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羽翈中DNA和糖皮质激素共提取技术的研究 被引量:1
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作者 于梦佳 刘思霞 +7 位作者 周雨 张馨元 任晓彤 周永恒 杨守庄 李志刚 徐艳春 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2024年第4期800-810,共11页
羽毛是鸟类研究、监测和管理中常用的非损伤性材料,可从中提取DNA和激素进行遗传和生理分析。然而,作为高度角化的组织,羽翈中的DNA和激素含量极低,提取较为困难。本研究开发一种能够从羽翈中同时提取总DNA和糖皮质激素的方法,命名为DH-... 羽毛是鸟类研究、监测和管理中常用的非损伤性材料,可从中提取DNA和激素进行遗传和生理分析。然而,作为高度角化的组织,羽翈中的DNA和激素含量极低,提取较为困难。本研究开发一种能够从羽翈中同时提取总DNA和糖皮质激素的方法,命名为DH-CoEx。以丹顶鹤(Grus japonensis)、绿孔雀(Pavo muticus)为代表的大型鸟类廓羽、尾上覆羽和以栗鹀(Emberiza rutila)、小鹀(E.pusilla)为代表的小型鸟类飞羽、绒羽进行测试和评估。结果显示:DH-CoEx能有效从完全角化的羽翈中同时提取出总DNA及糖皮质激素(皮质醇);从5 mg样本中提取的线粒体DNA(mtDNA)拷贝数达到104量级,可支持长达1350 bp的片段扩增;所提取的核DNA(nuDNA)质量足以进行长达200 bp的微卫星等位基因分型,成功率为98.11%~99.60%;提取的皮质醇含量达到了传统单一提取激素方法的水平,足以进行相关生理学分析。以上结果说明,DH-CoEx是一种简易、高效和适用性广泛的方法,实现了角化材料总DNA和糖皮质激素的共提取,可以支持mtDNA和微卫星等分子标记的分析和应激激素的分析,极大地提高了羽毛的利用率,具有广泛的应用潜力。 展开更多
关键词 羽毛 DNA 糖皮质激素 共提取 非损伤性采样
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利用下颌骨形态鉴别野生和饲养北美水貂的研究 被引量:2
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作者 刘博洋 孟庆博 +3 位作者 祁永来 徐艳春 华彦 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2021年第2期376-385,共10页
当前,我国法律明令禁止对濒危野生动物进行猎杀、滥食以及非法交易,但鼓励人工饲养种群的规模化养殖和商业化利用。这引起一个重要问题:即从野外非法猎取的野生动物,会假借人工驯养繁殖的名义合法地进入市场,这对执法部门如何精准鉴定... 当前,我国法律明令禁止对濒危野生动物进行猎杀、滥食以及非法交易,但鼓励人工饲养种群的规模化养殖和商业化利用。这引起一个重要问题:即从野外非法猎取的野生动物,会假借人工驯养繁殖的名义合法地进入市场,这对执法部门如何精准鉴定动物来源造成了极大的困扰。现有的依靠骨密度和头骨形态的鉴定方法不能满足需求。本研究以野外水貂(n=25)和人工驯养水貂(n=38)的下颌骨为对象,建立一个更为简便而有效的鉴别方法。下颌骨与咬肌构成一个杠杆系统,髁状突为支点,前臼齿和臼齿的齿尖为阻力点,各个齿尖到髁状突的距离为阻力臂。我们推测,野生水貂的食物质地较为坚硬,而人工饲养的动物食物柔软,因而野生水貂捕食和进食时需要更大的咬合力和咬合效率。这一差异在个体发育过程中很可能导致阻力臂结构发生变化。如果这种变化足够明显,就可以据此建立动物来源的判别指标。通过测定髁状突到前臼齿第3齿尖以及臼齿上的下原尖和下前尖的阻力臂、齿冠长及齿尖高等数据,建立了13个判别指标,利用这些指标分析野生与饲养个体间的差异并进行判别分析,以已知来源个体的正确回判率来评价其有效性。结果显示,与野生组相比,人工饲养水貂下颌咬合杠杆的阻力臂更长,支持了我们的推测。在13个判别指标中,H_(2)/L_(2)(臼齿下前尖高和其力臂长之比)和CosA(犬齿沿矢状面的倾角)无性别差异,二者联合使用时,已知来源个体的正确回判率可达到91.20%,具有很强的鉴别能力。由于水貂是典型的小型食肉动物,因此本研究的结果对其他小型食肉动物的鉴别也具有重要的参考意义。 展开更多
关键词 水貂 来源鉴别 下颌骨 咬合杠杆
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十一个DNA甲基化位点对野生与圈养环颈雉鉴别能力的评价
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作者 林力钧 王文慧 +6 位作者 张琦 杜宇佳 刘姿仪 陈晓琳 高鹏 徐艳春 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2025年第1期135-142,共8页
过度开发、非法猎捕和利用野生动物资源已经成为威胁生物多样性的重要因素。将野外非法获取的动物混入合法养殖动物中掩盖违法犯罪的行为层出不穷,因此需要从科学鉴定角度区分不同来源的动物。骨骼肌是非法猎捕和贸易的主要目标产品,但... 过度开发、非法猎捕和利用野生动物资源已经成为威胁生物多样性的重要因素。将野外非法获取的动物混入合法养殖动物中掩盖违法犯罪的行为层出不穷,因此需要从科学鉴定角度区分不同来源的动物。骨骼肌是非法猎捕和贸易的主要目标产品,但尚没有有效的方法鉴别其来源。本研究以被归入《国家畜禽资源目录》的新型家禽,同时又是“三有”物种的环颈雉(Phasianus colchicus)为例,采用甲基化敏感性高分辨率熔解曲线技术(methylation-sensitive high resolution melting,MS-HRM)测试了26个甲基化水平在野生和圈养环颈雉之间具有潜在差异的位点,得到11个可以稳定检测的位点。统计分析发现,LOC116232884、NFATC2、FGF9-3、FGF9-2、MAPK8、DUSP10和MYCN七个位点在两组间的甲基化水平差异达到显著或极显著水平(P=0.000~0.004),各位点整体正确鉴别率为62.22%~82.78%,累积鉴别能力可达99.99993%。研究结果为建立鉴别野生和圈养环颈雉的方法提供了位点资源和检测方法,也为解决其他同类物种的鉴别问题提供了借鉴。 展开更多
关键词 环颈雉 来源鉴别 野生 圈养 DNA甲基化
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梅花鹿粪便中线粒体DNA D-loop区异质性的研究
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作者 高雨薇 李晓达 +8 位作者 周永恒 林力均 杨金城 储佳宁 王文慧 张琦 于梦佳 徐艳春 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2025年第3期564-572,共9页
线粒体DNA(mtDNA)的异质性(heteroplasmy)是多种不同序列的mtDNA拷贝共存于一个个体的现象,对线粒体、细胞和组织的机能产生明显的影响。粪便是野生动物研究中最易得的材料,含有动物肠上皮脱落的细胞及其DNA,其中的mtDNA异质性可以反映... 线粒体DNA(mtDNA)的异质性(heteroplasmy)是多种不同序列的mtDNA拷贝共存于一个个体的现象,对线粒体、细胞和组织的机能产生明显的影响。粪便是野生动物研究中最易得的材料,含有动物肠上皮脱落的细胞及其DNA,其中的mtDNA异质性可以反映个体在各种因素影响下肠上皮细胞DNA的稳定性,为揭示个体的适合度、生态对策等提供新的线索。梅花鹿(Cervus nippon)是森林生态系统中的关键物种,其肠上皮中mtDNA异质性的特点尚未见报道。本研究用27只6~96月龄的圈养梅花鹿粪便样本,采用PCR扩增子高通量测序技术,对mtDNA D-loop区的异质性进行定量分析。结果显示:D-loop区广泛分布着异质性位点,但相对集中于第175~368位碱基的高变区(HyperHPR),而第597~687位碱基区间则较少发生,为保守区(Hy⁃poHPR)。HyperHPR异质性突变的多样性(HDα)极显著高于HypoHPR(P<0.001)。转换(T_(S))是主要碱基替换类型,其发生频率远高于颠换(T_(V))。HyperHPR中T_(S)/T_(V)平均为0.11,而HypoHPR平均为0.19,说明异质性突变在HypoHPR受到更强的选择性清除。无论是在D-loop区、HyperHPR与HypoHPR,雌雄个体之间异质性突变指标均无显著差异(D-loop区,|t|=0.273,P=0.787;HyperHPR,|t|=0.409,P=0.686;Hy⁃poHPR,|t|=0.793,P=0.435)。此外,HyperHPR的异质性频率与月龄之间存在显著正相关关系(R^(2)=0.132,P=0.035),使整个D-loop区也具有近乎显著的趋势(R^(2)=0.104,P=0.056)。但是,异质性突变各项指标均与性别无关(P=0.435~0.787)。以上结果表明,肠上皮细胞的D-loop区作为接近中性进化的非编码区,能够保留大量的异质性突变,但对T_(V)突变产生明显的选择性清除,特别是保守区域对T_(S)和T_(V)均有强烈的清除作用,从而使异质性突变形成的mtDNA多样性控制在一个相对正常的范围内。年龄是影响异质性水平的重要因素,性别的影响较小。研究结果为利用粪便研究肠上皮的稳定性与环境的关系提供了新的视角。 展开更多
关键词 梅花鹿 粪便DNA 线粒体异质性 年龄
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线粒体Cyt b基因对九种穿山甲鉴别力的分析
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作者 韩松霖 马跃 +4 位作者 李波 刘微 穆佳童 徐艳春 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2025年第1期50-62,共13页
为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))... 为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))计算的遗传距离具有最优的物种分辨率;Cyt b基因全序列有较好的物种鉴别能力,其中,第301~400号和第851~950号的2个碱基序位片段组合时具有最高的物种分辨率,是鉴别9种穿山甲的最佳理论区段。现有的方法中推荐使用Kocher等的引物。今后在研发中采用多重PCR结合高通量测序对多片段组合进行分析,将会提高穿山甲的鉴别力。 展开更多
关键词 穿山甲 细胞色素b基因(Cyt b) 遗传距离 物种鉴定
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一例华南虎纤维组织瘤样增生的诊治
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作者 龚志海 雷胜桥 +4 位作者 杨金城 陆洪敏 李婉婷 徐艳春 张乐 《野生动物学报》 北大核心 2025年第3期656-661,共6页
韶关某繁育基地一只14岁雄性华南虎(Panthera tigris amoyensis)右前脚掌背皮肤出现破损红肿,且肿块日渐增大。专家初步诊断该肿块为良性肿瘤,并实施切除手术。通过血常规、生化指标检查、分子生物学以及病理组织学技术进行检查与诊断分... 韶关某繁育基地一只14岁雄性华南虎(Panthera tigris amoyensis)右前脚掌背皮肤出现破损红肿,且肿块日渐增大。专家初步诊断该肿块为良性肿瘤,并实施切除手术。通过血常规、生化指标检查、分子生物学以及病理组织学技术进行检查与诊断分析,结果显示:患虎血细胞比容、平均红细胞体积和平均红细胞血红蛋白含量3项指标降低,丙氨酸氨基转移酶和天冬氨酸氨基转移酶显著升高且存在立克次氏体感染。此外,病理组织学鉴定切除肿块为纤维组织瘤样增生,为良性肿瘤。这一病例报导,可为虎此类疾病的诊断及防控提供经验。 展开更多
关键词 华南虎 瘤样增生 病例
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3种鸫科鸟类的性别鉴定研究 被引量:1
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作者 王东权 刘丽 +1 位作者 安博洋 李波 《安徽农业科学》 CAS 2020年第15期92-95,共4页
通过形态学与分子生物学方法对3种鸫科(Turdidae)鸟类赤颈鸫(Turdus ruficollis)、红尾鸫(Turdus naumanni)、斑鸫(Turdus eunomus)进行性别鉴定。以CHD基因性别鉴定为基准,讨论形态学与微卫星性别鉴定的准确率与可行性。结果表明,3种... 通过形态学与分子生物学方法对3种鸫科(Turdidae)鸟类赤颈鸫(Turdus ruficollis)、红尾鸫(Turdus naumanni)、斑鸫(Turdus eunomus)进行性别鉴定。以CHD基因性别鉴定为基准,讨论形态学与微卫星性别鉴定的准确率与可行性。结果表明,3种鸫科鸟类中赤颈鸫能够通过形态学进行性别鉴定,其准确率为0.89%;红尾鸫与斑鸫的性别鉴定准确率仅为0.57%和0.38%,无法通过形态学进行有效的性别鉴定。形态学性别鉴定存在局限性,受鸟类年龄、季节、地区的影响明显,并且对个体特征不清晰或个体残缺样本不能进行有效鉴定。此次试验中99只个体仅73只具有完整形态,剩余个体只能通过分子生物学方法进行性别鉴定。微卫星鉴定与CHD基因性别鉴定结果存在不一致的现象,总体准确率仅0.88%,且鉴定错误的12只个体均是将雄性鉴定为雌性,原因可能是该微卫星位点跨物种使用时与性别连锁度降低。相较于微卫星鉴定需要毛细管电泳分型,CHD基因性别鉴定方法只需要对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,该鉴定方法更简便、成本更低。 展开更多
关键词 鸫科鸟类 性别鉴定 形态学 微卫星 CHD基因
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毛干DNA提取中四种细菌清除方法的比较研究
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作者 周永恒 马跃 +2 位作者 崔靓玉 徐艳春 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2020年第4期924-929,共6页
毛发(无根)作为一种非损伤性的生物样本,在保护遗传学和分子生态学研究中发挥着十分重要的作用。以毛干中提取的DNA为模板做PCR扩增时,mtDNA片段扩增效果较好,但核基因的扩增成功率极低。人们将其归因于核DNA质低量少所致。然而我们在... 毛发(无根)作为一种非损伤性的生物样本,在保护遗传学和分子生态学研究中发挥着十分重要的作用。以毛干中提取的DNA为模板做PCR扩增时,mtDNA片段扩增效果较好,但核基因的扩增成功率极低。人们将其归因于核DNA质低量少所致。然而我们在前期研究中发现,从毛干中得到的总DNA混有大量的细菌DNA,是导致核基因扩增困难的主要因素之一。为此我们尝试建立一种高效、快速、低成本,而且不影响DNA提取的清除毛干细菌的方法。本研究以蓝狐被毛为材料,经过普通清洗后,以4种方法处理毛干,随后使用磁珠法进行总DNA提取,并通过荧光定量PCR检测总DNA中细菌DNA的含量,以此评估4种方法的有效性。结果表明,未经处理的毛干(V#1—V#3样本)总DNA中,mtDNA和细菌pDNA的Ct值分别为(15.53±0.15)和(16.82±0.03),二者的比值为(0.923±0.009)。以SDS和NaOH(方案I)、溶菌酶(方案II)和triton X-100(方案III)处理的毛干样本,细菌DNA的含量没有明显降低。用65℃的4 mol/L NaOH溶液处理毛干样本20 s(方案IV),可把pDNA的拷贝数降低近1000倍,而动物DNA的拷贝数没有明显降低。延长处理时间至35 s以上会降低DNA的提取效果甚至提取失败。因此,我们推荐在提取毛干总DNA之前,采用方案IV处理毛干样品。 展开更多
关键词 毛干 清洗 DNA提取 细菌DNA
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马来穿山甲和中华穿山甲鳞片编码系统及鳞片差异性 被引量:3
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作者 郭策 逯金瑶 +7 位作者 李思源 姜宇泽 梁春芳 华彦 李波 李立 唐松元 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2022年第1期24-31,共8页
鳞片是研究穿山甲(Manis spp.)的生物学特性和种类、个体鉴定的重要材料,鳞片的形态在穿山甲身体上具有渐变性,只有同部位才具有可比性,因此,开展相关工作需要首先确定鳞片所处的身体部位,为此建立了马来穿山甲(M.javanica)和中华穿山甲... 鳞片是研究穿山甲(Manis spp.)的生物学特性和种类、个体鉴定的重要材料,鳞片的形态在穿山甲身体上具有渐变性,只有同部位才具有可比性,因此,开展相关工作需要首先确定鳞片所处的身体部位,为此建立了马来穿山甲(M.javanica)和中华穿山甲(M.pentadactyla)全身鳞片(头部除外)的编码系统,并对其鳞片位置及数量进行比较分析。该编码系统对穿山甲颈部、躯干、四肢、尾部的每一枚鳞片均进行编码,每枚鳞片在坐标系中都有固定的位置。通过这一系统,可以便捷地统计各个部位鳞片的数量,比较部位之间、个体之间、物种之间鳞片数量和对应鳞片相对位置的差异。利用鳞片分布热图揭示出,全身鳞片总数、躯干部鳞片行数、尾缘鳞单侧鳞片数、四肢鳞片数等均具有显著的种内变异和种间差异(P<0.001)。此外,马来穿山甲尾腹部鳞片颜色比尾背部颜色浅,中华穿山甲尾腹部鳞片与尾背部鳞片颜色一致;马来穿山甲前肢最后一纵列鳞片逆向生长,与前一纵列的鳞片成“人”字状拱起。这些特征可作为鉴别马来穿山甲和中华穿山甲的重要依据。 展开更多
关键词 穿山甲 鳞片 编码系统
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发酵床微生物群落构成及其对圈养绿狒狒的影响 被引量:1
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作者 潘麒嫣 朱迎娣 +4 位作者 耿广耀 徐艳春 王爱善 黄晶 杨淑慧 《野生动物学报》 北大核心 2019年第3期571-579,共9页
为了改善冬季灵长类的福利,我们以绿狒狒为例,在上海动物园制做了发酵床来替代传统的硬质地面。2月中旬至3月下旬,监测了发酵床、笼舍和外部游客通道等处的环境温度变化、动物对发酵床的利用以及发酵床表层、25 cm、50 cm、75 cm深处的... 为了改善冬季灵长类的福利,我们以绿狒狒为例,在上海动物园制做了发酵床来替代传统的硬质地面。2月中旬至3月下旬,监测了发酵床、笼舍和外部游客通道等处的环境温度变化、动物对发酵床的利用以及发酵床表层、25 cm、50 cm、75 cm深处的微生物群落结构,评估发酵床对绿狒狒的影响。结果显示,发酵床经历一个生温发酵期后,逐渐进入稳定期,内部温度稳定在28℃—30℃之间。绿狒狒改变以往挤在取暖设备附近的行为,大部分时间都在发酵床上活动,翻动发酵床,寻找并采食里面滋生的各种甲虫和蠕虫。从发酵床上共检测到41个门的细菌。表层的细菌群落结构最为复杂,OTU数量、Chao1指数和Shannon指数都高于其他3个深度。在绿狒狒挖掘最大深度范围内,共检测到13个属的有益菌,总相对丰度为42.26%;潜在致病菌有4个属,总相对丰度为11.08%。试验期间,绿狒狒从行为、消化机能(基于粪便的判断)、精神状态等方面未见异常。上述研究结果说明,发酵床作为笼舍的地面对绿狒狒是安全的,并在冬季带来更好的福利。 展开更多
关键词 发酵床 绿狒狒 细菌群落 安全
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黑斑侧褶蛙蝌蚪皮肤抗菌肽最早表达时间的确定 被引量:1
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作者 Martina OPALIN 王情 +3 位作者 马跃 王碧霄 郭策 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2020年第4期1000-1008,共9页
两栖类动物的胚胎和蝌蚪期体表包被着由黏蛋白构成的胶体屏障,使其免受环境微生物的侵袭。这层屏障随着蝌蚪的发育逐渐变薄,保护作用逐渐减弱。与此同时,皮肤开始分泌抗菌肽作为补偿。但是,蝌蚪最早在哪个发育阶段开始分泌抗菌肽尚不清... 两栖类动物的胚胎和蝌蚪期体表包被着由黏蛋白构成的胶体屏障,使其免受环境微生物的侵袭。这层屏障随着蝌蚪的发育逐渐变薄,保护作用逐渐减弱。与此同时,皮肤开始分泌抗菌肽作为补偿。但是,蝌蚪最早在哪个发育阶段开始分泌抗菌肽尚不清楚。为了回答这一问题,本研究以东北地区黑斑侧褶蛙(Pelophylax nigromaculatus)蝌蚪为对象,研究了各个发育时期皮肤组织结构的变化和抗菌肽的表达情况,结果显示,在蝌蚪孵化之后,皮肤仅由1—2层细胞构成,大量的巨型细胞分泌黏液和微小色素颗粒;随着发育进程,皮肤表皮层逐渐加厚,到T3期(Gosner 26期)之后疏松层和致密层均开始加厚,并出现简单的颗粒腺和黏液腺。也是从这一时期皮肤开始表达抗菌肽。到T4期(Gosner 27—45期)和幼蛙期已经具备了成年蛙近似的皮肤结构和抗菌肽合成功能,形成了完备的先天免疫屏障。这些结果表明,蝌蚪皮肤免疫必须从物理屏障转换为化学屏障才能保证其生存和成功登陆,任何影响这一转换过程的因素都会通过扰动其免疫能力而影响其生存力,这为深入理解气候变化或环境污染等生态背景下两栖类种群波动的机制提供新的视角。 展开更多
关键词 黑斑侧褶蛙 蝌蚪 抗菌肽
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蓝狐母系起源及谱系重建 被引量:1
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作者 聂子涵 武晓宇 +4 位作者 孙锴 樊攀 魏来 刘志平 李波 《野生动物学报》 北大核心 2021年第4期1007-1014,共8页
蓝狐是圈养北极狐(Vulpex lagopus)的主要品种。因缺少科学有效的遗传管理,引进种兽后代逐年退化,造成反复引种的依赖性局面。为保持蓝狐种群的优良性状,开展科学选种选育、降低近交的概率,分析122只引进芬兰蓝狐的线粒体DNA D-Loop区29... 蓝狐是圈养北极狐(Vulpex lagopus)的主要品种。因缺少科学有效的遗传管理,引进种兽后代逐年退化,造成反复引种的依赖性局面。为保持蓝狐种群的优良性状,开展科学选种选育、降低近交的概率,分析122只引进芬兰蓝狐的线粒体DNA D-Loop区294 bp序列,结合已发表的野生、圈养北极狐种群单倍型数据进行母系追踪,应用11个微卫星位点的复合扩增对其中53只进行单亲亲权鉴定。结果表明:蓝狐种群仅有1种单倍型,血统单一,与瑞典养殖种群、西伯利亚野生种群关系密切。11个微卫星位点累计排除概率达到0.9999,成功为11只仔狐找到生物学父亲。同时发现,母狐经2次输精后成功受孕的概率较高(64%),以及同窝仔狐中存在多重父权的现象。因此,线粒体和微卫星等分子手段的引入,可以为蓝狐的遗传管理提供科学有效的依据。 展开更多
关键词 蓝狐 线粒体DNA 微卫星 亲权鉴定 遗传管理
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大熊猫粪便中mtDNA拷贝数与月龄的关系 被引量:1
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作者 任晓彤 周永恒 +5 位作者 李天峰 李仁贵 马跃 李德生 黄炎 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2022年第3期676-684,共9页
动物在生长发育不同阶段组织器官的代谢水平有所差异,线粒体DNA(mtDNA)的拷贝数在一定程度上反映了机体的生理状态和代谢强度。以64只大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)粪便DNA为材料,采用实时荧光定量PCR方法,验证了肠道上皮组织中平均... 动物在生长发育不同阶段组织器官的代谢水平有所差异,线粒体DNA(mtDNA)的拷贝数在一定程度上反映了机体的生理状态和代谢强度。以64只大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)粪便DNA为材料,采用实时荧光定量PCR方法,验证了肠道上皮组织中平均每个细胞mtDNA的拷贝数(N_(mpc))与月龄之间具有显著相关性(R^(2)=0.129,P=0.004),且呈现出随着月龄的增长而下降的趋势。幼龄个体的N_(mpc)远高于中、老龄个体,且个体差异很大。此外,性别对N_(mpc)也具有明显的影响,同一生长阶段的雄性比雌性更高。这些发现为进一步探究肠道上皮细胞mtDNA拷贝数与生长发育和衰老之间的关系,以及利用其作为指标来评估机体的生理状况提供了依据。 展开更多
关键词 大熊猫 粪便DNA mtDNA拷贝数 月龄
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一例雉科鸟类跨属杂交及其亲本物种的鉴定 被引量:1
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作者 杜焓瑜 匡高翔 +4 位作者 马跃 叶永红 李荣 李广龙 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2020年第4期1036-1046,共11页
动物园的混群饲养和展览模式导致鸟类跨种甚至跨属杂交频繁发生,明确杂交个体的亲本物种与其繁殖管理密切相关。2019年重庆动物园发现1只自然交配产生的雉科鸟类杂交个体,从其形态特征上初步推测亲本可能为环颈雉(Phasianus colchicus)... 动物园的混群饲养和展览模式导致鸟类跨种甚至跨属杂交频繁发生,明确杂交个体的亲本物种与其繁殖管理密切相关。2019年重庆动物园发现1只自然交配产生的雉科鸟类杂交个体,从其形态特征上初步推测亲本可能为环颈雉(Phasianus colchicus)、蓝孔雀(Pavo cristatus)或贵妃鸡(Gallus gallus domesticus)。本研究以此样本为例,建立了一套鉴定流程。首先,通过分子生物学方法确定了杂交个体的性别为雄性;然后,比较了该个体与3个疑似亲本物种雄性群体的8项形态学指标的欧氏距离,经过聚类分析判定其亲本为环颈雉和贵妃鸡。其次,采用线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列,计算该个体与3个疑似亲本物种的K2P遗传距离,构建NJ系统树显示该个体的母本为环颈雉。然后进一步利用15个微卫星位点,基于Nei氏遗传距离构建NJ树,发现该杂交个体与贵妃鸡遗传距离最近(0.166),与蓝孔雀的距离较远(0.535),判定其父本为贵妃鸡。以上研究为杂交个体亲本物种的鉴定提供两套可行的方案,形态学方案简单、低成本,但无法进一步区分父本和母本,且在测量过程中可能会造成动物应激反应;分子生物学方法可通过非损伤性采样避免应激,结果准确可靠,但成本较高,且受到微卫星标记的位点资源和种间通用性的限制。管理实践中可根据需要选择使用,或联合使用。 展开更多
关键词 雉科 跨属杂交 亲本物种鉴定
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云南玉溪绿孔雀遗传多样性分析:与圈养种群的比较 被引量:3
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作者 刘思霞 张馨元 +6 位作者 晏鸣霄 杜焓瑜 杨金城 李广龙 官文渊 杨守庄 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2022年第4期943-954,共12页
绿孔雀(Pavo muticus)是备受关注的濒危物种。我国南方曾广泛分布的云南亚种(P.m.imperator)目前收缩到中部、南部和西部的局部地区,近年来陆续开展了野外种群调查,但遗传多样性的分析和评估尚未开展。本研究利用从玉溪市新平和峨山交... 绿孔雀(Pavo muticus)是备受关注的濒危物种。我国南方曾广泛分布的云南亚种(P.m.imperator)目前收缩到中部、南部和西部的局部地区,近年来陆续开展了野外种群调查,但遗传多样性的分析和评估尚未开展。本研究利用从玉溪市新平和峨山交界处采集的野外绿孔雀自然脱落的羽毛,采用11对微卫星标记分析遗传多样性和结构,并与国内主要圈养种群(建群者来自瑞丽地区和其他未确定的地点)进行比较。结果表明:该野生种群的遗传多样性较低,受到近交的影响,遗传多样性进一步丢失的风险较高。遗传结构上,该野生种群和圈养种群的个体被划分为3个亚群,野生种群作为独立的1个亚群,在遗传上有别于圈养种群所含的2个遗传谱系,说明云南省分布的绿孔雀有着显著而复杂的地理分化。当前需要开展系统的谱系地理学研究,以加强族群之间的基因交流为目标,通过生态廊道或个体转移等方式增加遗传交流的机会,扭转遗传多样性随近交的深化而不断丢失的趋势。 展开更多
关键词 绿孔雀 遗传多样性 遗传结构 近交
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国境口岸截获象牙地理溯源分析初探 被引量:2
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作者 苏倡 高瑞芳 +3 位作者 陈进会 刘建丽 刘荭 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2022年第4期907-917,共11页
国境口岸截获象牙的地理溯源是识别非法象牙来源地,确定走私热点地区,描绘走私通道,有针对性地打击象牙非法贸易的重要前提。利用线粒体DNA单倍型溯源的方法,对我国的126份国境口岸截获象牙样本进行地理溯源。从126份样本中共得出22个... 国境口岸截获象牙的地理溯源是识别非法象牙来源地,确定走私热点地区,描绘走私通道,有针对性地打击象牙非法贸易的重要前提。利用线粒体DNA单倍型溯源的方法,对我国的126份国境口岸截获象牙样本进行地理溯源。从126份样本中共得出22个地理单倍型,为2个支系和7个进化枝。通过Loxodonta Localizer数据库比对分析,109份样本确定了地理来源,进而推断出3个来源地:中非刚果盆地的Tridom跨境生态保护区,东非的肯尼亚、坦桑尼亚和乌干达等国及非洲南部的KAZA跨境保护区。这3块地区也是目前国际公认的象牙盗猎最为严重的热点地区。将溯源结果与跨国犯罪组织的象牙偷猎、贩运和走私网络结合分析,将为海关缉私部门打击国际象牙走私链条提供有效的信息和关注重点。 展开更多
关键词 象牙 线粒体DNA 地理溯源
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基于线粒体Cyt b基因和CR序列的养殖貉(Nyctereutes procyonoides)种群遗传多样性和结构分析
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作者 魏宏达 李波 +4 位作者 魏来 刘志平 姜春明 史迎秋 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2021年第2期403-410,共8页
貉(Nyctereutes procyonoides)是一种重要的经济动物。经过50年的人工驯养繁育,国内养殖种群不断扩大,但对其遗传多样性和结构了解很少,难以开展有效的遗传管理。本研究分析了东北、华北地区养殖貉种群(N=160)的线粒体细胞色素b(Cyt b)... 貉(Nyctereutes procyonoides)是一种重要的经济动物。经过50年的人工驯养繁育,国内养殖种群不断扩大,但对其遗传多样性和结构了解很少,难以开展有效的遗传管理。本研究分析了东北、华北地区养殖貉种群(N=160)的线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和控制区(CR)序列,并与已经发表的同源序列进行比较。结果定义了5个Cyt b基因和6个CR序列单倍型,其中与俄罗斯产乌苏里亚种共享单倍型分别是3个和4个。种群遗传多样性分析表明,养殖貉种群单倍型多样性处于临界点(Hd=0.50)、核苷酸多样性处于较高水平(Pi>0.5%),但二者均明显低于俄罗斯野生乌苏里貉种群。这种遗传多样性模式可能主要是由奠基者效应(founder effect)导致的。此外,红褐色型貉遗传多样性水平显著低于野生型和白色型貉。系统发育分析表明国内养殖貉种群分为3个世系,主要是乌苏里亚种、与同亚种的俄罗斯野生种群亲缘关系密切。研究还发现有1个单倍型(CH5-DH5)与越南产指名亚种共享同一个单倍型世系。这说明建群引种中可能偶然引入了华南地区分布的指名亚种。综上分析,我国养殖貉种群已经出现遗传多样性下降的迹象,需要监控种群遗传多样性的变化,引入具有新基因型的野生貉种,制定科学的交配模式,避免近交衰退。 展开更多
关键词 遗传多样性 遗传结构 Cyt b基因 控制区(CR)
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头骨形态指标鉴别水貂来源有效性的评估
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作者 牟鑫 祁永来 +4 位作者 华彦 杨淑慧 Philip STOTT 刘振生 徐艳春 《野生动物学报》 北大核心 2021年第2期363-375,共13页
人工驯养野生动物是获取野生动物产品的重要手段,但是非法盗猎的野生动物产品以人工饲养的名义进入市场,就会对野生动物的保护形成挑战。因此,准确鉴别市场上的动物产品是来自养殖场还是野外,是保护野外种群,维持养殖业正常秩序的关键... 人工驯养野生动物是获取野生动物产品的重要手段,但是非法盗猎的野生动物产品以人工饲养的名义进入市场,就会对野生动物的保护形成挑战。因此,准确鉴别市场上的动物产品是来自养殖场还是野外,是保护野外种群,维持养殖业正常秩序的关键。本研究以北美水貂(Neovison vison)为例,基于颧骨内侧空间(ZAS)、颧宽(ZAA和ZBA)、颅基长(BSL)、下颌长(MDL)、眶后收缩(POC)和最大面部宽度(GFB)等量度,建立了9个头骨形态计量学指标:POC/GFB、POC/BSL、POC/MDL、ZAS SQRT/BSL、ZA SSQRT/MDL、ZBA×BSL/2ZAS、ZBA×MDL/2ZAS、ZBB×BSL/2ZAS和ZBB×MDL/2ZAS。野生组(n=32,9雄23雌)和饲养组(n=45,35雄10雌)的比较表明,除POC/GFB外,所有指标对于在两组样品之间均有显著差异,整体判别正确率为73.2%—85.5%。在性别已知的情况下,雄性的整体正确率为82.4%—93.8%,雌性为41.7%—85.7%。为此,应针对不同性别、不同来源的动物建立相应的参考数据,利用似然比进行鉴别。本研究的结果不仅可用于北美水貂的鉴别,也为其他小型食肉动物的鉴别提供经验。 展开更多
关键词 法医学 来源鉴定 头骨形态计量学 北美水貂 小型食肉动物
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