(81560458)
云南省教育厅科学研究基金(2014Z126)
+1 种基金
大理大学博士科研启动基金(BSKY2012018)
大理大学大学生创新创业计划项目(201402)
文摘
目的线粒体转录终止因子1(mitchondrial transcription termination factor 1,MTERF1)编码蛋白质是调控线粒体基因表达和氧化磷酸化的重要因子。文中旨在分析人类MTERF1基因的转录调控序列、转录因子及其结合位点。方法采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件对人类MTERF1基因5'端上游的启动子分布、Cp G岛、转录因子及其结合位点进行分析。结果人类MTERF1基因定位于7q21.2,基因全长7845 bp,含有4个外显子和3个内含子。基因上游5'端2500bp的核苷酸序列至少存在2个启动子,其中1878-2447 bp之间可能包含核心启动子。启动子区序列中存在1个长为812 bp的Cp G岛。人类和小鼠MTERF1同源基因存在26个共同的转录因子结合位点。结论生物信息学在线软件能预测人类MTERF1基因启动子和转录因子结合位点,提高了针对该基因启动子的研究效率。
关键词
生物信息学
线粒体转录终止因子1
启动子
CP
G岛
转录因子
Keywords
Bioinformatics
Mitochondrial transcription ter mination factor
Promoter
Cp G island
Tran scription factor
分类号
Q74 [生物学—分子生物学]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析人类线粒体转录终止因子1基因启动子
杨勇琴
孙美涛
李月
王昀
张晓娟
熊伟
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2016
4
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