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2017年~2018年四川省猪δ冠状病毒的检测与遗传进化分析 被引量:6
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作者 冯宇 殷鑫欢 +4 位作者 徐雷 杨晓宇 鲁令华 徐志文 朱玲 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1059-1062,1071,共5页
为调查猪δ冠状病毒(PDCoV)在四川省的流行情况,本研究对2017年~2018年采集的141份仔猪腹泻病料样品经RT-PCR检测,并对检测为PDCoV的两株病毒进行全基因扩增与序列分析。结果显示,PDCoV的阳性率为4.96%(7/141),且PDCoV与猪流行性腹泻病... 为调查猪δ冠状病毒(PDCoV)在四川省的流行情况,本研究对2017年~2018年采集的141份仔猪腹泻病料样品经RT-PCR检测,并对检测为PDCoV的两株病毒进行全基因扩增与序列分析。结果显示,PDCoV的阳性率为4.96%(7/141),且PDCoV与猪流行性腹泻病毒的混合感染阳性率为2.84%(4/141)。全基因组序列分析显示两株PDCoV之间的同源性为99.3%,与其它PDCoV病毒株间的同源性为97.6%~99.0%。两株PDCoV均与越南和泰国PDCoV株的同源性最低,而之前发现的四川PDCoVCH/Sichuan/S27株与越南和泰国病毒株有较高的同源性。两株PDCoV的全基因组中均有部分碱基的插入或缺失,包括ORF1ab基因中的9 nt插入和S基因中的3 nt缺失,以及在3’UTR区域的11 nt缺失。遗传进化树分析显示,PDCoV呈现出明显的地域特征,同时中国PDCoV株呈现出4个小分支,其中两个新PDCoV株与CH/Sichuan/S27位于不同分支,表明PDCoV的基因存在多样性。本研究丰富了PDCoV在中国的分子流行特征及其遗传进化规律,为后续PDCoV的病毒学研究提供参考。 展开更多
关键词 猪δ冠状病毒 流行 全基因 遗传进化
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猪繁殖与呼吸综合征病毒与非典型瘟病毒双重RT-PCR检测方法的建立与应用 被引量:3
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作者 冯宇 杨晓宇 +3 位作者 赵军 李雨濛 徐志文 朱玲 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期156-160,共5页
为建立同时快速简便地检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)与非典型瘟病毒(APPV)两种病毒的方法,本研究根据GenBank中登录的PRRSV、APPV的基因序列,选取PRRSV的ORF2基因和APPV的NS2基因分别设计特异性引物,通过优化反应条件,建立了能够... 为建立同时快速简便地检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)与非典型瘟病毒(APPV)两种病毒的方法,本研究根据GenBank中登录的PRRSV、APPV的基因序列,选取PRRSV的ORF2基因和APPV的NS2基因分别设计特异性引物,通过优化反应条件,建立了能够同时检测PRRSV与APPV的双重RT-PCR方法。利用该方法对PRRSV、APPV重组质粒、猪瘟病毒、乙型脑炎病毒、猪流行性腹泻病毒的cDNA和阴性对照进行检测,结果显示除PRRSV和APPV重组质粒扩增结果为阳性外,其余均为阴性,表明其特异性良好;该方法对APPV和PRRSV质粒标准品的最低检出量分别为2.17×10~4拷贝/μL、3.13×10~3拷贝/μL,敏感性较高;同时批间和批内重复性试验表明该方法重复性好。利用该方法对四川地区临床73份疑似仔猪颤抖病与猪繁殖与呼吸综合征病的病料样品进行检测,结果与单一RT-PCR的检测符合率为100%。本研究建立的双重RT-PCR方法具有良好的实用性,可用于临床样品的检测,对临床早期诊断具有重要意义。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 非典型瘟病毒 双重RT-PCR
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革兰氏阴性菌TonB-ExbB-ExbD复合物的功能、作用机制、分布及进化 被引量:7
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作者 岳慧贤 程安春 刘马峰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期146-155,共10页
革兰氏阴性菌在生长繁殖过程中需要从外界摄取营养物质。一些小分子营养物质可以自由地通过革兰氏阴性菌的细胞膜,而一些大分子营养物质的转运需要特异性的TonB复合物依赖性的外膜受体进行转运。TonB复合物由TonB、ExbB、ExbD构成,是革... 革兰氏阴性菌在生长繁殖过程中需要从外界摄取营养物质。一些小分子营养物质可以自由地通过革兰氏阴性菌的细胞膜,而一些大分子营养物质的转运需要特异性的TonB复合物依赖性的外膜受体进行转运。TonB复合物由TonB、ExbB、ExbD构成,是革兰氏阴性菌对外界营养物质主动转运过程的能量提供单位,在革兰氏阴性菌分布广泛。近年来,对TonB-ExbB-ExbD复合物的功能、结构及作用机制取得了重大研究进展,然而此复合物在不同的细菌也存在功能及作用机制上的差异。基于此背景,本文综述了TonB复合物的功能和结构研究进展,并分析了TonB复合物在革兰氏阴性菌中的分布、进化,比较了不同革兰氏阴性菌此复合物的差异,有助于进一步发现和揭示TonB复合物的新功能与作用机制。 展开更多
关键词 革兰氏阴性菌 TonB复合物 进化
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部分革兰氏阴性菌胞外功能sigma因子结构与调控铁离子的利用机制 被引量:3
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作者 岳慧贤 程安春 刘马峰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期108-115,共8页
铁离子是大多数细菌生存所必需的一种营养物质,但摄入过多的铁离子也会对细菌造成损伤。因此,细菌对铁离子的摄取受到严格调控。革兰氏阴性菌对铁离子的摄取主要受Fur(ferric uptake regulator)蛋白和σ(sigma)因子的调控。σ因子是RNA... 铁离子是大多数细菌生存所必需的一种营养物质,但摄入过多的铁离子也会对细菌造成损伤。因此,细菌对铁离子的摄取受到严格调控。革兰氏阴性菌对铁离子的摄取主要受Fur(ferric uptake regulator)蛋白和σ(sigma)因子的调控。σ因子是RNA聚合酶的可解离亚基,能使RNA聚合酶结合到基因的启动子区域,从而引起基因转录。因此,σ因子在原核生物转录起始过程中必不可少。细菌中存在多种σ因子,参与铁离子调控的σ因子即是胞外功能σ因子(extra-cytoplasmic function sigma factor,ECF sigma factor)。通常,胞外功能σ因子活性可被抗σ因子(anti-sigma factor)抑制。当受到外界环境信号的刺激,σ因子与抗σ因子解离,从而使σ因子活化并结合RNA聚合酶核心酶形成全酶,引起目的基因的转录。本文将就胞外功能σ因子在σ因子家族中的分类地位、结构特点以及对3价铁离子和血红素的转运调控机制作一综述。 展开更多
关键词 胞外功能σ因子 铁离子调控 革兰氏阴性细菌
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三株益生菌对瘤胃体外发酵的影响
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作者 陈泽慧 白洁霞 +3 位作者 简平 王跃麟 倪学勤 曾东 《四川畜牧兽医》 2016年第8期21-23,共3页
通过体外产气法研究三株益生菌(植物乳酸杆菌、枯草芽孢菌、啤酒酵母)对瘤胃体外发酵的影响。试验设乳酸杆菌组、酵母菌组、芽孢杆菌组和对照组,分别在4 h、6 h、9 h、12 h、18 h、24 h、36 h、48 h测定产气量,发酵48 h后检测乳酸杆菌... 通过体外产气法研究三株益生菌(植物乳酸杆菌、枯草芽孢菌、啤酒酵母)对瘤胃体外发酵的影响。试验设乳酸杆菌组、酵母菌组、芽孢杆菌组和对照组,分别在4 h、6 h、9 h、12 h、18 h、24 h、36 h、48 h测定产气量,发酵48 h后检测乳酸杆菌、芽孢菌和酵母菌数量。结果表明:植物乳酸杆菌、啤酒酵母能明显促进瘤胃体外发酵,植物乳酸杆菌发挥作用较快,而啤酒酵母较慢但增殖能力更强。 展开更多
关键词 益生菌 体外 瘤胃发酵 产气
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