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玉米SBP转录因子全基因组鉴定与功能分析
被引量:
9
1
作者
彭华
何秀静
+3 位作者
高健
罗茂
潘光堂
张志明
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期201-211,共11页
SBP基因家族是一类植物基因组特有的转录因子,参与植物生长发育及多种生理生化过程。近来,大量研究已在多种植物中鉴定出SBP转录因子,但关于玉米(Zea mays L.)SBP转录因子家族的系统分析报道尚少。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知...
SBP基因家族是一类植物基因组特有的转录因子,参与植物生长发育及多种生理生化过程。近来,大量研究已在多种植物中鉴定出SBP转录因子,但关于玉米(Zea mays L.)SBP转录因子家族的系统分析报道尚少。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与玉米基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准从玉米基因组中挖掘SBP转录因子,系统发育分析显示单子叶植物玉米和水稻的SBP基因保守性更强、亲缘关系更近;共鉴定37个SBP基因,分布在9条染色体上;通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现SBP家族基因参与植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应、花器官发育以及植物光反应等过程。并且,玉米SBP转录因子可通过参与赤霉素、生长素、脱落酸、水杨酸等多条激素信号调控途径来调节植物的生长发育。
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关键词
玉米
SBP转录因子家族
生物信息学
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职称材料
血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)敲低抑制宫颈癌SiHa细胞增殖并促进其凋亡
被引量:
7
2
作者
聂丹
刘玲
+3 位作者
夏纪毅
汪春燕
詹平
毛熙光
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期488-492,共5页
目的研究慢病毒介导短发夹RNA(shRNA)沉默血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)基因对人宫颈癌Si Ha细胞增殖和凋亡的影响。方法用ANGPTL4 shRNA慢病毒感染Si Ha细胞,实时荧光定量PCR检测各组细胞ANGPTL4 mRNA水平,Western blot法检测ANGPTL4蛋...
目的研究慢病毒介导短发夹RNA(shRNA)沉默血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)基因对人宫颈癌Si Ha细胞增殖和凋亡的影响。方法用ANGPTL4 shRNA慢病毒感染Si Ha细胞,实时荧光定量PCR检测各组细胞ANGPTL4 mRNA水平,Western blot法检测ANGPTL4蛋白水平;MTT法和软琼脂克隆形成实验检测Si Ha细胞增殖能力;流式细胞术检测Si Ha细胞周期。藻红蛋白标记的annexin V和7-氨基放线菌素D联合染色(annexin V-PE/7-AAD)结合流式细胞术检测慢病毒感染后Si Ha细胞的凋亡。结果重组慢病毒感染Si Ha细胞后,LV3-ANGPTL4组Si Ha细胞中ANGPTL4 mRNA和蛋白表达水平降低;MTT结果显示,LV3-ANGPTL4组细胞增殖受抑制;软琼脂克隆形成实验显示,LV3-ANGPTL4组细胞克隆形成数减少;流式细胞术结果显示,LV3-ANGPTL4组G0/G1期细胞所占比例增加,细胞凋亡率增高。结论下调Si Ha细胞ANGPTL4的水平可抑制细胞增殖,使细胞周期阻滞于G0/G1期,诱导细胞凋亡。
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关键词
血管生成素样蛋白4
慢病毒
宫颈癌
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职称材料
题名
玉米SBP转录因子全基因组鉴定与功能分析
被引量:
9
1
作者
彭华
何秀静
高健
罗茂
潘光堂
张志明
机构
四川
旅游学院
四川
农业
大学
玉米
研究
所
第三军医
大学
西南医院病理学
研究
所西南癌症
中心
四川医科大学药物与功能性食品研究中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期201-211,共11页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2012AA10A307)
四川省科技厅青年基金项目(2015JQO021)资助~~
文摘
SBP基因家族是一类植物基因组特有的转录因子,参与植物生长发育及多种生理生化过程。近来,大量研究已在多种植物中鉴定出SBP转录因子,但关于玉米(Zea mays L.)SBP转录因子家族的系统分析报道尚少。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的转录因子与玉米基因组数据比对,并设置一系列严格的筛选标准从玉米基因组中挖掘SBP转录因子,系统发育分析显示单子叶植物玉米和水稻的SBP基因保守性更强、亲缘关系更近;共鉴定37个SBP基因,分布在9条染色体上;通过基因分析注释以及启动子功能预测,进一步发现SBP家族基因参与植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应、花器官发育以及植物光反应等过程。并且,玉米SBP转录因子可通过参与赤霉素、生长素、脱落酸、水杨酸等多条激素信号调控途径来调节植物的生长发育。
关键词
玉米
SBP转录因子家族
生物信息学
Keywords
Maize
SBP TFs gene family
Bioinformatics
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)敲低抑制宫颈癌SiHa细胞增殖并促进其凋亡
被引量:
7
2
作者
聂丹
刘玲
夏纪毅
汪春燕
詹平
毛熙光
机构
泸州医学院附属医院妇科
四川医科大学药物与功能性食品研究中心
出处
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期488-492,共5页
基金
四川省卫生厅科研课题(130374)
泸州市科技计划项目[2013-S-48(15/30)]
泸州医学院青年基金项目(2014QN-06)
文摘
目的研究慢病毒介导短发夹RNA(shRNA)沉默血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)基因对人宫颈癌Si Ha细胞增殖和凋亡的影响。方法用ANGPTL4 shRNA慢病毒感染Si Ha细胞,实时荧光定量PCR检测各组细胞ANGPTL4 mRNA水平,Western blot法检测ANGPTL4蛋白水平;MTT法和软琼脂克隆形成实验检测Si Ha细胞增殖能力;流式细胞术检测Si Ha细胞周期。藻红蛋白标记的annexin V和7-氨基放线菌素D联合染色(annexin V-PE/7-AAD)结合流式细胞术检测慢病毒感染后Si Ha细胞的凋亡。结果重组慢病毒感染Si Ha细胞后,LV3-ANGPTL4组Si Ha细胞中ANGPTL4 mRNA和蛋白表达水平降低;MTT结果显示,LV3-ANGPTL4组细胞增殖受抑制;软琼脂克隆形成实验显示,LV3-ANGPTL4组细胞克隆形成数减少;流式细胞术结果显示,LV3-ANGPTL4组G0/G1期细胞所占比例增加,细胞凋亡率增高。结论下调Si Ha细胞ANGPTL4的水平可抑制细胞增殖,使细胞周期阻滞于G0/G1期,诱导细胞凋亡。
关键词
血管生成素样蛋白4
慢病毒
宫颈癌
Keywords
angiopoietin-like protein 4
lentivirus
cervical cancer
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
R392-33 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米SBP转录因子全基因组鉴定与功能分析
彭华
何秀静
高健
罗茂
潘光堂
张志明
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
血管生成素样蛋白4(ANGPTL4)敲低抑制宫颈癌SiHa细胞增殖并促进其凋亡
聂丹
刘玲
夏纪毅
汪春燕
詹平
毛熙光
《细胞与分子免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
7
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