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基于网络药理学和分子对接研究罗布麻抗抑郁机制
被引量:
4
1
作者
徐莉莉
李祥婷
+3 位作者
张雯
蔡定芳
王飞
向军
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期995-999,共5页
目的基于网络药理学和分子对接研究罗布麻抗抑郁机制。方法通过数据库检索文献获取罗布麻活性成分、作用靶点、抑郁相关靶点,采用String数据库构建蛋白互作用网络,Cytoscape 3.8.1软件构建成分-靶点-疾病网络,Bioconductor生物信息软件...
目的基于网络药理学和分子对接研究罗布麻抗抑郁机制。方法通过数据库检索文献获取罗布麻活性成分、作用靶点、抑郁相关靶点,采用String数据库构建蛋白互作用网络,Cytoscape 3.8.1软件构建成分-靶点-疾病网络,Bioconductor生物信息软件包进行GO功能富集和KEGG通路分析,DockVina分子对接软件对活性成分与关键抗抑郁靶点进行结果验证。结果共得到8个主要活性成分和34个关键靶点,INS、VEGFA、AKT1、TP53、IL-6、CAT、JUN、TNF等可能是罗布麻抗抑郁最重要的潜在靶点。GO功能富集分析得到70个分子功能条目,主要涉及细胞因子受体结合、受体配体活性、细胞因子活性、生长因子受体结合、血红素结合、四吡咯结合、氧化还原酶活性、磷酸酶结合;KEGG通路富集分析得到162条信号通路,与糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、C-型凝集素受体信号通路、IL-17信号通路、胰岛素抵抗、Toll样受体信号通路、T细胞受体信号通路等关系最密切;分子对接验证发现木犀草素,尤其是芸香苷与关键抗抑郁靶点能够形成最佳复合体。结论罗布麻抗抑郁作用与其对炎症因子活性及其功能调节有关。
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关键词
罗布麻
抗抑郁
作用机制
网络药理学
分子对接
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职称材料
基于网络药理学和动物实验探讨小续命汤治疗缺血性卒中的作用机制
被引量:
8
2
作者
王飞
徐莉莉
+3 位作者
张雅珍
兰瑞
向军
李祥婷
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期2398-2402,共5页
目的基于网络药理学和动物实验探讨小续命汤治疗缺血性卒中的作用机制。方法采用网络数据库获取小续命汤的成分及其对应的作用靶点、缺血性卒中的疾病靶点,Venny 2.1.0软件获取成分-疾病靶点交集,STRING数据库进行蛋白互作(PPI)分析获...
目的基于网络药理学和动物实验探讨小续命汤治疗缺血性卒中的作用机制。方法采用网络数据库获取小续命汤的成分及其对应的作用靶点、缺血性卒中的疾病靶点,Venny 2.1.0软件获取成分-疾病靶点交集,STRING数据库进行蛋白互作(PPI)分析获得核心靶点,Bioconductor软件包进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。以脑缺血再灌注大鼠模型观察小续命汤对脑梗死面积、神经功能缺损评分、关键靶点的影响。结果数据库检索获得126种活性成分和57个关键靶点,GO富集分析得到细胞因子受体结合、细胞因子活性、磷酸酶结合等74个分子功能条目,KEGG富集分析得到流体剪切应力和动脉粥样硬化、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、IL-17等124条信号通路。动物实验表明,小续命汤可减少大鼠脑梗死面积百分比,减轻神经功能缺损,下调IL-6、VEGFA、TP53表达。结论小续命汤具有多种活性成分,通过调控IL-6、VEGFA、TP53等多靶点,减少脑梗死面积,减轻神经功能缺损,进而发挥治疗缺血性卒中的作用。
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关键词
小续命汤
缺血性卒中
网络药理学
IL-6
VEGF
P53
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接研究罗布麻抗抑郁机制
被引量:
4
1
作者
徐莉莉
李祥婷
张雯
蔡定芳
王飞
向军
机构
复旦大学
附属中山医院
中西医
结合
科
复旦大学中西医结合研究院内科研究所
复旦大学
附属中山医院药剂科
出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期995-999,共5页
基金
国家自然科学基金(81903970)。
文摘
目的基于网络药理学和分子对接研究罗布麻抗抑郁机制。方法通过数据库检索文献获取罗布麻活性成分、作用靶点、抑郁相关靶点,采用String数据库构建蛋白互作用网络,Cytoscape 3.8.1软件构建成分-靶点-疾病网络,Bioconductor生物信息软件包进行GO功能富集和KEGG通路分析,DockVina分子对接软件对活性成分与关键抗抑郁靶点进行结果验证。结果共得到8个主要活性成分和34个关键靶点,INS、VEGFA、AKT1、TP53、IL-6、CAT、JUN、TNF等可能是罗布麻抗抑郁最重要的潜在靶点。GO功能富集分析得到70个分子功能条目,主要涉及细胞因子受体结合、受体配体活性、细胞因子活性、生长因子受体结合、血红素结合、四吡咯结合、氧化还原酶活性、磷酸酶结合;KEGG通路富集分析得到162条信号通路,与糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、C-型凝集素受体信号通路、IL-17信号通路、胰岛素抵抗、Toll样受体信号通路、T细胞受体信号通路等关系最密切;分子对接验证发现木犀草素,尤其是芸香苷与关键抗抑郁靶点能够形成最佳复合体。结论罗布麻抗抑郁作用与其对炎症因子活性及其功能调节有关。
关键词
罗布麻
抗抑郁
作用机制
网络药理学
分子对接
分类号
R966 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
基于网络药理学和动物实验探讨小续命汤治疗缺血性卒中的作用机制
被引量:
8
2
作者
王飞
徐莉莉
张雅珍
兰瑞
向军
李祥婷
机构
复旦大学
附属中山医院药剂科
复旦大学
附属中山医院
中西医
结合
科
河南中医药
大学
第一附属医院脑病科
复旦大学中西医结合研究院内科研究所
出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期2398-2402,共5页
基金
国家自然科学基金项目(81973618,81973619)
上海市自然科学基金项目(19ZR1409900)
上海市十三五临床重点专科-中医急诊项目(shslczdzk04403)。
文摘
目的基于网络药理学和动物实验探讨小续命汤治疗缺血性卒中的作用机制。方法采用网络数据库获取小续命汤的成分及其对应的作用靶点、缺血性卒中的疾病靶点,Venny 2.1.0软件获取成分-疾病靶点交集,STRING数据库进行蛋白互作(PPI)分析获得核心靶点,Bioconductor软件包进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。以脑缺血再灌注大鼠模型观察小续命汤对脑梗死面积、神经功能缺损评分、关键靶点的影响。结果数据库检索获得126种活性成分和57个关键靶点,GO富集分析得到细胞因子受体结合、细胞因子活性、磷酸酶结合等74个分子功能条目,KEGG富集分析得到流体剪切应力和动脉粥样硬化、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、IL-17等124条信号通路。动物实验表明,小续命汤可减少大鼠脑梗死面积百分比,减轻神经功能缺损,下调IL-6、VEGFA、TP53表达。结论小续命汤具有多种活性成分,通过调控IL-6、VEGFA、TP53等多靶点,减少脑梗死面积,减轻神经功能缺损,进而发挥治疗缺血性卒中的作用。
关键词
小续命汤
缺血性卒中
网络药理学
IL-6
VEGF
P53
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
R966 [医药卫生—药理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接研究罗布麻抗抑郁机制
徐莉莉
李祥婷
张雯
蔡定芳
王飞
向军
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于网络药理学和动物实验探讨小续命汤治疗缺血性卒中的作用机制
王飞
徐莉莉
张雅珍
兰瑞
向军
李祥婷
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023
8
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