为了比较不同密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的数量性状位点(QTL)作图效率,本研究基于Maize SNP 3K和48K芯片对来源于R08×掖478的271个重组自交系(RIL)群体进行基因分型,采用完备区间作图法定位四个环境和两种种植密度条件下玉米株...为了比较不同密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的数量性状位点(QTL)作图效率,本研究基于Maize SNP 3K和48K芯片对来源于R08×掖478的271个重组自交系(RIL)群体进行基因分型,采用完备区间作图法定位四个环境和两种种植密度条件下玉米株高相关性状的QTL。结果表明,利用48K SNP芯片分型结果构建的遗传图谱分辨率高于3K(标记数:2 804个bin vs 683个SNP;图谱长:3 863.77 cM vs 1 786.06 cM;标记平均间距:1.38 cM vs 2.65 cM)。基于48K-遗传图谱在高低种植密度下定位到的QTL较3K-遗传图谱多近40%(86/62),两者共定位到28个位置相同的QTL,约占48K-遗传图谱检测到QTL总数的32.6%和3K-遗传图谱检测到QTL总数的45.2%。利用48K-遗传图谱在高种植密度下检出51个QTL,低种植密度下检出60个QTL,其中密度钝感型QTL为25个。基于高密度标记芯片作图具有更高的效率,可用于高效解析玉米数量性状。本研究结果为玉米耐密候选基因的进一步精细定位提供了理论支撑。展开更多
文摘为了比较不同密度单核苷酸多态性(SNP)芯片的数量性状位点(QTL)作图效率,本研究基于Maize SNP 3K和48K芯片对来源于R08×掖478的271个重组自交系(RIL)群体进行基因分型,采用完备区间作图法定位四个环境和两种种植密度条件下玉米株高相关性状的QTL。结果表明,利用48K SNP芯片分型结果构建的遗传图谱分辨率高于3K(标记数:2 804个bin vs 683个SNP;图谱长:3 863.77 cM vs 1 786.06 cM;标记平均间距:1.38 cM vs 2.65 cM)。基于48K-遗传图谱在高低种植密度下定位到的QTL较3K-遗传图谱多近40%(86/62),两者共定位到28个位置相同的QTL,约占48K-遗传图谱检测到QTL总数的32.6%和3K-遗传图谱检测到QTL总数的45.2%。利用48K-遗传图谱在高种植密度下检出51个QTL,低种植密度下检出60个QTL,其中密度钝感型QTL为25个。基于高密度标记芯片作图具有更高的效率,可用于高效解析玉米数量性状。本研究结果为玉米耐密候选基因的进一步精细定位提供了理论支撑。
