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水稻WRKY转录因子基因家族响应外源一氧化氮的表达谱分析
被引量:
4
1
作者
孟姣
王海华
+3 位作者
向建华
蒋丹
彭喜旭
贺欢欢
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期111-120,共10页
一氧化氮(nitric oxide,NO)信号分子与WRKY转录因子均参与植物抗逆、发育与代谢等许多生理过程。采用Agilent水稻全基因组cDNA芯片分析了NO处理后1、6和12h水稻幼苗WRKY转录因子基因的表达谱,鉴定出在1个时间点有两倍或两倍以上表达变化...
一氧化氮(nitric oxide,NO)信号分子与WRKY转录因子均参与植物抗逆、发育与代谢等许多生理过程。采用Agilent水稻全基因组cDNA芯片分析了NO处理后1、6和12h水稻幼苗WRKY转录因子基因的表达谱,鉴定出在1个时间点有两倍或两倍以上表达变化的WRKY基因32个,主要分布在WRKY的Ⅰ和Ⅱ组,其中75%的Ⅱa和45.6%的Ⅱd亚组成员为差异表达基因;鉴定出至少在2个时间点有两倍或两倍以上表达变化的WRKY基因15个,均为早期(1h)应答,且多数(64.2%)持续上调;基因功能预测分析表明,这些基因主要参与生物学过程中的细胞过程、代谢过程和刺激响应,以及分子功能中的转录调节活性和结合;代谢通路分析表明,WRKY24涉及植物与病原菌相互作用代谢通路。实时荧光定量PCR验证结果与芯片杂交结果基本一致,印证了芯片杂交结果的有效性。上述发现提示,NO信号可能参与了WRKY转录因子介导的生物学调控功能,并为这些基因的进一步功能分析奠定基础。
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关键词
水稻
WRKY转录因子
一氧化氮
基因表达谱
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题名
水稻WRKY转录因子基因家族响应外源一氧化氮的表达谱分析
被引量:
4
1
作者
孟姣
王海华
向建华
蒋丹
彭喜旭
贺欢欢
机构
湖南
科技大学生命科学学院
重金属污染土壤生态修复与安全利用
湖南省
高校
重点
实验室
园艺作物病虫害防治湖南省重点实验室
出处
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期111-120,共10页
基金
国家自然科学基金资助项目(31171803
301617)
+1 种基金
湖南省教育厅一般资助项目(14C0453)
湖南科技大学创新基金资助项目(S140031)
文摘
一氧化氮(nitric oxide,NO)信号分子与WRKY转录因子均参与植物抗逆、发育与代谢等许多生理过程。采用Agilent水稻全基因组cDNA芯片分析了NO处理后1、6和12h水稻幼苗WRKY转录因子基因的表达谱,鉴定出在1个时间点有两倍或两倍以上表达变化的WRKY基因32个,主要分布在WRKY的Ⅰ和Ⅱ组,其中75%的Ⅱa和45.6%的Ⅱd亚组成员为差异表达基因;鉴定出至少在2个时间点有两倍或两倍以上表达变化的WRKY基因15个,均为早期(1h)应答,且多数(64.2%)持续上调;基因功能预测分析表明,这些基因主要参与生物学过程中的细胞过程、代谢过程和刺激响应,以及分子功能中的转录调节活性和结合;代谢通路分析表明,WRKY24涉及植物与病原菌相互作用代谢通路。实时荧光定量PCR验证结果与芯片杂交结果基本一致,印证了芯片杂交结果的有效性。上述发现提示,NO信号可能参与了WRKY转录因子介导的生物学调控功能,并为这些基因的进一步功能分析奠定基础。
关键词
水稻
WRKY转录因子
一氧化氮
基因表达谱
Keywords
rice(Oryza sativa)
WRKY transcription factor
nitric oxide
gene expression profile
分类号
S511 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻WRKY转录因子基因家族响应外源一氧化氮的表达谱分析
孟姣
王海华
向建华
蒋丹
彭喜旭
贺欢欢
《中国水稻科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
4
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