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小麦TaOEE1-2D基因的生物信息学及表达分析
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作者 赵鹏鹏 李鲁华 +3 位作者 任明见 洪鼎立 李欣 徐如宏 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期154-161,共8页
放氧增强蛋白1(oxygen-evolving enhancer protein 1,OEE1)是光系统Ⅱ(PSⅡ)中由PsbO基因编码的蛋白,在光系统的放氧活动中起到重要作用。为了进一步研究其生物学功能,对TaOEE1基因进行生物信息学、组织表达模式和逆境胁迫下的表达分析... 放氧增强蛋白1(oxygen-evolving enhancer protein 1,OEE1)是光系统Ⅱ(PSⅡ)中由PsbO基因编码的蛋白,在光系统的放氧活动中起到重要作用。为了进一步研究其生物学功能,对TaOEE1基因进行生物信息学、组织表达模式和逆境胁迫下的表达分析。转录组数据分析结果显示,TaOEE1-2D基因的表达量在小麦籽粒灌浆过程中呈下调趋势,并且在不同胁迫条件下呈现差异表达。生物信息学分析结果表明,TaOEE1-2D蛋白的氨基酸长度为328 aa,相对分子量为34428.93,总平均亲水性为-0.264,不稳定系数为37.05,为亲水性不稳定蛋白;TaOEE1-2D属于MSP超家族。二级结构分析结果显示,TaOEE1-2D由β-转角、α-螺旋、延伸链片层、无规则卷曲等二级结构组成,其中无规则卷曲占比最高,有153个氨基酸,占46.65%。TaOEE1-2D定位于叶绿体中,不具有跨膜结构域。顺式作用元件分析结果显示,TaOEE1-2D基因启动子区包含ABRE、MBS等相关顺式作用元件。进化树分析结果表明,TaOEE1-2D和TdOEE1-2B的亲缘关系最近,序列相似度为99.70%。组织特异性表达分析结果显示,TaOEE1-2D在叶中的相对表达量最高,在根中的相对表达量最低。PEG 6000与盐胁迫均能够显著下调TaOEE1-2D的相对表达量,表明TaOEE1-2D能响应非生物胁迫。 展开更多
关键词 小麦 TaOEE1 生物信息学 表达分析 非生物胁迫
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小麦TaMICU1-6A基因的克隆、生物信息学及表达分析
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作者 李欣 李鲁华 +4 位作者 任明见 安畅 洪鼎立 赵鹏鹏 徐如宏 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第5期42-51,共10页
为了探讨线粒体稳态调节蛋白TaMICU1基因在小麦生长发育中的功能,以小麦中国春为材料,对其TaMICU1-6A基因进行克隆、生物信息学分析、表达分析研究,结果表明,小麦TaMICU1-6A基因全长为1 398 bp,编码465个氨基酸,定位于线粒体,具有2个EF-... 为了探讨线粒体稳态调节蛋白TaMICU1基因在小麦生长发育中的功能,以小麦中国春为材料,对其TaMICU1-6A基因进行克隆、生物信息学分析、表达分析研究,结果表明,小麦TaMICU1-6A基因全长为1 398 bp,编码465个氨基酸,定位于线粒体,具有2个EF-hand家族的保守结构域,启动子含3种激素响应元件、3种光响应相关反应元件、1个缺氧特异性诱导相关元件;多重序列比对发现,其与野生二粒小麦、乌拉尔图小麦、小麦中的同源蛋白或同源基因的亲缘关系比较近。RT-PCR结果表明,TaMICU1-6A基因具有组织特异性,不同非生物胁迫、不同激素处理下在根、茎、叶中的表达水平不同。黑暗处理下,TaMICU1-6A基因在根、茎、叶中的表达水平均在6 h时达到最低;低温处理下,TaMICU1-6A基因在根、茎中的表达水平呈先降后升的趋势;在赤霉素处理下,TaMICU1-6A基因在叶片中的表达水平在6 h时达到最高。综上所述,推测TaMICU1-6A基因通过激素介导的信号途径参与不同的非生物胁迫。期待本研究结果可为进一步探讨小麦TaMICU1基因在逆境下的生物学功能提供一定的参考价值。 展开更多
关键词 小麦 TaMICU1基因 基因克隆 生物信息学分析 基因表达
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