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大熊猫国家公园广元片区野生动物及其环境源大肠杆菌流行病学及耐药性调查
被引量：
1
1
作者
苏小艳
杨梅
+7 位作者
燕霞
侯蓉
肖梅
王劲松
刘圣
王路才
张文平
黄虹秀
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期430-442,共13页
为了解大熊猫国家公园广元片区野生动物及其生活环境中大肠杆菌流行病学特点,防止大肠杆菌在该区域造成流行性疫病,探明该区域野生动物对抗生素的耐药情况,本研究2022年8—9月采集大熊猫国家公园广元片区内野生动物粪便、水及土壤样品共...
为了解大熊猫国家公园广元片区野生动物及其生活环境中大肠杆菌流行病学特点,防止大肠杆菌在该区域造成流行性疫病,探明该区域野生动物对抗生素的耐药情况,本研究2022年8—9月采集大熊猫国家公园广元片区内野生动物粪便、水及土壤样品共计243份,采用16S rRNA、K-B法、高通量荧光定量PCR法和PCR技术对该区域的大肠杆菌进行分离鉴定、药敏实验、耐药基因和毒力基因检测。结果显示:243份样品中共分离鉴定出86株大肠杆菌,分离率为35.39%;该区域内分离到的大肠杆菌对阿莫西林有较高的耐药率(52.33%),对链霉素、庆大霉素等抗生素的耐药率较低(1.16%~9.30%),对头孢他啶、氯霉素、氟苯尼考、甲氧苄氨嘧啶均敏感;携带大量的耐药基因,其中多重耐药类(83.14%)、磺胺类(55.52%)、四环素类(48.52%)抗生素耐药基因携带率较高,其余耐药基因携带率为26.16%~35.72%;分离株携带1~6个毒力基因,irp2检出率(91.86%)最高,其次为ompA、ibeB和tsh(检出率分别为55.81%、69.77%和52.33%),FyuA、fimH和PapA检出率较低(分别为17.44%、19.77%和1.16%);86株大肠杆菌中均未检出5种致泻性大肠杆菌。本研究为大熊猫国家公园广元片区野生动物及环境源大肠杆菌的流行情况提供了科学数据参考,为人兽共患病的防控提供生态学依据。
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关键词
大熊猫国家公园广元片区
大肠杆菌
流行情况
耐药性
毒力基因
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职称材料
大熊猫源奇异变形杆菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌多重PCR检测方法的建立及应用
被引量：
6
2
作者
刘圣
郑维超
+12 位作者
黄虹秀
刘颂蕊
杨梅
燕霞
李运莉
岳婵娟
侯蓉
张东升
范雪阳
张洪文
李林
曹立亭
苏小艳
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期598-603,共6页
为建立一种快速鉴别检测大熊猫3种病原菌的多重PCR方法,本研究根据NCBI登录的奇异变形杆菌(PM)ureR基因、肺炎克雷伯菌(KPN)phoE基因、大肠杆菌(E.coli)phoA基因,设计3对引物,并对各反应条件优化,初步建立检测大熊猫源PM、KPN和E.coli...
为建立一种快速鉴别检测大熊猫3种病原菌的多重PCR方法,本研究根据NCBI登录的奇异变形杆菌(PM)ureR基因、肺炎克雷伯菌(KPN)phoE基因、大肠杆菌(E.coli)phoA基因,设计3对引物,并对各反应条件优化,初步建立检测大熊猫源PM、KPN和E.coli的多重PCR方法。特异性结果显示,本研究建立的多重PCR方法对PM、KPN和E.coli能够分别扩增到308 bp、456 bp和666 bp的目的条带,而对大熊猫常见的其它20种病原菌均无扩增;敏感性试验结果显示,该方法对PM、KPN和E.coli DNA的检测限分别为2.8×10^(7)拷贝/μL(ureR)、3×10^(7)拷贝/μL(phoE)、6×10^(7)拷贝/μL(phoA)。利用本研究建立的多重PCR方法对100份大熊猫临床样品检测,结果显示:PM、KPN和E.coli的检出率分别为30%(30/100)、90%(90/100)和100%(100/100),均与研究报道的单一PCR检出率相同,对PM和KPN的检出率均高于传统病原分离方法(25%、83%)。本研究建立的大熊猫源PM、KPN、E.coli多重PCR检测方法特异性较强、敏感性较高,且可以同时检测3种病原,为大熊猫细菌性疾病的诊断提供了新的检测手段,极大缩短了检测时间,对临床防控相应细菌性疾病具有重要意义。
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关键词
大熊猫
奇异变形杆菌
肺炎克雷伯菌
大肠杆菌
多重PCR
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职称材料
题名
大熊猫国家公园广元片区野生动物及其环境源大肠杆菌流行病学及耐药性调查
被引量：
1
1
作者
苏小艳
杨梅
燕霞
侯蓉
肖梅
王劲松
刘圣
王路才
张文平
黄虹秀
机构
成都
大熊猫
繁育研究基地
大熊猫国家公园广元管理分局
四川省唐家河
国家
级自然保护区
管理
处
四川省毛寨自然保护区
管理
局
出处
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期430-442,共13页
基金
四川省自然科学基金(2022NSFSC0020)
成都大熊猫繁育研究基地自立课题(2021CPB-B15和2020CPB-B23)。
文摘
为了解大熊猫国家公园广元片区野生动物及其生活环境中大肠杆菌流行病学特点,防止大肠杆菌在该区域造成流行性疫病,探明该区域野生动物对抗生素的耐药情况,本研究2022年8—9月采集大熊猫国家公园广元片区内野生动物粪便、水及土壤样品共计243份,采用16S rRNA、K-B法、高通量荧光定量PCR法和PCR技术对该区域的大肠杆菌进行分离鉴定、药敏实验、耐药基因和毒力基因检测。结果显示:243份样品中共分离鉴定出86株大肠杆菌,分离率为35.39%;该区域内分离到的大肠杆菌对阿莫西林有较高的耐药率(52.33%),对链霉素、庆大霉素等抗生素的耐药率较低(1.16%~9.30%),对头孢他啶、氯霉素、氟苯尼考、甲氧苄氨嘧啶均敏感;携带大量的耐药基因,其中多重耐药类(83.14%)、磺胺类(55.52%)、四环素类(48.52%)抗生素耐药基因携带率较高,其余耐药基因携带率为26.16%~35.72%;分离株携带1~6个毒力基因,irp2检出率(91.86%)最高,其次为ompA、ibeB和tsh(检出率分别为55.81%、69.77%和52.33%),FyuA、fimH和PapA检出率较低(分别为17.44%、19.77%和1.16%);86株大肠杆菌中均未检出5种致泻性大肠杆菌。本研究为大熊猫国家公园广元片区野生动物及环境源大肠杆菌的流行情况提供了科学数据参考,为人兽共患病的防控提供生态学依据。
关键词
大熊猫国家公园广元片区
大肠杆菌
流行情况
耐药性
毒力基因
Keywords
Guangyuan area of Giant Panda National Park
Escherichia coli
Epidemic situation
Antibiotics resistance
Virulence genes
分类号
Q938 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
大熊猫源奇异变形杆菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌多重PCR检测方法的建立及应用
被引量：
6
2
作者
刘圣
郑维超
黄虹秀
刘颂蕊
杨梅
燕霞
李运莉
岳婵娟
侯蓉
张东升
范雪阳
张洪文
李林
曹立亭
苏小艳
机构
西南大学动物医学院
成都
大熊猫
繁育研究基地四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室
大熊猫国家公园广元管理分局
四川
大熊猫
科学研究院
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期598-603,共6页
基金
成都大熊猫繁育研究基金会(CPF2014-03)
成都大熊猫繁育研究基地自立课题(2021CPB-B15、2020CPB-B23)
国家林业和草原局和四川省财政厅资金(圈养及野外大熊猫重大疾病防控研究)。
文摘
为建立一种快速鉴别检测大熊猫3种病原菌的多重PCR方法,本研究根据NCBI登录的奇异变形杆菌(PM)ureR基因、肺炎克雷伯菌(KPN)phoE基因、大肠杆菌(E.coli)phoA基因,设计3对引物,并对各反应条件优化,初步建立检测大熊猫源PM、KPN和E.coli的多重PCR方法。特异性结果显示,本研究建立的多重PCR方法对PM、KPN和E.coli能够分别扩增到308 bp、456 bp和666 bp的目的条带,而对大熊猫常见的其它20种病原菌均无扩增;敏感性试验结果显示,该方法对PM、KPN和E.coli DNA的检测限分别为2.8×10^(7)拷贝/μL(ureR)、3×10^(7)拷贝/μL(phoE)、6×10^(7)拷贝/μL(phoA)。利用本研究建立的多重PCR方法对100份大熊猫临床样品检测,结果显示:PM、KPN和E.coli的检出率分别为30%(30/100)、90%(90/100)和100%(100/100),均与研究报道的单一PCR检出率相同,对PM和KPN的检出率均高于传统病原分离方法(25%、83%)。本研究建立的大熊猫源PM、KPN、E.coli多重PCR检测方法特异性较强、敏感性较高,且可以同时检测3种病原,为大熊猫细菌性疾病的诊断提供了新的检测手段,极大缩短了检测时间,对临床防控相应细菌性疾病具有重要意义。
关键词
大熊猫
奇异变形杆菌
肺炎克雷伯菌
大肠杆菌
多重PCR
Keywords
giant panda
Proteus mirabilis
Klebsiella pneumoniae
Escherichia coli
multiplex PCR
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大熊猫国家公园广元片区野生动物及其环境源大肠杆菌流行病学及耐药性调查
苏小艳
杨梅
燕霞
侯蓉
肖梅
王劲松
刘圣
王路才
张文平
黄虹秀
《兽类学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
大熊猫源奇异变形杆菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌多重PCR检测方法的建立及应用
刘圣
郑维超
黄虹秀
刘颂蕊
杨梅
燕霞
李运莉
岳婵娟
侯蓉
张东升
范雪阳
张洪文
李林
曹立亭
苏小艳
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
6
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