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肝细胞癌复发进程中DNA修复调节的蛋白质组学分析及验证
被引量：
1
1
作者
常凯
王艳艳
+7 位作者
江忠勇
孙巍
刘晨霞
那琬琳
许宏宣
谢静
刘媛
陈敏
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2024年第2期319-326,共8页
目的分析肝细胞癌(HCC)复发进程中DNA修复调节的作用及机制。方法串联质量标签(TMT)标记的定量蛋白质组学方法分析HCC 2年内复发和5年预后良好的肝癌组织样本,分析富集在DNA复制、错配修复、碱基切除修复、核苷酸切除修复4条通路的蛋白...
目的分析肝细胞癌(HCC)复发进程中DNA修复调节的作用及机制。方法串联质量标签(TMT)标记的定量蛋白质组学方法分析HCC 2年内复发和5年预后良好的肝癌组织样本,分析富集在DNA复制、错配修复、碱基切除修复、核苷酸切除修复4条通路的蛋白表达差异,分析在HCC复发进程中起主要作用的调控通路及靶点,预测可能的调控机制。计量资料2组间比较采用成组t检验;多组间比较采用单因素方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验。结果真核生物复制复合体通路MCM2(P=0.018)、MCM3(P=0.047)、MCM4(P=0.014)、MCM5(P=0.008)、MCM6(P=0.006)、MCM7(P=0.007)、PCNA(P=0.019)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、LIG1(P=0.042)蛋白表达均显著降低;核苷酸切除修复通路中PCNA(P=0.019)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、LIG1(P=0.042)共4个蛋白表达水平均显著减少;碱基切除修复通路PCNA(P=0.019)和LIG1(P=0.042)在HCC复发组中均显著降低;错配修复富集通路中MSH2(P=0.026)、MSH6(P=0.006)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、PCNA(P=0.019)、LIG1(P=0.042)共6个蛋白在肝癌复发组织中均显著减少。差异蛋白涉及MCM复合体、DNA聚合酶复合体ε、连接酶LIG1、长补丁碱基剪切修复复合体(long patch BER)、DNA错配修复蛋白复合体的重要组分。对DNA修复调节的重要差异蛋白进行临床样本验证分析,结果表明复发组中除MCM6表现出下降趋势外,MCM5(P=0.008)、MCM7(P=0.007)、RCF4(P=0.002)、RCF5(P<0.001)和MSH6(P=0.006)蛋白相对表达量均显著降低。结论HCC复发过程中,DNA修复进程中多个复合体蛋白组分存在显著减少或缺失。
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关键词
癌
肝细胞
肿瘤复发
局部
DNA修复
蛋白质组学
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职称材料
黄芪甲苷通过调控宿主核糖体翻译开关抑制HBV复制的机制
被引量：
4
2
作者
常凯
王艳艳
+4 位作者
那琬琳
刘晨霞
叶雨笙
江忠勇
刘媛
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2022年第7期1495-1502,共8页
目的分析黄芪甲苷抑制HBV复制的宿主调控机制。方法使用不同浓度的黄芪甲苷处理人正常肝细胞(L-02),根据黄芪甲苷浓度的不同,分为0、5、10和20μg/mL 4组。应用CCK-8检测细胞活性,流式细胞法检测细胞凋亡,化学发光和生化方法检测AFP、AL...
目的分析黄芪甲苷抑制HBV复制的宿主调控机制。方法使用不同浓度的黄芪甲苷处理人正常肝细胞(L-02),根据黄芪甲苷浓度的不同,分为0、5、10和20μg/mL 4组。应用CCK-8检测细胞活性,流式细胞法检测细胞凋亡,化学发光和生化方法检测AFP、ALT、AST和ALP外泌水平,评估黄芪甲苷对正常细胞的影响。用黄芪甲苷处理携带HBV的肝癌细胞Hep3B,应用qPCR方法检测HBV DNA、pgRNA、MTIF2、RPL10基因表达量,ELISA测法检测HBsAg和HBeAg,评估对HBV复制的影响。应用TCGA和GEO数据库结合R语言资料包对RPL10和MTIF2在临床样本中的预后影响进行分析验证。绘制Kaplan-Meier生存曲线,log-rank检验用于分析比较两组或多组之间的生存差异,进行了time ROC分析以比较RPL10和MTIF2基因的预测准确性和风险评分。计量资料多组间比较和同一组内不同时间段比较均采用单因素方差分析,进一步分析两两组间比较采用Bonferroni方法。结果20μg/mL组处理24 h和48 h相较未处理组细胞生长活性均显著提高(P值均<0.05),20μg/mL组处理72 h相较10μg/mL组生长活性提高(P<0.05),5μg/mL组处理72 h相较未处理组生长活性提高(P<0.05)。5、10和20μg/mL 3个处理组AFP水平均较未处理组显著增高(P值均<0.05),10和20μg/mL 2个处理组ALT水平分别均较未处理和5μg/mL 2组显著降低(P值均<0.05),20μg/mL组ALT水平较10μg/mL组显著降低(P<0.05)。5、10和20μg/mL 3个处理组AST水平较未处理组均显著增高(P值均<0.05)。5、10和20μg/mL 3个处理组HBV DNA、pgRNA、HBsAg、HBeAg、RPL10和MTIF2水平与未处理组比较差异均有统计学意义(P值均<0.05)。生物信息学分析结果显示,HBV感染的肝癌患者中RPL10和MTIF2基因较高水平表达的患者预后较差,而在无HBV感染的肝癌患者中不存在此现象。结论黄芪甲苷能够抑制翻译起始蛋白MTIF2和核糖体大亚基成分RPL10,通过调控宿主核糖体翻译开关降低HBV复制。
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关键词
黄芪甲苷
乙型肝炎病毒
核糖体蛋白质类
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职称材料
题名
肝细胞癌复发进程中DNA修复调节的蛋白质组学分析及验证
被引量：
1
1
作者
常凯
王艳艳
江忠勇
孙巍
刘晨霞
那琬琳
许宏宣
谢静
刘媛
陈敏
机构
中国人民解放军西部战区总医院
检验
科
成都市第七人民医院
检验
科
四川省疾病预防控制中心微生物检验所
成都市实验外国语学校
生物
教学与研究组
西南大学药学院/中医药学院
出处
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2024年第2期319-326,共8页
基金
四川省自然科学基金(2022NSFSC1415)
四川省中医药管理局专项课题(2020JC0124)
+1 种基金
西部战区总医院应用基础研究项目(2021-XZYG-C22,2021-XZYG-C21)
西部战区总医院星火青年创新人才工程。
文摘
目的分析肝细胞癌(HCC)复发进程中DNA修复调节的作用及机制。方法串联质量标签(TMT)标记的定量蛋白质组学方法分析HCC 2年内复发和5年预后良好的肝癌组织样本,分析富集在DNA复制、错配修复、碱基切除修复、核苷酸切除修复4条通路的蛋白表达差异,分析在HCC复发进程中起主要作用的调控通路及靶点,预测可能的调控机制。计量资料2组间比较采用成组t检验;多组间比较采用单因素方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验。结果真核生物复制复合体通路MCM2(P=0.018)、MCM3(P=0.047)、MCM4(P=0.014)、MCM5(P=0.008)、MCM6(P=0.006)、MCM7(P=0.007)、PCNA(P=0.019)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、LIG1(P=0.042)蛋白表达均显著降低;核苷酸切除修复通路中PCNA(P=0.019)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、LIG1(P=0.042)共4个蛋白表达水平均显著减少;碱基切除修复通路PCNA(P=0.019)和LIG1(P=0.042)在HCC复发组中均显著降低;错配修复富集通路中MSH2(P=0.026)、MSH6(P=0.006)、RFC4(P=0.002)、RFC5(P<0.001)、PCNA(P=0.019)、LIG1(P=0.042)共6个蛋白在肝癌复发组织中均显著减少。差异蛋白涉及MCM复合体、DNA聚合酶复合体ε、连接酶LIG1、长补丁碱基剪切修复复合体(long patch BER)、DNA错配修复蛋白复合体的重要组分。对DNA修复调节的重要差异蛋白进行临床样本验证分析,结果表明复发组中除MCM6表现出下降趋势外,MCM5(P=0.008)、MCM7(P=0.007)、RCF4(P=0.002)、RCF5(P<0.001)和MSH6(P=0.006)蛋白相对表达量均显著降低。结论HCC复发过程中,DNA修复进程中多个复合体蛋白组分存在显著减少或缺失。
关键词
癌
肝细胞
肿瘤复发
局部
DNA修复
蛋白质组学
Keywords
Carcinoma,Hepatocellular
Neoplasm Recurrence,Local
DNA Repair
Proteomics
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
黄芪甲苷通过调控宿主核糖体翻译开关抑制HBV复制的机制
被引量：
4
2
作者
常凯
王艳艳
那琬琳
刘晨霞
叶雨笙
江忠勇
刘媛
机构
中国人民解放军西部战区总医院
检验
科
四川省疾病预防控制中心微生物检验所
成都市郫都区人民医院
成都市第七人民医院
检验
科
出处
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2022年第7期1495-1502,共8页
基金
四川省中医药专项课题(2020JC0124)
西部战区总医院星火青年创新人才工程
+1 种基金
西部战区总医院院管课题(2021-XZYG-C22)
国家自然科学基金(81301445)。
文摘
目的分析黄芪甲苷抑制HBV复制的宿主调控机制。方法使用不同浓度的黄芪甲苷处理人正常肝细胞(L-02),根据黄芪甲苷浓度的不同,分为0、5、10和20μg/mL 4组。应用CCK-8检测细胞活性,流式细胞法检测细胞凋亡,化学发光和生化方法检测AFP、ALT、AST和ALP外泌水平,评估黄芪甲苷对正常细胞的影响。用黄芪甲苷处理携带HBV的肝癌细胞Hep3B,应用qPCR方法检测HBV DNA、pgRNA、MTIF2、RPL10基因表达量,ELISA测法检测HBsAg和HBeAg,评估对HBV复制的影响。应用TCGA和GEO数据库结合R语言资料包对RPL10和MTIF2在临床样本中的预后影响进行分析验证。绘制Kaplan-Meier生存曲线,log-rank检验用于分析比较两组或多组之间的生存差异,进行了time ROC分析以比较RPL10和MTIF2基因的预测准确性和风险评分。计量资料多组间比较和同一组内不同时间段比较均采用单因素方差分析,进一步分析两两组间比较采用Bonferroni方法。结果20μg/mL组处理24 h和48 h相较未处理组细胞生长活性均显著提高(P值均<0.05),20μg/mL组处理72 h相较10μg/mL组生长活性提高(P<0.05),5μg/mL组处理72 h相较未处理组生长活性提高(P<0.05)。5、10和20μg/mL 3个处理组AFP水平均较未处理组显著增高(P值均<0.05),10和20μg/mL 2个处理组ALT水平分别均较未处理和5μg/mL 2组显著降低(P值均<0.05),20μg/mL组ALT水平较10μg/mL组显著降低(P<0.05)。5、10和20μg/mL 3个处理组AST水平较未处理组均显著增高(P值均<0.05)。5、10和20μg/mL 3个处理组HBV DNA、pgRNA、HBsAg、HBeAg、RPL10和MTIF2水平与未处理组比较差异均有统计学意义(P值均<0.05)。生物信息学分析结果显示,HBV感染的肝癌患者中RPL10和MTIF2基因较高水平表达的患者预后较差,而在无HBV感染的肝癌患者中不存在此现象。结论黄芪甲苷能够抑制翻译起始蛋白MTIF2和核糖体大亚基成分RPL10,通过调控宿主核糖体翻译开关降低HBV复制。
关键词
黄芪甲苷
乙型肝炎病毒
核糖体蛋白质类
Keywords
AstragalosideⅣ
Hepatitis B virus
Ribosomal Proteins
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肝细胞癌复发进程中DNA修复调节的蛋白质组学分析及验证
常凯
王艳艳
江忠勇
孙巍
刘晨霞
那琬琳
许宏宣
谢静
刘媛
陈敏
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黄芪甲苷通过调控宿主核糖体翻译开关抑制HBV复制的机制
常凯
王艳艳
那琬琳
刘晨霞
叶雨笙
江忠勇
刘媛
《临床肝胆病杂志》
CAS
北大核心
2022
4
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