检索结果-维普期刊中文期刊服务平台

林麝全基因组微卫星分布规律研究被引量：10: 1; 作者卢婷王晨 +4 位作者杜超刘姝沈咏梅张修月岳碧松《四川动物》北大核心 2017年第4期420-424,共5页; 林麝Moschus berezovskii是中国重要的资源动物,也是国家Ⅰ级重点保护野生动物。本研究使用生物信息学方法,分析林麝全基因组中完美型微卫星的分布特征。在林麝2.53 Gb的基因组序列中,共搜索到665 524个完美型微卫星,总长度为11 517 784... 展开更多; 关键词林麝全基因组微卫星分布规律; 在线阅读下载PDF 职称材料

药用美洲大蠊全基因组测序分析被引量：12: 2; 作者晋家正李午佼 +4 位作者牟必琴沈咏梅耿福能岳碧松范振鑫《四川动物》北大核心 2018年第2期121-126,共6页; 以美洲大蠊Periplaneta americana为原料生产的康复新液等药品临床疗效显著,得到了广泛应用。本文以四川好医生攀西药业有限责任公司饲养的药用美洲大蠊为材料,首次采用Illumina Hi Seq 2000和Pac Bio SMRT测序平台开展了全基因组测序,... 展开更多; 关键词美洲大蠊药用昆虫全基因组测序基因组装基因注释; 在线阅读下载PDF 职称材料

美洲大蠊microRNA的初步研究被引量：1: 3; 作者宝钲杨茗羽 +2 位作者张修月岳碧松范振鑫《四川动物》北大核心 2019年第1期47-55,共9页; 美洲大蠊Periplaneta americana是一种世界性的卫生害虫,但其提取物有较高的药用价值。本研究对饲养的雌雄美洲大蠊成虫进行microRNA测序,分别在雄性和雌性中得到12 155 616条和9 847 263条序列。序列长度主要为18～23 nt,且在22 nt和29... 展开更多; 关键词美洲大蠊 MICRORNA 差异表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于转录组测序分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制被引量：15: 4; 作者陈佳松陈峰 +2 位作者彭锐耿福能邹方东《四川动物》北大核心 2017年第4期398-403,共6页; 美洲大蠊Periplaneta americana是传统的中药材,其提取物已在临床上广泛用于创面治疗,但对其中的分子机制知之甚少。本文通过构建小鼠皮肤创伤模型,并基于转录组测序(RNA-seq)深入分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制。首先构... 展开更多; 关键词美洲大蠊伤口修复转录组分析关键基因; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响被引量：3: 5; 作者陈峰陈佳松 +2 位作者彭锐耿福能邹方东《四川动物》北大核心 2017年第6期649-656,共8页; 美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的... 展开更多; 关键词美洲大蠊提取物转录组差异基因信号通路功能注释; 在线阅读下载PDF 职称材料

美洲大蠊乙醇提取物中原儿茶酸超高效液相色谱定量分析方法的建立被引量：7: 6; 作者郭昕巩荣艳 +4 位作者朱娟娟曾成娟沈咏梅岳碧松李静《四川动物》北大核心 2018年第2期185-190,共6页; 美洲大蠊Periplaneta americana是重要的药用昆虫,具有抗菌消炎、活血化瘀等多种药用价值。本实验通过外标法鉴定了美洲大蠊乙醇提取物中的原儿茶酸,并建立原儿茶酸定量测定的超高效液相色谱方法。色谱柱选用Waters ACQUITY UPLC HSS T3... 展开更多; 关键词美洲大蠊原儿茶酸超高效液相色谱; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名林麝全基因组微卫星分布规律研究被引量：10: 1; 作者卢婷王晨杜超刘姝沈咏梅张修月岳碧松; 机构四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川省药用动物工程技术研究中心; 出处《四川动物》北大核心 2017年第4期420-424,共5页; 基金四川省科技支撑计划(2014NZ0107); 文摘林麝Moschus berezovskii是中国重要的资源动物,也是国家Ⅰ级重点保护野生动物。本研究使用生物信息学方法,分析林麝全基因组中完美型微卫星的分布特征。在林麝2.53 Gb的基因组序列中,共搜索到665 524个完美型微卫星,总长度为11 517 784 bp,占基因组序列总长度的0.42%,总丰度为244个/Mb。林麝基因组中,单碱基微卫星序列数量最多,为221 058个,约占总微卫星数的33.22%,丰度为81.05个/Mb,然后依次为二碱基、五碱基、三碱基、四碱基、六碱基重复类型微卫星。林麝基因组中数目最多的10种微卫星类别依次为:A、AACTG、AGC、AC、AT、AG、AAAT、AAC、AAT和AAAC,占所有基因组微卫星的93.2%,表现出明显的A、T偏好。林麝基因组微卫星序列分布研究表明,其在外显子(2 530个)上的分布数量远低于内含子(200 906个)和基因间隔区(454 596个),与前人关于微卫星在非编码区的分布多于编码区的结论一致。本研究为深入研究林麝基因组特征及筛选更多优良微卫星标记提供了基础数据。; 关键词林麝全基因组微卫星分布规律; Keywords Moschus berezovskii genome microsatellite distribution regularities; 分类号 Q953 [生物学—动物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名药用美洲大蠊全基因组测序分析被引量：12: 2; 作者晋家正李午佼牟必琴沈咏梅耿福能岳碧松范振鑫; 机构生物资源与生态环境教育部重点实验室药用美洲大蠊四川省重点实验室四川省药用动物工程技术研究中心; 出处《四川动物》北大核心 2018年第2期121-126,共6页; 基金国家中医药管理局“中成药大宗品种康复新液全程质量控制体系及优质产品标准建设(ZYY-2017-054)”项目; 文摘以美洲大蠊Periplaneta americana为原料生产的康复新液等药品临床疗效显著,得到了广泛应用。本文以四川好医生攀西药业有限责任公司饲养的药用美洲大蠊为材料,首次采用Illumina Hi Seq 2000和Pac Bio SMRT测序平台开展了全基因组测序,并进行基因组组装、注释和分析。原始测序数据经过滤后得到1.4 Tb的二代测序数据和33.81 Gb的三代测序数据。组装结果表明,美洲大蠊基因组大小为3.26 Gb,这在已报道的昆虫基因组中仅次于东亚飞蝗Locusta migratoria。基因组重复序列含量为62.38%,杂合度为0.635%,表明其为复杂基因组。组装的Contig N50和scaffold N50长度分别为28.2 kb、315 kb,单拷贝基因完整性为88.1%,小片段文库测序数据平均比对率为99.8%,测序和组装质量满足后续分析要求。采用De novo预测、同源预测和基于转录本预测3种方法共注释到14 568个基因,其中92.4%的基因获得了功能注释。本研究首次完成了美洲大蠊的全基因组测序,也是大蠊属Periplaneta昆虫的第一个基因组,为美洲大蠊遗传进化分析和药用基因资源挖掘打下了重要基础。; 关键词美洲大蠊药用昆虫全基因组测序基因组装基因注释; Keywords Periplarteta americana whole genome sequencing genome assembly genome annotation; 分类号 Q959.229.9 [生物学—动物学] R857.3 [医药卫生—航空、航天与航海医学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名美洲大蠊microRNA的初步研究被引量：1: 3; 作者宝钲杨茗羽张修月岳碧松范振鑫; 机构生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院四川药用动物工程技术研究中心药用美洲大蠊四川省重点实验室; 出处《四川动物》北大核心 2019年第1期47-55,共9页; 基金好医生助研项目; 文摘美洲大蠊Periplaneta americana是一种世界性的卫生害虫,但其提取物有较高的药用价值。本研究对饲养的雌雄美洲大蠊成虫进行microRNA测序,分别在雄性和雌性中得到12 155 616条和9 847 263条序列。序列长度主要为18～23 nt,且在22 nt和29 nt处有2个峰值。将所得序列与数据库(NCBI、Rfam)进行比对注释,最终在雄性成虫中鉴定到57种已知的microRNA和152种潜在的新microRNA,在雌性成虫中鉴定到53种已知的microRNA和94种潜在的新microRNA。差异表达分析发现只有一种microRNA:miR-750在雌雄之间差异表达,其在雌虫中表达量显著高于雄虫。本研究首次在基因组水平研究了美洲大蠊microRNA的组成并对其功能进行了预测,为其后续研究奠定了基础。; 关键词美洲大蠊 MICRORNA 差异表达; Keywords Periplaneta americana microRNA differential expression; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学] Q915.819.7 [天文地球—古生物学与地层学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于转录组测序分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制被引量：15: 4; 作者陈佳松陈峰彭锐耿福能邹方东; 机构四川大学生命科学学院四川省药用动物工程技术研究中心药用美洲大蠊四川省重点实验室; 出处《四川动物》北大核心 2017年第4期398-403,共6页; 文摘美洲大蠊Periplaneta americana是传统的中药材,其提取物已在临床上广泛用于创面治疗,但对其中的分子机制知之甚少。本文通过构建小鼠皮肤创伤模型,并基于转录组测序(RNA-seq)深入分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制。首先构建C57小鼠皮肤全层切除模型,并将其分为3组,其中实验组分别以2种美洲大蠊提取物(康复新液、精粉)为敷料,而对照组以75%乙醇为敷料。用药处理3 d后取伤口皮肤组织送样进行RNAseq,然后分析转录组数据找出与伤口愈合相关的差异性表达基因,并利用荧光定量PCR(Q-PCR)对伤口组织中相关基因的表达量进一步验证。实验结果显示,实验组小鼠伤口的结痂速度比对照组快,这表明了小鼠创面模型中,美洲大蠊提取物能促进伤口愈合。经转录组分析,得到显著性差异表达基因数:对照组vs.精粉组为545,对照组vs.康复新液组为938。结合生物信息分析结果和已发表的文献,发现3个可能参与调节伤口愈合的关键基因:表皮调节素(Ereg)、Gli-kruppel家族成员(Gli2)和表皮型转谷氨酰胺酶3(Tgm3)。Q-PCR实验表明,这3个基因在美洲大蠊提取物加药组中均高表达。本文研究结果表明,2种美洲大蠊提取物:康复新液、精粉可能通过诱导Ereg、Tgm3和Gli2的高表达来促进皮肤创面的愈合。; 关键词美洲大蠊伤口修复转录组分析关键基因; Keywords Periplaneta americana wound healing RNA-seq key genes; 分类号 R285.5 [医药卫生—中药学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响被引量：3: 5; 作者陈峰陈佳松彭锐耿福能邹方东; 机构四川大学生命科学学院四川省药用动物工程技术研究中心药用美洲大蠊四川省重点实验室; 出处《四川动物》北大核心 2017年第6期649-656,共8页; 文摘美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的变化。结果表明:30μM顺铂和0.6%康复新液联合处理组与对照组相比,共有1 901个差异基因,其中1 555个基因表达上调,346个基因表达下调;30μM顺铂和0.8%精粉酵解液联合处理组与对照组比,共有2 587个差异基因,其中2 183个基因表达上调,404个基因表达下调;30μM顺铂和100μg·m L-1精粉联合处理组与对照组相比,共有1 488个差异基因,其中1 164个基因表达上调,324个基因表达下调。用WEGO和DAVID进行差异基因的GO和KEGG富集分析发现,美洲大蠊提取物联合顺铂处理组与对照组相比,表达上调的差异基因主要富集在p53、细胞粘附分子、MAPK、细胞凋亡等信号通路;表达下调的差异基因主要富集在氨基酰-tRNA生物合成、氨基酸生物合成、抗生素生物合成、一碳代谢等信号通路。; 关键词美洲大蠊提取物转录组差异基因信号通路功能注释; Keywords Periplaneta americana extraction transcriptome differentially expressed genes signaling pathways functional annotation; 分类号 R735.34 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名美洲大蠊乙醇提取物中原儿茶酸超高效液相色谱定量分析方法的建立被引量：7: 6; 作者郭昕巩荣艳朱娟娟曾成娟沈咏梅岳碧松李静; 机构四川大学生命科学学院四川省药用动物工程技术研究中心; 出处《四川动物》北大核心 2018年第2期185-190,共6页; 文摘美洲大蠊Periplaneta americana是重要的药用昆虫,具有抗菌消炎、活血化瘀等多种药用价值。本实验通过外标法鉴定了美洲大蠊乙醇提取物中的原儿茶酸,并建立原儿茶酸定量测定的超高效液相色谱方法。色谱柱选用Waters ACQUITY UPLC HSS T3柱(2.1 mm×100 mm,1.8μm),缓冲盐溶液(含0.1%甲酸,25 mmol甲酸铵)为流动相A,100%乙腈为流动相B,流速0.5 m L·min^(-1),样品温度25℃,柱温40℃。结果显示,美洲大蠊乙醇提取物中原儿茶酸可达到基线分离,峰型良好;原儿茶酸在10~160μg内呈良好的线性关系(R2=0.999 9),平均回收率为98.30%~99.57%,相对标准偏差<1%;定量测定美洲大蠊乙醇提取物中原儿茶酸的含量为51.38μg·m L^(-1)。结果显示,超高效液相色谱方法重复性好、稳定性高、分析快速,可以用于美洲大蠊乙醇提取物中原儿茶酸含量的定量测定。; 关键词美洲大蠊原儿茶酸超高效液相色谱; Keywords Periplaneta americana protocatechuic acid ultra performance liquid chromatography; 分类号 R286 [医药卫生—中药学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	林麝全基因组微卫星分布规律研究	卢婷王晨杜超刘姝沈咏梅张修月岳碧松	《四川动物》北大核心	2017	10	在线阅读下载PDF 职称材料
2	药用美洲大蠊全基因组测序分析	晋家正李午佼牟必琴沈咏梅耿福能岳碧松范振鑫	《四川动物》北大核心	2018	12	在线阅读下载PDF 职称材料
3	美洲大蠊microRNA的初步研究	宝钲杨茗羽张修月岳碧松范振鑫	《四川动物》北大核心	2019	1	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于转录组测序分析美洲大蠊提取物促进小鼠创面愈合的分子机制	陈佳松陈峰彭锐耿福能邹方东	《四川动物》北大核心	2017	15	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响	陈峰陈佳松彭锐耿福能邹方东	《四川动物》北大核心	2017	3	在线阅读下载PDF 职称材料
6	美洲大蠊乙醇提取物中原儿茶酸超高效液相色谱定量分析方法的建立	郭昕巩荣艳朱娟娟曾成娟沈咏梅岳碧松李静	《四川动物》北大核心	2018	7	在线阅读下载PDF 职称材料