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水稻S_5区候选克隆R2I19的筛选及序列信息学分析
被引量：
2
1
作者
王宏斌
刘兵
+3 位作者
易厚富
范云
刘良式
王金发
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期78-82,共5页
以水稻广亲和品种Cpslo17为材料 ,构建了一个覆盖 9倍核基因组的cosmid文库 ,其平均插入片段约4 0kb。以与广亲和位点紧密联锁的单拷贝分子标记BAC2 3D12的R末端为探针 ,从cosmid文库中筛选得到一个阳性克隆R2I19(～ 32kb)。结合S5位点...
以水稻广亲和品种Cpslo17为材料 ,构建了一个覆盖 9倍核基因组的cosmid文库 ,其平均插入片段约4 0kb。以与广亲和位点紧密联锁的单拷贝分子标记BAC2 3D12的R末端为探针 ,从cosmid文库中筛选得到一个阳性克隆R2I19(～ 32kb)。结合S5位点的高密度连锁图和物理图谱 ,初步确定为S5区候选克隆。对该克隆的 2个TAC亚克隆TRW15 10 (～ 15kb)及TRW15 17(～ 15kb)进行了初步的生物信息学分析 ,证实与已知的水稻基因组序列有很高的同源性 ,并显示其中可能含有与水稻育性相关的基因。
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关键词
S5区侯选克隆
R2I19
水稻
cosmid文库
广亲和基因
生物信息学
基因克隆
S5位点
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职称材料
DNA双链断裂损伤修复的随机模型研究
被引量：
1
2
作者
孙廷哲
崔隽
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期109-114,共6页
DNA双链断裂是一种非常严重的DNA损伤。对DNA双链断裂有效的修复对于维持基因组的稳定至关重要。对DNA双链断裂修复的动力学研究一直得到了广泛的关注。然而,以往的模型研究都没有充分考虑外源性和内源性DNA损伤修复之间的关联。因此,...
DNA双链断裂是一种非常严重的DNA损伤。对DNA双链断裂有效的修复对于维持基因组的稳定至关重要。对DNA双链断裂修复的动力学研究一直得到了广泛的关注。然而,以往的模型研究都没有充分考虑外源性和内源性DNA损伤修复之间的关联。因此,通过在细胞周期重启后引入自发生成的随机DNA双键断裂损伤,并设定触发细胞周期阻滞的阈值,一个精细化的Monte Carlo模型被构建并可以更好的模拟受迫状态下的损伤修复过程。细胞首先修复辐射刺激造成的DNA损伤,接着在总损伤水平低于特定阈值后产生内源性的DNA损伤并可能在某特定时间段内对两种来源损伤同时进行修复。本模型综合考虑了外源性和内源性DNA损伤修复的整合效应,为其它涵盖DNA损伤修复模块的模型研究提供了基础。
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关键词
DNA双链断裂
MONTE
CARLO模拟
外源性DNA损伤
内源性DNA损伤
修复
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职称材料
题名
水稻S_5区候选克隆R2I19的筛选及序列信息学分析
被引量：
2
1
作者
王宏斌
刘兵
易厚富
范云
刘良式
王金发
机构
基因工程教育部重点实验室∥中山大学生命科学学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期78-82,共5页
基金
科技部植物转基因重大专项资助项目 (J0 0 -A - 0 0 9)
广东省自然科学基金资助项目 (990 2 5 8)
文摘
以水稻广亲和品种Cpslo17为材料 ,构建了一个覆盖 9倍核基因组的cosmid文库 ,其平均插入片段约4 0kb。以与广亲和位点紧密联锁的单拷贝分子标记BAC2 3D12的R末端为探针 ,从cosmid文库中筛选得到一个阳性克隆R2I19(～ 32kb)。结合S5位点的高密度连锁图和物理图谱 ,初步确定为S5区候选克隆。对该克隆的 2个TAC亚克隆TRW15 10 (～ 15kb)及TRW15 17(～ 15kb)进行了初步的生物信息学分析 ,证实与已知的水稻基因组序列有很高的同源性 ,并显示其中可能含有与水稻育性相关的基因。
关键词
S5区侯选克隆
R2I19
水稻
cosmid文库
广亲和基因
生物信息学
基因克隆
S5位点
Keywords
rice( Oryza sativa L )
cosmid library
wide compatibility gene
bioinformatics
分类号
S511 [农业科学—作物学]
Q785 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
DNA双链断裂损伤修复的随机模型研究
被引量：
1
2
作者
孙廷哲
崔隽
机构
安庆师范
学院
生命科学
学院
基因工程教育部重点实验室∥中山大学生命科学学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期109-114,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31400714)
安徽省自然科学基金资助项目(1408085QC50)
文摘
DNA双链断裂是一种非常严重的DNA损伤。对DNA双链断裂有效的修复对于维持基因组的稳定至关重要。对DNA双链断裂修复的动力学研究一直得到了广泛的关注。然而,以往的模型研究都没有充分考虑外源性和内源性DNA损伤修复之间的关联。因此,通过在细胞周期重启后引入自发生成的随机DNA双键断裂损伤,并设定触发细胞周期阻滞的阈值,一个精细化的Monte Carlo模型被构建并可以更好的模拟受迫状态下的损伤修复过程。细胞首先修复辐射刺激造成的DNA损伤,接着在总损伤水平低于特定阈值后产生内源性的DNA损伤并可能在某特定时间段内对两种来源损伤同时进行修复。本模型综合考虑了外源性和内源性DNA损伤修复的整合效应,为其它涵盖DNA损伤修复模块的模型研究提供了基础。
关键词
DNA双链断裂
MONTE
CARLO模拟
外源性DNA损伤
内源性DNA损伤
修复
Keywords
DNA double strand breaks
Monte Carlo simulation
extrinsic DNA damage
intrinsic DNA damage
repair
分类号
Q6 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻S_5区候选克隆R2I19的筛选及序列信息学分析
王宏斌
刘兵
易厚富
范云
刘良式
王金发
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2002
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
DNA双链断裂损伤修复的随机模型研究
孙廷哲
崔隽
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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职称材料
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