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题名思茅松HMGS基因的克隆与表达分析
被引量：2
- 1
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作者
李云琴
原晓龙
李江
王毅
陈伟
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机构
云南省森林植物培育与开发利用重点实验室
国家林草局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
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出处
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2020年第4期428-432,共5页
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基金
云南省林业科学院创新基金资助项目(MS2019-02,QN2018-01)
国家林业公益性行业科研专项资助项目(201304105)。
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文摘
为研究3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶基因(HMGS)在思茅松二萜类生物合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从思茅松中获得3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶基因的cDNA序列。序列分析显示,该基因全长1 425 bp,编码474个氨基酸,属于HMGS基因家族。序列比对分析显示PkHMGS基因所编码的氨基酸序列拥有HMGS家族蛋白特有的保守序列GNTEIEGVDSTNACYGGTA,与樟子松HMGS的蛋白序列同源性为99.79%。系统进化分析显示,思茅松与裸子植物的HMGS聚为1支,与樟子松的亲缘关系最近。荧光定量PCR分析表明,在思茅松的树皮中HMGS基因的表达明显受到割脂物理伤害的诱导,在高产脂思茅松松针表达量最高。结果为揭示思茅松高产脂的分子机理提供理论依据。
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关键词
思茅松
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A
合酶
基因克隆
生物信息学分析
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Keywords
Pinus kesiya var.langbianensis
3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase
cloning
bioinformatics
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分类号
Q753
[生物学—分子生物学]
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题名西南桦肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析
被引量：2
- 2
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作者
李云琴
金智伟
严毅
原晓龙
王毅
张劲峰
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机构
云南省林业和草原科学院
昆明市海口品林场
云南省森林植物培育与开发利用重点实验室
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出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2020年第5期18-22,29,共6页
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基金
云南省重点研发计划-农业领域(2018BB006)
云南省重点研发计划-农业领域(2018BB007)
+1 种基金
APFNet(2019P3-CAM)
分子生物学研究团队(LKYTD-2020-001)。
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文摘
为研究肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)在西南桦木质素合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到1个具完整开放阅读框的肉桂酰CoA还原酶基因(BaCCR),该基因全长975 bp,编码324个氨基酸。序列比对分析显示西南桦CCR蛋白序列与胡桃、欧洲栓皮栎、梅、甜樱桃的蛋白序列相似性均在80%以上。BaCCR拥有CCR蛋白的NADP结合域和底物结合域KNWYCYGK。进化分析表明,BaCCR与梅、甜樱桃、亚洲棉、葡萄聚为一个枝系。转录模式分析表明,BaCCR基因在根和小枝中高量表达。
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关键词
西南桦
肉桂酰辅酶A还原酶
基因克隆
基因表达
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Keywords
Betula alnoides
Cinnamoyl-CoA reductase
gene cloing
gene expression
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分类号
S796
[农业科学—林木遗传育种]
S718.46
[农业科学—林学]
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题名桑黄9个萜类合成酶基因的鉴定及表达分析
- 3
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作者
李云琴
王毅
张子蕴
原晓龙
杨焱
杨文忠
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机构
云南省林业和草原科学院
云南省森林植物培育与开发利用重点实验室
上海市农业科学院食用菌研究所
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出处
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2021年第4期402-409,共8页
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基金
国家自然科学基金项目(31860177)
云南省应用基础研究计划面上项目(2021FB218)
+1 种基金
2019中央引导地方发展专项基金项目(云南松研究开发中心建设)
云南省林业和草原科学院创新基金项目(MS2019-09)。
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文摘
为了解高等药用真菌桑黄的萜类合成酶(TPS)基因的功能,从桑黄全基因组中分离获得TPS基因,并对其进行生物信息学分析、系统发育树构建,分析其在不同碳源和氮源培养条件下的表达情况。结果表明:在桑黄基因组中分离出9个SsTPS基因,除SsTPS2蛋白质没有特征基序外,其余SsTPS蛋白质均具有TPS的典型特征基序;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。9个SsTPS聚为2个支系,初步推测SsTPS1为倍半萜合成酶,且可以催化合成α-muurolene;SsTPS3、SsTPS4、SsTPS5、SsTPS9属于倍半萜合成酶,SsTPS3和SsTPS5合成δ-cadinene的类似物或衍生物,SsTPS4和SsTPS9分别合成β-copaene、α-muurolene的类似物或衍生物;Ss TPS2为三萜合成酶。Ss TPS1、Ss TPS4、Ss TPS6基因在所有培养基中均不表达,其余基因呈现差异化表达,Ss TPS7仅在添加肌醇为碳源、大豆蛋白粉为氮源的培养基中低量表达;Ss TPS2、Ss TPS3、Ss TPS5、Ss TPS8、Ss TPS9分别在添加果糖为碳源、大豆蛋白粉为氮源、牛肉浸粉为氮源、酵母粉为氮源、香蕉粉为氮源的培养基中表达量最高。基因簇分析显示,Ss TPS1和Ss TPS4编码基因所在contig有基因簇的存在。
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关键词
桑黄
萜类合成酶
生物信息学分析
基因表达
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Keywords
Sanghuangporus sanghuang
terpene synthase
bioinformatics analysis
gene expression
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分类号
Q786
[生物学—分子生物学]
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