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应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组
被引量：
5
1
作者
张一甫
秦兆宇
+2 位作者
刘晓慧
林成招
贺福初
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期421-429,共9页
首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、...
首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝脏蛋白质的表达差异。共鉴定357种蛋白质,6个时间点共有60种蛋白质的表达量与对照组(手术切下的正常肝组织)有显著差异。其中,ADH1(Alcohol dehy-drogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的表达变化趋势与已有报道相同,GO(Gene ontology)的蛋白质功能注释提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A-Ⅰ)等可能通过影响细胞凋亡和能量供给等方式参与肝再生调控。聚类分析表明,术后12 h和24 h蛋白质的整体表达模式相似,6 h与此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h与这些时间点相差最远。该研究验证了8标iTRAQ是并行处理多组样本的有效技术,适合于生理和病理过程多时间点蛋白质组的定量差异分析,可以监控关键分子的动态变化,更易发掘重要的调控靶点分子。该文为进一步探讨肝再生机理提供了有价值的线索。
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关键词
ITRAQ
2D
LC-MS/MS
肝脏再生
差异蛋白质组
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职称材料
液相等电聚焦结合双向凝胶电泳分离碱性蛋白
被引量：
5
2
作者
钟华
张扬
+1 位作者
樊惠芝
杨芃原
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期1830-1834,共5页
在蛋白组学研究中,经典的双向凝胶电泳法(2-DE)对碱性蛋白及低丰度蛋白的分离存在技术障碍,但预分离技术的应用可弥补其缺陷.液相等电聚焦可有效地分离富集复杂蛋白样品.碱性胶条用于2-DE可极大地提高蛋白上样量和凝胶分辨率.将上述两...
在蛋白组学研究中,经典的双向凝胶电泳法(2-DE)对碱性蛋白及低丰度蛋白的分离存在技术障碍,但预分离技术的应用可弥补其缺陷.液相等电聚焦可有效地分离富集复杂蛋白样品.碱性胶条用于2-DE可极大地提高蛋白上样量和凝胶分辨率.将上述两种技术相结合用于碱性蛋白质和低丰度蛋白质的分离鉴定,可使碱端区域双向凝胶图谱质量显著提高,蛋白点更清晰且点数增多,质谱鉴定确信度提高,碱性蛋白和低丰度蛋白质谱鉴定成功率提高,对于蛋白组学研究具有一定的意义.
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关键词
液相等电聚焦
双向凝胶电泳
碱性蛋白
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职称材料
题名
应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组
被引量：
5
1
作者
张一甫
秦兆宇
刘晓慧
林成招
贺福初
机构
复旦大学
生物医学
研究院
系统
生物
学实验室
复旦大学生物医学研究院蛋白质组研究中心
北京放射
医学
研究
所北京
蛋白质
组
研究
中心
蛋白质
组
学国家重点实验室
出处
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期421-429,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(30900257)
上海市自然科学基金资助项目(09ZR1404100)
北京蛋白质组学国家重点实验室自主课题资助项目(SKLP-K200808)
文摘
首次应用8标iTRAQ(Isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术结合2D LC-MS/MS(Two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry),以部分肝切除的大鼠为模型,全面分析了再生早期(6、12 h)、中期(24、48 h)和晚期(72、120 h)肝脏蛋白质的表达差异。共鉴定357种蛋白质,6个时间点共有60种蛋白质的表达量与对照组(手术切下的正常肝组织)有显著差异。其中,ADH1(Alcohol dehy-drogenase 1)和PRDX1(Peroxiredoxin 1)等的表达变化趋势与已有报道相同,GO(Gene ontology)的蛋白质功能注释提示ADH1、CAT(Catalase)、ENO1(Enolase 1)和APOA1(Apolipoprotein A-Ⅰ)等可能通过影响细胞凋亡和能量供给等方式参与肝再生调控。聚类分析表明,术后12 h和24 h蛋白质的整体表达模式相似,6 h与此二者相近,48 h和72 h相似,而120 h与这些时间点相差最远。该研究验证了8标iTRAQ是并行处理多组样本的有效技术,适合于生理和病理过程多时间点蛋白质组的定量差异分析,可以监控关键分子的动态变化,更易发掘重要的调控靶点分子。该文为进一步探讨肝再生机理提供了有价值的线索。
关键词
ITRAQ
2D
LC-MS/MS
肝脏再生
差异蛋白质组
Keywords
iTRAQ
2D LC-MS/MS
liver regeneration
differential proteomics
分类号
O657.63 [理学—分析化学]
O629.73 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
液相等电聚焦结合双向凝胶电泳分离碱性蛋白
被引量：
5
2
作者
钟华
张扬
樊惠芝
杨芃原
机构
复旦大学
生物医学
研究院
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第10期1830-1834,共5页
基金
国家自然科学基金(批准号:90408023)
国家科技攻关计划(批准号:2004BA711A18)
上海市重大基础研究项目(批准号:04DZ14005)资助.
文摘
在蛋白组学研究中,经典的双向凝胶电泳法(2-DE)对碱性蛋白及低丰度蛋白的分离存在技术障碍,但预分离技术的应用可弥补其缺陷.液相等电聚焦可有效地分离富集复杂蛋白样品.碱性胶条用于2-DE可极大地提高蛋白上样量和凝胶分辨率.将上述两种技术相结合用于碱性蛋白质和低丰度蛋白质的分离鉴定,可使碱端区域双向凝胶图谱质量显著提高,蛋白点更清晰且点数增多,质谱鉴定确信度提高,碱性蛋白和低丰度蛋白质谱鉴定成功率提高,对于蛋白组学研究具有一定的意义.
关键词
液相等电聚焦
双向凝胶电泳
碱性蛋白
Keywords
Liquid isoelectric focusing
Two-dimensional electrophoresis
Alkaline protein
分类号
O657 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用8标iTRAQ技术结合2D LC-MS/MS分析大鼠再生肝的差异蛋白质组
张一甫
秦兆宇
刘晓慧
林成招
贺福初
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
在线阅读
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职称材料
2
液相等电聚焦结合双向凝胶电泳分离碱性蛋白
钟华
张扬
樊惠芝
杨芃原
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006
5
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
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