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基于大豆胞囊线虫病抗性候选基因的SNP位点遗传变异分析
被引量：
6
1
作者
李英慧
袁翠平
+4 位作者
张辰
李伟
南海洋
常汝镇
邱丽娟
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1259-1264,共6页
以我国363份栽培和野生大豆资源为材料,对大豆胞囊线虫抗性候选基因(rhg1和Rhg4)的SNP位点(8个)进行遗传变异分析,以期阐明野生和栽培大豆间遗传多样性及连锁不平衡水平差异。结果表明,与野生大豆相比,代表我国栽培大豆总体资源多样性...
以我国363份栽培和野生大豆资源为材料,对大豆胞囊线虫抗性候选基因(rhg1和Rhg4)的SNP位点(8个)进行遗传变异分析,以期阐明野生和栽培大豆间遗传多样性及连锁不平衡水平差异。结果表明,与野生大豆相比,代表我国栽培大豆总体资源多样性的微核心种质及其补充材料的连锁不平衡水平较高(R2值为0.216)。在栽培大豆群体内,基因内和基因间分别有100%和16.6%的SNP位点对连锁不平衡显著,形成两个基因特异的连锁不平衡区间(Block)。在所有供试材料中共检测到单倍型46个,野生大豆的单倍型数目(27)少于栽培大豆(31),但单倍型多样性(0.916)稍高于栽培大豆(0.816)。单倍型大多数(67.4%)为群体所特有(31个),其中15个为野生大豆特有单倍型。野生大豆的两个主要优势单倍型(Hap_10和Hap_11)在栽培大豆中的发生频率也明显下降,推测野生大豆向栽培大豆进化过程中,一方面形成了新的单倍型,另一方面因为瓶颈效应部分单倍型的频率降低甚至消失。
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关键词
栽培大豆
野生大豆
SNP标记
遗传变异
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职称材料
题名
基于大豆胞囊线虫病抗性候选基因的SNP位点遗传变异分析
被引量：
6
1
作者
李英慧
袁翠平
张辰
李伟
南海洋
常汝镇
邱丽娟
机构
国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程农业部作物种质资源利用重点开放实验室中国农业科学院作物科学研究所
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1259-1264,共6页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30490251
30471096)
+4 种基金
国家高技术发展计划(863计划)项目(编号:2006AA100104
2006AA10Z164
2006AA10A111)
国家"十一五"科技支撑计划项目(编号:2006BAD13B05)
国家重点基础研究发展计划项目(编号:2004CB117203)资助
文摘
以我国363份栽培和野生大豆资源为材料,对大豆胞囊线虫抗性候选基因(rhg1和Rhg4)的SNP位点(8个)进行遗传变异分析,以期阐明野生和栽培大豆间遗传多样性及连锁不平衡水平差异。结果表明,与野生大豆相比,代表我国栽培大豆总体资源多样性的微核心种质及其补充材料的连锁不平衡水平较高(R2值为0.216)。在栽培大豆群体内,基因内和基因间分别有100%和16.6%的SNP位点对连锁不平衡显著,形成两个基因特异的连锁不平衡区间(Block)。在所有供试材料中共检测到单倍型46个,野生大豆的单倍型数目(27)少于栽培大豆(31),但单倍型多样性(0.916)稍高于栽培大豆(0.816)。单倍型大多数(67.4%)为群体所特有(31个),其中15个为野生大豆特有单倍型。野生大豆的两个主要优势单倍型(Hap_10和Hap_11)在栽培大豆中的发生频率也明显下降,推测野生大豆向栽培大豆进化过程中,一方面形成了新的单倍型,另一方面因为瓶颈效应部分单倍型的频率降低甚至消失。
关键词
栽培大豆
野生大豆
SNP标记
遗传变异
Keywords
Glycine max
Glycine soja
SNP marker
genetic variation
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
S968.313 [农业科学—水产养殖]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于大豆胞囊线虫病抗性候选基因的SNP位点遗传变异分析
李英慧
袁翠平
张辰
李伟
南海洋
常汝镇
邱丽娟
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2009
6
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