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高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组分析比较
被引量：
5
1
作者
王平
丛玲
+4 位作者
王春语
朱振兴
A Ashok Kumar
张丽霞
陆晓春
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期42-47,共6页
线粒体基因组易位是导致作物细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS)性状产生的重要遗传机制。比较高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组,寻找易位区为克隆高粱A1型细胞质雄性不育相关基因奠定基础。以高粱A1型细胞...
线粒体基因组易位是导致作物细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS)性状产生的重要遗传机制。比较高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组,寻找易位区为克隆高粱A1型细胞质雄性不育相关基因奠定基础。以高粱A1型细胞质雄性不育系Tx623A和其保持系Tx623B为试验材料,采用二代Illumina Hiseq结合三代PacBio测序技术,对2个样品的线粒体基因组进行组装,比较和分析不育系和保持系基因组结构和基因差异。高粱Tx623A和Tx623B线粒体基因组大小分别为449 727 bp和452 772 bp,预测编码开放阅读框(Open reading frame,ORFs)分别为147和145个,且两基因组特有基因分别为8个和6个。两线粒体基因组共线性比较分析,发现存在一个57 kb的基因组片段易位的结构变异(Structural variation,SV)区域,该易位区可能与A1型细胞质雄性不育有关。Tx623A和Tx623B线粒体基因组中易位区为高粱A1型细胞质雄性不育基因克隆提供了基因组信息。
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关键词
高粱
不育系
保持系
线粒体基因组
细胞质雄性不育
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职称材料
题名
高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组分析比较
被引量：
5
1
作者
王平
丛玲
王春语
朱振兴
A Ashok Kumar
张丽霞
陆晓春
机构
辽宁省农业科学院高粱
研究所
国际热带半干旱地区作物研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期42-47,共6页
基金
国家重点研发计划(2018YFD1000701,2018YFD1000700)
国家自然科学基金项目(31500203,31501241)
国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-06-13.5-A3)
文摘
线粒体基因组易位是导致作物细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS)性状产生的重要遗传机制。比较高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组,寻找易位区为克隆高粱A1型细胞质雄性不育相关基因奠定基础。以高粱A1型细胞质雄性不育系Tx623A和其保持系Tx623B为试验材料,采用二代Illumina Hiseq结合三代PacBio测序技术,对2个样品的线粒体基因组进行组装,比较和分析不育系和保持系基因组结构和基因差异。高粱Tx623A和Tx623B线粒体基因组大小分别为449 727 bp和452 772 bp,预测编码开放阅读框(Open reading frame,ORFs)分别为147和145个,且两基因组特有基因分别为8个和6个。两线粒体基因组共线性比较分析,发现存在一个57 kb的基因组片段易位的结构变异(Structural variation,SV)区域,该易位区可能与A1型细胞质雄性不育有关。Tx623A和Tx623B线粒体基因组中易位区为高粱A1型细胞质雄性不育基因克隆提供了基因组信息。
关键词
高粱
不育系
保持系
线粒体基因组
细胞质雄性不育
Keywords
Sorghum bicolor
sterile line
maintainer line
mitochondrial genome
cytoplasmic male sterility
分类号
S514 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高粱A1型细胞质雄性不育系与保持系线粒体基因组分析比较
王平
丛玲
王春语
朱振兴
A Ashok Kumar
张丽霞
陆晓春
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
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