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杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白PbCBL10基因的克隆和表达特性研究
被引量:
9
1
作者
李慧
丛郁
+2 位作者
常有宏
蔺经
盛宝龙
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期550-556,共7页
【目的】为了探明杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白(CalcineurinB—likeprotein,CBL)基因的序列特征和表达特点,【方法】以杜梨幼苗为试材,运用同源克隆和半定量RT—PCR对PbCBLIO基因进行克隆和表达分析。【结果】结果表明.PbCBLIO基因...
【目的】为了探明杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白(CalcineurinB—likeprotein,CBL)基因的序列特征和表达特点,【方法】以杜梨幼苗为试材,运用同源克隆和半定量RT—PCR对PbCBLIO基因进行克隆和表达分析。【结果】结果表明.PbCBLIO基因编码区cDNA长度为801bp,编码的多肽由266个氨基酸组成。该多肽预测的等电点为4.56,估计的相对分子质量为30.45ku。其对应基因组DNA序列长1983bp,包括9个外显子和8个内含子。通过PSORT进行亚细胞定位分析发现PbCBLl0蛋白位于质膜上的几率最大。PbCBLIO基因编码的多肽具有4个钙离子结合域EF手形结构和1个钙调磷酸酶A亚基结合位点。PbCBLl0与番茄S1CBLIO(NP_001239045)和拟南芥AtCBLl0(NP_195026)蛋白间的同源性较高,分别为82%和77%,并与AtCBL10亲缘关系最近。PbCBL10基因在杜梨幼苗根、茎和叶片中均为诱导型表达,50~200mmol·L^(-1)CaCl2、20μmol·L^(-1)ABA、100mmol·L^(-1)NaCl、10%(w/v)PEG6000或180mmol·L^(-1)甘露醇处理后其表达量明显上调。【结论】PbCBLIO基因具备植物CBL基因家族的固有特征,能够响应胞内钙浓度变化,对ABA、盐碱、干旱和渗透胁迫均存在转录响应。
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关键词
杜梨
类钙调磷酸酶B亚基蛋白
基因克隆
表达特性
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职称材料
杜梨胆碱单加氧酶基因克隆及胁迫表达
被引量:
4
2
作者
李慧
丛郁
+2 位作者
常有宏
蔺经
盛宝龙
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1093-1098,共6页
为了解梨砧木—杜梨对非生物胁迫的防御机制,采用RT-PCR、RACE和长片段PCR技术从杜梨幼苗中获得1个甜菜碱合成相关的胆碱单加氧酶基因(PbCMO),运用生物信息学方法分析序列特点,并通过跨内含子引物进行半定量RT-PCR研究其在非生物胁迫下...
为了解梨砧木—杜梨对非生物胁迫的防御机制,采用RT-PCR、RACE和长片段PCR技术从杜梨幼苗中获得1个甜菜碱合成相关的胆碱单加氧酶基因(PbCMO),运用生物信息学方法分析序列特点,并通过跨内含子引物进行半定量RT-PCR研究其在非生物胁迫下的表达情况。结果表明:(1)PbCMO基因cDNA序列编码区长1 227bp,编码由408个氨基酸组成的多肽。其对应基因组DNA序列长2 928bp,由10个外显子和9个内含子组成。其推导的多肽预测的等电点为6.19,相对分子质量为46.27kD,具备Rieske型铁硫[2Fe-2S]簇结合区域和非血红素单核态铁配位点序列,与枸杞CMO蛋白相似性最高(71%)。(2)PbCMO在幼苗根和叶中均为诱导型表达,100mmol/L氯化钠、10%(W/V)聚乙二醇、180mmol/L甘露醇或20μmol/L脱落酸处理后其表达量明显上调,表明PbCMO对盐碱、干旱、渗透胁迫和ABA均存在表达响应,可能参与杜梨应对非生物胁迫的转录调节。
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关键词
杜梨
胆碱单加氧酶
基因克隆
表达特点
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职称材料
豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析
被引量:
3
3
作者
李慧
丛郁
+2 位作者
常有宏
蔺经
盛宝龙
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2013年第4期842-850,共9页
为明确梨砧木豆梨(Pyrus calleryana Dcne.)磷转运蛋白质基因的序列特点和表达模式,采用同源克隆、RACE技术和染色体步移法克隆获得1个Pht基因PcPht1的cDNA、DNA及启动子序列,并利用RT-PCR检测在不同供磷水平下该基因在豆梨幼苗中的表...
为明确梨砧木豆梨(Pyrus calleryana Dcne.)磷转运蛋白质基因的序列特点和表达模式,采用同源克隆、RACE技术和染色体步移法克隆获得1个Pht基因PcPht1的cDNA、DNA及启动子序列,并利用RT-PCR检测在不同供磷水平下该基因在豆梨幼苗中的表达情况。结果表明PcPht1 cDNA序列编码区长1 617 bp,编码1个由538个氨基酸组成的蛋白质,其相对分子质量为5.908×104。该基因编码区DNA序列没有内含子,其启动子除了具有TATA/CAAT-box外还包含防御与胁迫响应元件、光响应元件和茉莉酸甲酯响应顺式作用元件。PcPht1所编码蛋白质由12个疏水的跨膜区域组成,包括H2PO4-/nH+共运体、糖转运体和MFS通用底物转运体3个Pht1蛋白质特征结构域。PcPht1与大豆GmPht1;7和橡胶HbPht1间有较高的一致性(分别为88.0%和87.0%);与拟南芥Pht1蛋白质家族处于系统进化树的同一分支,并与AtPht1;4和AtPht1;7的亲缘关系最近。正常供磷条件下,PcPht1基因主要在根中表达,低磷时该基因的表达上调,提高供磷浓度其表达受到抑制,说明PcPht1的表达受环境磷浓度调控。
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关键词
豆梨
磷转运蛋白质基因
分离
启动子
表达
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职称材料
题名
杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白PbCBL10基因的克隆和表达特性研究
被引量:
9
1
作者
李慧
丛郁
常有宏
蔺经
盛宝龙
机构
江苏
省
农业
科学院
园艺
研究所
国家
农业
科技
华东
(
江苏
)
创新
中心
--
高效
园艺作物
遗传
改良
实验室
中国科学院南京土壤研究所土壤与
农业
可持续发展
国家
重点
实验室
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期550-556,共7页
基金
国家自然科学基金(31101529)
江苏省农业科技自主创新资金(CX(11)4050)
文摘
【目的】为了探明杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白(CalcineurinB—likeprotein,CBL)基因的序列特征和表达特点,【方法】以杜梨幼苗为试材,运用同源克隆和半定量RT—PCR对PbCBLIO基因进行克隆和表达分析。【结果】结果表明.PbCBLIO基因编码区cDNA长度为801bp,编码的多肽由266个氨基酸组成。该多肽预测的等电点为4.56,估计的相对分子质量为30.45ku。其对应基因组DNA序列长1983bp,包括9个外显子和8个内含子。通过PSORT进行亚细胞定位分析发现PbCBLl0蛋白位于质膜上的几率最大。PbCBLIO基因编码的多肽具有4个钙离子结合域EF手形结构和1个钙调磷酸酶A亚基结合位点。PbCBLl0与番茄S1CBLIO(NP_001239045)和拟南芥AtCBLl0(NP_195026)蛋白间的同源性较高,分别为82%和77%,并与AtCBL10亲缘关系最近。PbCBL10基因在杜梨幼苗根、茎和叶片中均为诱导型表达,50~200mmol·L^(-1)CaCl2、20μmol·L^(-1)ABA、100mmol·L^(-1)NaCl、10%(w/v)PEG6000或180mmol·L^(-1)甘露醇处理后其表达量明显上调。【结论】PbCBLIO基因具备植物CBL基因家族的固有特征,能够响应胞内钙浓度变化,对ABA、盐碱、干旱和渗透胁迫均存在转录响应。
关键词
杜梨
类钙调磷酸酶B亚基蛋白
基因克隆
表达特性
Keywords
Pyrus betulaefolia Bunge
Calcineurin B-like protein
Gene cloning
Expression characteristics
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
杜梨胆碱单加氧酶基因克隆及胁迫表达
被引量:
4
2
作者
李慧
丛郁
常有宏
蔺经
盛宝龙
机构
江苏
省
农业
科学院
园艺
研究所
国家
农业
科技
华东
(
江苏
)
创新
中心
--
高效
园艺作物
遗传
改良
实验室
中国科学院南京土壤研究所土壤与
农业
可持续发展
国家
重点
实验室
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期1093-1098,共6页
基金
国家自然科学基金(31101529)
江苏省农业科技自主创新资金[CX(11)4050]
文摘
为了解梨砧木—杜梨对非生物胁迫的防御机制,采用RT-PCR、RACE和长片段PCR技术从杜梨幼苗中获得1个甜菜碱合成相关的胆碱单加氧酶基因(PbCMO),运用生物信息学方法分析序列特点,并通过跨内含子引物进行半定量RT-PCR研究其在非生物胁迫下的表达情况。结果表明:(1)PbCMO基因cDNA序列编码区长1 227bp,编码由408个氨基酸组成的多肽。其对应基因组DNA序列长2 928bp,由10个外显子和9个内含子组成。其推导的多肽预测的等电点为6.19,相对分子质量为46.27kD,具备Rieske型铁硫[2Fe-2S]簇结合区域和非血红素单核态铁配位点序列,与枸杞CMO蛋白相似性最高(71%)。(2)PbCMO在幼苗根和叶中均为诱导型表达,100mmol/L氯化钠、10%(W/V)聚乙二醇、180mmol/L甘露醇或20μmol/L脱落酸处理后其表达量明显上调,表明PbCMO对盐碱、干旱、渗透胁迫和ABA均存在表达响应,可能参与杜梨应对非生物胁迫的转录调节。
关键词
杜梨
胆碱单加氧酶
基因克隆
表达特点
Keywords
birch-leaf pear (Pyrus betulaefolia Bunge) choline monooxygenase
gene cloning
expressionfeatures
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析
被引量:
3
3
作者
李慧
丛郁
常有宏
蔺经
盛宝龙
机构
江苏
省
农业
科学院
园艺
研究所
国家
农业
科技
华东
(
江苏
)
创新
中心
--
高效
园艺作物
遗传
改良
实验室
中国科学院南京土壤研究所土壤与
农业
可持续发展
国家
重点
实验室
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2013年第4期842-850,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31101529)
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(12)5033]
文摘
为明确梨砧木豆梨(Pyrus calleryana Dcne.)磷转运蛋白质基因的序列特点和表达模式,采用同源克隆、RACE技术和染色体步移法克隆获得1个Pht基因PcPht1的cDNA、DNA及启动子序列,并利用RT-PCR检测在不同供磷水平下该基因在豆梨幼苗中的表达情况。结果表明PcPht1 cDNA序列编码区长1 617 bp,编码1个由538个氨基酸组成的蛋白质,其相对分子质量为5.908×104。该基因编码区DNA序列没有内含子,其启动子除了具有TATA/CAAT-box外还包含防御与胁迫响应元件、光响应元件和茉莉酸甲酯响应顺式作用元件。PcPht1所编码蛋白质由12个疏水的跨膜区域组成,包括H2PO4-/nH+共运体、糖转运体和MFS通用底物转运体3个Pht1蛋白质特征结构域。PcPht1与大豆GmPht1;7和橡胶HbPht1间有较高的一致性(分别为88.0%和87.0%);与拟南芥Pht1蛋白质家族处于系统进化树的同一分支,并与AtPht1;4和AtPht1;7的亲缘关系最近。正常供磷条件下,PcPht1基因主要在根中表达,低磷时该基因的表达上调,提高供磷浓度其表达受到抑制,说明PcPht1的表达受环境磷浓度调控。
关键词
豆梨
磷转运蛋白质基因
分离
启动子
表达
Keywords
Pyrus calleryana Dcne.
phosphate transport protein gene
isolation
expression
promoter
分类号
S661.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
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被引量
操作
1
杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白PbCBL10基因的克隆和表达特性研究
李慧
丛郁
常有宏
蔺经
盛宝龙
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
9
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职称材料
2
杜梨胆碱单加氧酶基因克隆及胁迫表达
李慧
丛郁
常有宏
蔺经
盛宝龙
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
4
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职称材料
3
豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析
李慧
丛郁
常有宏
蔺经
盛宝龙
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2013
3
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