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基于癌症基因组图谱数据库结直肠癌免疫细胞浸润预测模型的建立
被引量：
2
1
作者
丁婷婷
曾楚雄
+1 位作者
胡丽娜
余明华
《北京大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期203-208,共6页
目的:研究结直肠癌组织的免疫细胞浸润与临床预后之间的相关性。方法:从癌症基因组图谱(the can-cer genome atlas,TCGA)中提取结直肠癌数据,基于反卷积算法(CIBERSORT)分析评估结直肠癌组织中22种肿瘤浸润性免疫细胞(tumor-infiltratin...
目的:研究结直肠癌组织的免疫细胞浸润与临床预后之间的相关性。方法:从癌症基因组图谱(the can-cer genome atlas,TCGA)中提取结直肠癌数据,基于反卷积算法(CIBERSORT)分析评估结直肠癌组织中22种肿瘤浸润性免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TIICs)的浸润模式,以确定不同TIICs表达程度与5年生存率之间的关联。使用条形图展示结直肠癌样本中TIICs比例,绘制矩阵图分析不同TIICs之间的相关性。结果:共从TCGA数据库中提取了473例结直肠癌组织和41个正常对照组织,对比分析表明,结直肠癌组织中各种TIICs比例存在差异。在研究的细胞亚群中,结直肠癌组织中M0、M1和M2巨噬细胞和单核细胞的比例相对较高,而B细胞和中性粒细胞的比例相对较低。TIICs的比例与患者的TNM分期及临床分级显著相关:静息NK细胞、CD8+T细胞、浆细胞与T期相关,活化树突状细胞与N期相关,嗜酸性粒细胞、M1巨噬细胞及活化肥大细胞与M期相关,M1巨噬细胞和单核细胞与临床分级相关。生存分析结果显示,活化的树突状细胞与结直肠癌患者的5年生存率呈正相关,幼稚CD4+T细胞与5年生存率呈负相关。结论:分析结直肠癌患者肿瘤组织TIICs亚群比例具有潜在的临床预后价值,可通过其识别可能从化疗中受益的患者,并预测新药的可能靶点。
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关键词
淋巴细胞
肿瘤浸润
结直肠肿瘤
基因数据库
列线图
临床病理特征
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职称材料
原发性胆汁性肝硬化合并慢性血吸虫肝病1例及文献复习
被引量：
1
2
作者
潘健健
马芬芬
+3 位作者
刘慧
徐瞳
胡丽娜
余明华
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期281-284,共4页
原发性胆汁性肝硬化（primary biliary cirrhosis，PBC)为肝内中小胆管进行性、非化脓性炎症和血清抗线粒体抗体髙度特异性导致的慢性胆汁淤积，可导致门静脉炎症及肝纤维化，最终导致肝功能衰竭或肝癌[1]。全球范围内以北美和北欧国家...
原发性胆汁性肝硬化（primary biliary cirrhosis，PBC)为肝内中小胆管进行性、非化脓性炎症和血清抗线粒体抗体髙度特异性导致的慢性胆汁淤积，可导致门静脉炎症及肝纤维化，最终导致肝功能衰竭或肝癌[1]。全球范围内以北美和北欧国家发病率最高[2]。女性发病率高于男性，多见于中老年人[3]。发病机制尚不清楚，可能与遗传背景及环境等相互作用所导致的异常自身免疫反应有关[4]。
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关键词
原发性胆汁性肝硬化
慢性血吸虫肝病
肝硬化合并
文献复习
非化脓性炎症
抗线粒体抗体
自身免疫反应
肝功能衰竭
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职称材料
题名
基于癌症基因组图谱数据库结直肠癌免疫细胞浸润预测模型的建立
被引量：
2
1
作者
丁婷婷
曾楚雄
胡丽娜
余明华
机构
上海市
浦东
医院
出处
《北京大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期203-208,共6页
基金
浦东新区科技发展基金(PKJ2018-Y33)
上海市浦东新区卫生系统优秀青年医学人才培养计划项目(PWRq2021-21)。
文摘
目的:研究结直肠癌组织的免疫细胞浸润与临床预后之间的相关性。方法:从癌症基因组图谱(the can-cer genome atlas,TCGA)中提取结直肠癌数据,基于反卷积算法(CIBERSORT)分析评估结直肠癌组织中22种肿瘤浸润性免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TIICs)的浸润模式,以确定不同TIICs表达程度与5年生存率之间的关联。使用条形图展示结直肠癌样本中TIICs比例,绘制矩阵图分析不同TIICs之间的相关性。结果:共从TCGA数据库中提取了473例结直肠癌组织和41个正常对照组织,对比分析表明,结直肠癌组织中各种TIICs比例存在差异。在研究的细胞亚群中,结直肠癌组织中M0、M1和M2巨噬细胞和单核细胞的比例相对较高,而B细胞和中性粒细胞的比例相对较低。TIICs的比例与患者的TNM分期及临床分级显著相关:静息NK细胞、CD8+T细胞、浆细胞与T期相关,活化树突状细胞与N期相关,嗜酸性粒细胞、M1巨噬细胞及活化肥大细胞与M期相关,M1巨噬细胞和单核细胞与临床分级相关。生存分析结果显示,活化的树突状细胞与结直肠癌患者的5年生存率呈正相关,幼稚CD4+T细胞与5年生存率呈负相关。结论:分析结直肠癌患者肿瘤组织TIICs亚群比例具有潜在的临床预后价值,可通过其识别可能从化疗中受益的患者,并预测新药的可能靶点。
关键词
淋巴细胞
肿瘤浸润
结直肠肿瘤
基因数据库
列线图
临床病理特征
Keywords
Lymphocytes,tumor-infiltrating
Colorectal neoplasms
Genetic databases
Nomogram
Clinicopathological characteristics
分类号
R730.51 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
原发性胆汁性肝硬化合并慢性血吸虫肝病1例及文献复习
被引量：
1
2
作者
潘健健
马芬芬
刘慧
徐瞳
胡丽娜
余明华
机构
复旦大学
附属
浦东
医院
全科医学科
复旦大学
附属
浦东
医院
药剂科
复旦大学附属浦东医院肿瘤科
复旦大学
附属
肿瘤
医院
肿瘤
内科
出处
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期281-284,共4页
文摘
原发性胆汁性肝硬化（primary biliary cirrhosis，PBC)为肝内中小胆管进行性、非化脓性炎症和血清抗线粒体抗体髙度特异性导致的慢性胆汁淤积，可导致门静脉炎症及肝纤维化，最终导致肝功能衰竭或肝癌[1]。全球范围内以北美和北欧国家发病率最高[2]。女性发病率高于男性，多见于中老年人[3]。发病机制尚不清楚，可能与遗传背景及环境等相互作用所导致的异常自身免疫反应有关[4]。
关键词
原发性胆汁性肝硬化
慢性血吸虫肝病
肝硬化合并
文献复习
非化脓性炎症
抗线粒体抗体
自身免疫反应
肝功能衰竭
分类号
R532.21 [医药卫生—内科学]
R575.2 [医药卫生—消化系统]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于癌症基因组图谱数据库结直肠癌免疫细胞浸润预测模型的建立
丁婷婷
曾楚雄
胡丽娜
余明华
《北京大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
在线阅读
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职称材料
2
原发性胆汁性肝硬化合并慢性血吸虫肝病1例及文献复习
潘健健
马芬芬
刘慧
徐瞳
胡丽娜
余明华
《复旦学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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