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题名毛竹生长素反应因子基因的生物信息学分析及差异表达
被引量：6
- 1
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作者
程占超
侯丹
马艳军
高健
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机构
国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验
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出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期574-580,共7页
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基金
国家高技术研究发展计划(“863”计划)项目(2013AA102607-4)
国家自然科学基金资助项目(31570673)
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文摘
生长素反应因子(ARF)基因家族在植物的生长发育中起至关重要的作用。关于毛竹Phyllostachys edulis ARF基因家族在花器官中生物信息学分析未见报道。以毛竹花器官为材料,采用生物信息学的方法,对毛竹中ARF基因进行筛选,并对其系统进化关系、保守基序及在花器官中的差异表达模式进行了初步的分析。结果表明:毛竹全基因组中含有44个ARF基因,分为Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ类。与拟南芥Arabidopsis thaliana和水稻Oryza sativa分别比较,发现毛竹与水稻存在11个姐妹同源基因对。此外,Phe ARF13,Phe ARF14和Phe ARF35在花芽、雌蕊和幼胚中高量表达,同时Phe ARF2,Phe ARF30,Phe ARF14,Phe ARF13,Phe ARF35,Phe ARF7,Phe ARF37,Phe ARF38在雌蕊和幼胚中高量表达,推测这些基因可能在花发育和种子发育中发挥重要的作用。
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关键词
林木育种学
毛竹
生长素应答因子
花发育
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Keywords
forest tree breeding
Phyllostachys edulis
auxin response factors
floral development
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分类号
S722
[农业科学—林木遗传育种]
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题名毛竹PheMADS15基因的克隆及功能分析
被引量：2
- 2
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作者
程占超
马艳军
侯丹
刘俊
高健
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机构
国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验
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出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期421-426,共6页
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基金
国家高技术研究发展计划("863"计划)项目(2013AA102607-4)
国家自然科学基金资助项目(31570673)
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文摘
以毛竹Phyllostachys edulis花为材料,通过聚合酶链式反应(PCR)克隆技术从毛竹中分离得到1个含完整编码区的cDNA,长603 bp,编码200个氨基酸。命名为Phe MADS15(Gen Bank登记号:KU721916)。对PheMADS15进行分析表明,该基因具有典型的MADS-box基因结构域,与拟南芥Arabidopsis thaliana的A类基因AP1编码蛋白的同源性为58.65%。通过实时荧光定量聚合酶链式反应(q RT-PCR)克隆技术检测了Phe MADS15在毛竹花芽、苞片、颖片、稃片、浆片、雄蕊、雌蕊和幼胚中的相对表达量。分析表明:Phe MADS15基因在毛竹花发育的初期表达量最高,主要在花芽中表达,可能参与毛竹成花转变过程。
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关键词
林木育种学
毛竹
PheMADS15
MADS-BOX
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Keywords
forest tree breeding
Phyllostachys edulis
PheMADS15
MADS-box
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分类号
S722.3
[农业科学—林木遗传育种]
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