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三种不同代谢紊乱相关脂肪性肝炎小鼠模型的转录组比较分析
1
作者
刘天雯
郭子宜
+4 位作者
毕寒琦
周冰
陆炎
毛斐
王华
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025年第8期1445-1453,共9页
目的比较分析3种代谢紊乱相关脂肪性肝炎(MASH)小鼠模型与不同阶段MASH人类患者的转录谱异同,探究更适合模拟人类疾病进展的小鼠模型。方法40只8周龄雄性C57BL/6J小鼠随机分为对照的普通饮食(NCD)组以及构造MASH模型的高脂高胆固醇饮食(...
目的比较分析3种代谢紊乱相关脂肪性肝炎(MASH)小鼠模型与不同阶段MASH人类患者的转录谱异同,探究更适合模拟人类疾病进展的小鼠模型。方法40只8周龄雄性C57BL/6J小鼠随机分为对照的普通饮食(NCD)组以及构造MASH模型的高脂高胆固醇饮食(HFHCD)、胆碱缺乏高脂饮食(CDHFD)、蛋氨酸-胆碱缺乏饮食(MCD)组,每组10只。造模结束后,每组取3只小鼠进行肝脏mRNA-seq转录组测序,同时检索MASH患者的肝脏mRNA公共数据集,通过KEGG集富集分析比较不同小鼠模型和MASH患者的转录图谱,利用Pearson相关性分析探究各种模型与人类MASH之间差异基因表达的相关性。结果3种MASH小鼠模型中,检测到7个共同的上调基因(Col1a1、Smoc2、Col6a1、Gpx3、Col16a1、Spp1和Crtap)。KEGG分析中,3种MASH小鼠模型富集到28条重叠通路,涉及脂肪变性、肝细胞损伤和纤维化等方面,其中HFHCD和MCD两种模型的重叠程度更高。比较不同小鼠模型和MASH不同阶段患者之间的差异基因表达和代谢通路,显示3种MASH小鼠模型的变化与人类MASH的纤维化进展阶段更为相似。其中,CDHFD模型的转录组特征与人类MASH更为接近。结论3种MASH小鼠模型转录谱之间存在一定异同,MASH小鼠模型与人类患者MASH进展期更相似,CDHFD模型的转录组特征与人类MASH更为接近。
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关键词
代谢紊乱相关脂肪性肝炎
小鼠模型
转录组
比较分析
差异基因
代谢通路
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题名
三种不同代谢紊乱相关脂肪性肝炎小鼠模型的转录组比较分析
1
作者
刘天雯
郭子宜
毕寒琦
周冰
陆炎
毛斐
王华
机构
安徽医
科
大学
第一
附属
医院
肿瘤
科
安徽医
科
大学
炎症免疫性疾病安徽省实验室
复旦大学
附属
闵行
医院
内分泌
与代谢
科
上海交通
大学
医学院
附属
上海市第六人民
医院
复旦大学附属中山医院内分泌与代谢科
出处
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025年第8期1445-1453,共9页
基金
国家自然科学基金项目(编号:92268109)。
文摘
目的比较分析3种代谢紊乱相关脂肪性肝炎(MASH)小鼠模型与不同阶段MASH人类患者的转录谱异同,探究更适合模拟人类疾病进展的小鼠模型。方法40只8周龄雄性C57BL/6J小鼠随机分为对照的普通饮食(NCD)组以及构造MASH模型的高脂高胆固醇饮食(HFHCD)、胆碱缺乏高脂饮食(CDHFD)、蛋氨酸-胆碱缺乏饮食(MCD)组,每组10只。造模结束后,每组取3只小鼠进行肝脏mRNA-seq转录组测序,同时检索MASH患者的肝脏mRNA公共数据集,通过KEGG集富集分析比较不同小鼠模型和MASH患者的转录图谱,利用Pearson相关性分析探究各种模型与人类MASH之间差异基因表达的相关性。结果3种MASH小鼠模型中,检测到7个共同的上调基因(Col1a1、Smoc2、Col6a1、Gpx3、Col16a1、Spp1和Crtap)。KEGG分析中,3种MASH小鼠模型富集到28条重叠通路,涉及脂肪变性、肝细胞损伤和纤维化等方面,其中HFHCD和MCD两种模型的重叠程度更高。比较不同小鼠模型和MASH不同阶段患者之间的差异基因表达和代谢通路,显示3种MASH小鼠模型的变化与人类MASH的纤维化进展阶段更为相似。其中,CDHFD模型的转录组特征与人类MASH更为接近。结论3种MASH小鼠模型转录谱之间存在一定异同,MASH小鼠模型与人类患者MASH进展期更相似,CDHFD模型的转录组特征与人类MASH更为接近。
关键词
代谢紊乱相关脂肪性肝炎
小鼠模型
转录组
比较分析
差异基因
代谢通路
Keywords
MASH
murine models
transcriptome
comparative analysis
differentially expressed genes
metabolic pathway
分类号
R589.2 [医药卫生—内分泌]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
三种不同代谢紊乱相关脂肪性肝炎小鼠模型的转录组比较分析
刘天雯
郭子宜
毕寒琦
周冰
陆炎
毛斐
王华
《安徽医科大学学报》
北大核心
2025
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