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基于孕激素受体基因的类人猿亚目的分子系统学研究
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作者 陈曹逸 Derek Wildman +4 位作者 朱新宇 刘伟 王康乐 苏敏 谭湘陵 《四川动物》 CSCD 北大核心 2011年第1期11-15,共5页
通过对类人猿亚目中部分种类的孕激素受体基因进行分析,重建类人猿亚目的系统发育关系。扩增并测定了来源于14个属的类人猿亚目物种的孕激素受体编码区序列,并基于这一序列数据,分别采用邻接法、最大简约法和最大似然法重建了系统发育... 通过对类人猿亚目中部分种类的孕激素受体基因进行分析,重建类人猿亚目的系统发育关系。扩增并测定了来源于14个属的类人猿亚目物种的孕激素受体编码区序列,并基于这一序列数据,分别采用邻接法、最大简约法和最大似然法重建了系统发育关系。除了阔鼻下目,3种方法构建的系统发生树的拓扑结构类似且各节点支持率高。重建的人猿超科和猴超科内部亲缘关系支持多数人所认可的分类系统。本研究为黑猩猩和人的姐妹群关系提供了证据,提示黑猩猩比大猩猩或其他猿猴更接近人类。阔鼻下目中蜘蛛猴科、卷尾猴科和僧面猴科三者之间的系统发育关系在本研究中未得到很好辨析。 展开更多
关键词 孕激素受体基因 系统发育关系 类人猿亚目
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人乙型肝炎病毒包膜蛋白多态性的生物信息学分析及其意义 被引量:6
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作者 陈喆 朱悦 +1 位作者 李亦学 闻玉梅 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期711-717,共7页
目的构建乙肝病毒生物数据库(Bio-HBV Database),针对HBV包膜蛋白序列进行多态性分析。方法构建Bio-HBV生物数据库获得国际基因序列库中所有完整的包膜蛋白并进行比对,采用信息熵评价序列位点的保守性,结合BLOSUM90评分系统和PAML(phylo... 目的构建乙肝病毒生物数据库(Bio-HBV Database),针对HBV包膜蛋白序列进行多态性分析。方法构建Bio-HBV生物数据库获得国际基因序列库中所有完整的包膜蛋白并进行比对,采用信息熵评价序列位点的保守性,结合BLOSUM90评分系统和PAML(phylogenetic analyses by maxi mumlikelihood)软件包寻找选择压力下的异常氨基酸替换模式。结果包膜蛋白中ps35,ps132,s49和s127等氨基酸替换具有高度的统计学意义。此外包膜蛋白内有多个重要区段,直接影响HBV生物学功能。我们对这些区段逐一分析了功能与结构的关系。结论通过Bio-HBV生物数据库,用生物信息学方法不仅验证了已知生物学特性的功能域的保守性,更提出了潜在的可以作为研究切入点的新功能域。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 包膜蛋白 多态性分析 前S1区 前S2区 S区
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PCR检测与细菌培养方法在细菌性痢疾监测中的应用比较 被引量:13
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作者 王松梅 郝志勇 +2 位作者 马景臣 杜琳 汪萱怡 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期766-769,775,共5页
目的通过与PCR检测比较,确定细菌培养方法对细菌性痢疾疾病负担的低估程度。方法从2002年细菌性痢疾监测研究获得的10105份腹泻标本中随机选取337份,采用针对ipa H基因的PCR方法检测其志贺菌感染,并同传统细菌培养方法进行比较。结果33... 目的通过与PCR检测比较,确定细菌培养方法对细菌性痢疾疾病负担的低估程度。方法从2002年细菌性痢疾监测研究获得的10105份腹泻标本中随机选取337份,采用针对ipa H基因的PCR方法检测其志贺菌感染,并同传统细菌培养方法进行比较。结果337份腹泻标本中检测到ipa H基因212份,检出率为62.9%;而粪便培养阳性为39份,检出率为11.6%(P<0.001)。Logistic回归分析显示影响PCR检出的因素依次为细菌培养结果(OR=15.5;95%CI:2.0-119.0),具有发热症状(OR=2.8;95%CI:1.2-6.2),菌痢流行季节的腹泻(OR=2.4;95%CI:1.4-4.3)及女性病例(OR=1.8;95%CI:1.1-3.0)。结论与PCR检测相比,传统细菌培养方法使得菌痢的发病率在相当大的程度上被低估。 展开更多
关键词 发病率 志贺菌 实时PCR IPAH基因 粪便培养
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CpG寡脱氧核苷酸对慢性哮喘小鼠模型气道炎症的预防作用 被引量:4
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作者 金美玲 揭志军 +3 位作者 蔡映云 袁正宏 胡芸文 任涛 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期358-363,共6页
目的研究含非甲基化的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)寡脱氧核苷酸(CpG-oligodeoxynueleotides,CpG- ODN)能否预防或减轻慢性哮喘小鼠气道炎症的发生。方法40只雌性C57BL/6小鼠随机均分为4组,A组(慢性哮喘组)、B组(CpG-ODN干预组)和C组(GpC-... 目的研究含非甲基化的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)寡脱氧核苷酸(CpG-oligodeoxynueleotides,CpG- ODN)能否预防或减轻慢性哮喘小鼠气道炎症的发生。方法40只雌性C57BL/6小鼠随机均分为4组,A组(慢性哮喘组)、B组(CpG-ODN干预组)和C组(GpC-ODN对照组)分别腹腔注射卵蛋白致敏,然后用卵蛋白雾化吸入激发以制作慢性哮喘模型,D组(生理盐水对照组)用生理盐水进行致敏和激发。B组在致敏同时(d1, d14)和激发阶段(每2周1次)分别给予60μg/mLCpG-ODN腹腔注射,共6次。C组将CpG替换为鸟嘌呤-磷酸-胞嘧啶(GpC)作为对照。在末次激发24 h后,取血测嗜酸粒细胞(eosinophil,EOS)数,血清IgE、IgG1和IgG2α;收集支气管肺泡灌洗液(bronehoalveolar lavage fluid,BALF)作细胞分类计数;测定肺组织中白介素-4 (interleukin-4,IL-4)、白介素-13(interleukin-13,IL-13)和γ-干扰素的mRNA(interferon-γ,IFN-γ)表达量;以及肺组织病理学检查。结果A组外周血EOS数[(89±10)×104/mL]、血清IgE值[(279±53)ng/mL)、IgG1(A值2.151±0.628)、IgG2α(A值0.772±0.245)、BALF中EPS(6.3±1.3)]×105/mL)及百分比[(18.1±3.0)%]较D组明显增高(P<0.01);且肺组织中IL-4、IL-13和IFN-γ等细胞因子mRNA表达量[(分别为(5.72±3.89)×10-2、(9.45±5.91)×10-2和(3.23±1.69)×10-2)]也明显高于D组(P<0.05)。用CpG-ODN干预后(B组),除IgG2α(A值1.186±0.414)和IFNγmRNA表达量[(18.91±9.85)×10-2]增高外(P<0.05),其余指标均低于A组(P<0.05)。C组的上述各指标与A组相比差异均无显著性(P>0.05)。结论CpG- ODN对小剂量OVA反复激发所致的慢性气道炎症有一定的预防作用。 展开更多
关键词 慢性哮喘 气道炎症 CpG-寡脱氧核苷酸 小鼠
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CXCL10及其受体参与子宫内膜异位症发病的免疫机制初探
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作者 傅鹰 沈波 +4 位作者 余素飞 郑巧飞 徐巍 何小帆 孟哲峰 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2163-2167,共5页
目的:通过研究趋化因子配体10(CXCL10)及其受体(CXCR3)的表达,探讨其参与子宫内膜异位症(EM)发病的免疫机制。方法:分别运用ELISA法及化学发光分析法检测EM患者未经手术治疗组(76例)、经手术治疗组(10例)及正常体检人员组(76例)血清标本... 目的:通过研究趋化因子配体10(CXCL10)及其受体(CXCR3)的表达,探讨其参与子宫内膜异位症(EM)发病的免疫机制。方法:分别运用ELISA法及化学发光分析法检测EM患者未经手术治疗组(76例)、经手术治疗组(10例)及正常体检人员组(76例)血清标本中CXCL10及癌胚抗原CA125浓度;分离并体外活化EM患者组(10例)及正常体检人员组(10例)外周血单个核细胞(PBMC),ELISA法检测活化后PBMC培养上清液中CXCL10的分泌表达水平、流式细胞术检测活化PBMC的表面分化抗原3(CD3)及CXCR3表达、RT-PCR检测CX-CR3基因亚群(CXCR3A及CXCR3B)的表达;对结果进行统计分析。结果:血清CXCL10水平,EM患者未经手术治疗组、经手术治疗组及正常体检人员组间比较均具有显著差异(P<0.05);EM组与正常体检人员组比较:活化PB-MC培养上清液中CXCL10的表达水平无显著差异(P>0.05)、CD3+/CXCR3+PBMC细胞数无显著差异(P>0.05)、EM组高转录表达CXCR3B亚群而正常对照组表达CXCR3A亚群。结论:EM患者的血清CXCL10缺陷表达可能是参与EM发病的免疫机制之一;EM患者PBMC对细胞活化信号具有有效的免疫反应性,但活化后的PBMC细胞表面高表达的是CXCR3B亚群、而非具有趋化效应的CXCR3A亚群,推测EM通过此种免疫逃逸机制而发病。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 CXCL10 CXCR3 CXCR3B
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融合蛋白CXCL10-loop3-EGF的可溶性表达及其抗肿瘤效应研究
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作者 沈波 傅鹰 +3 位作者 孟哲峰 徐巍 何小帆 朱敏 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期2376-2380,共5页
目的:构建重组趋化因子CXCL10及表皮生长因子受体干扰序列融合蛋白(CXCL10-loop3-EGF),验证其靶向性抗肿瘤效应及抑制血管形成活性。方法:运用RT-PCR从经IFN-γ刺激活化的PBMC中扩增人CXCL10基因,运用重叠延伸PCR法扩增CXCL10-loop3-EG... 目的:构建重组趋化因子CXCL10及表皮生长因子受体干扰序列融合蛋白(CXCL10-loop3-EGF),验证其靶向性抗肿瘤效应及抑制血管形成活性。方法:运用RT-PCR从经IFN-γ刺激活化的PBMC中扩增人CXCL10基因,运用重叠延伸PCR法扩增CXCL10-loop3-EGF融合基因,并将其与载体pTG19-T连接、转化大肠杆菌DH5α、筛选阳性克隆,CXCL10-loop3-EGF融合基因与载体pET32a(+)连接、转化大肠杆菌Origami B(DE3),诱导可溶性表达重组his-CXCL10-loop3-EGF融合蛋白,并经镍柱亲和层析、酶切、超滤及透析等方法获得纯化的重组CXCL10-loop3-EGF融合蛋白。通过Transwell细胞趋化实验及HUVEC血管形成抑制实验验证此融合蛋白的抗肿瘤效应。结果:SDS-PAGE和Western blotting证实CXCL10-loop3-EGF融合蛋白构建成功,纯化后的融合蛋白具有显著的趋化活化PBMC活性及抑制HUVEC血管形成活性。结论:成功构建融合蛋白CXCL10-loop3-EGF,该蛋白具有较好的靶向性抗肿瘤活性。 展开更多
关键词 CXCL10-loop3-EGF融合蛋白 可溶性表达 抗肿瘤效应
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