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夏栎抗性基因MBF1家族生物信息学分析及逆境响应研究 被引量:2
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作者 王寒葶 张秋月 +5 位作者 叶艺 吴涵 吴泓毅 陈小红 杨汉波 惠文凯 《四川农业大学学报》 北大核心 2025年第1期193-204,共12页
【目的】探究夏栎抗性基因QrMBF1家族基因特征和逆境调控机制,为培育优质的夏栎种质资源提供理论基础及数据支持。【方法】结合已公布的夏栎基因组数据库,采用生物信息学研究方法对夏栎MBF1家族成员进行核酸和蛋白序列分析;采用荧光定量... 【目的】探究夏栎抗性基因QrMBF1家族基因特征和逆境调控机制,为培育优质的夏栎种质资源提供理论基础及数据支持。【方法】结合已公布的夏栎基因组数据库,采用生物信息学研究方法对夏栎MBF1家族成员进行核酸和蛋白序列分析;采用荧光定量PCR技术解析夏栎QrMBF1s在7种不同组织中的表达模式及其对逆境的响应情况。【结果】夏栎共有2个MBF1家族成员,分别为429 bp位于8号染色体的QrMBF1b和432 bp位于2号染色体的QrMBF1c,且均为亲水性的稳定蛋白;QrMBF1家族成员的启动子序列均富含响应光照、低氧和干旱等非生物胁迫的顺式作用元件;QrMBF1b主要在根部高表达,而QrMBF1c在成熟茎、成熟叶和顶芽中表达量相对较高;夏栎QrMBF1s能够响应外源高温和水淹处理,其中QrMBF1c在逆境处理后3 h即可快速响应并显著上调。【结论】夏栎QrMBF1家族可能参与了植物的逆境调控过程,尤其是对水淹和高温条件的响应过程。本研究所获结果,对于进一步揭示QrMBF1s抗逆性的调控机制,推动夏栎抗性育种工作具有重要意义。 展开更多
关键词 夏栎 MBF1 植物抗逆 生物信息学分析
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基于广泛靶向代谢组学的桫椤孢子和孢子囊代谢产物研究
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作者 杨迪清 韦莉 +3 位作者 何莹莹 李洪非 付江涛 黄雄 《四川农业大学学报》 北大核心 2025年第5期1245-1255,共11页
【目的】探究桫椤孢子和孢子囊中代谢物的种类及含量差异,为深入理解桫椤孢子和孢子囊的生理作用,也为桫椤代谢物药用价值的开发和利用提供理论依据。【方法】以桫椤孢子和孢子囊为研究对象,运用广泛靶向代谢组学技术研究其代谢产物种... 【目的】探究桫椤孢子和孢子囊中代谢物的种类及含量差异,为深入理解桫椤孢子和孢子囊的生理作用,也为桫椤代谢物药用价值的开发和利用提供理论依据。【方法】以桫椤孢子和孢子囊为研究对象,运用广泛靶向代谢组学技术研究其代谢产物种类和丰度,通过主成分、偏最小二乘法模型,鉴定桫椤孢子和孢子囊中含量差异的代谢产物,并对差异代谢物进行KEGG富集分析。【结果】从桫椤孢子和孢子囊中共鉴定到957个化合物,属21类,主要包括132个类黄酮、47个酚酸、163个氨基酸及其衍生物等。通过偏最小二乘法模型筛选到107个差异化合物,包括氨基酸、糖类等初级代谢产物和类黄酮、植物激素等次级代谢产物,其中孢子囊相对于孢子化合物含量显著上调表达的有81个,显著下调表达的有26个。这些差异化合物主要富集在黄酮生物合成、d-氨基酸代谢、植物激素信号传导及ABC转运蛋白等通路。在13个类黄酮差异化合物中,除柚皮素查尔酮外,其余12个在孢子囊中的含量均显著高于孢子;4个酚酸差异化合物在孢子囊中的含量均显著高于孢子。【结论】桫椤孢子和孢子囊中含有大量的代谢物,差异代谢物主要富集在黄酮生物合成、植物激素信号转导等代谢通路,类黄酮和酚酸差异代谢物主要存在于孢子囊中,含量显著高于孢子。 展开更多
关键词 桫椤 树蕨 广泛靶向代谢组学 类黄酮 酚酸类
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不同水分条件下夏栎生长生理和转录组分析
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作者 刘嘉 豆梦珂 +5 位作者 李元会 胡秋红 陈睿萱 甘胜美 范江涛 黄雄 《四川农业大学学报》 北大核心 2025年第3期630-640,668,共12页
【目的】探究不同水分条件对夏栎生长生理特性和基因表达的影响,为夏栎的栽培管理、遗传改良和生态保护提供科学依据。【方法】以2 a生夏栎幼苗为研究对象,采用盆栽控水法设置5个水分梯度T1:20%田间持水量(FCW);T2:40%FCW;T3:60%FCW;T4:... 【目的】探究不同水分条件对夏栎生长生理特性和基因表达的影响,为夏栎的栽培管理、遗传改良和生态保护提供科学依据。【方法】以2 a生夏栎幼苗为研究对象,采用盆栽控水法设置5个水分梯度T1:20%田间持水量(FCW);T2:40%FCW;T3:60%FCW;T4:80%FCW;T5:100%FCW。在处理90 d后进行夏栎的生长生理指标测定以及叶片转录组测序。【结果】5个水分梯度下夏栎均处于存活状态并在持续生长,随着土壤水分的减少夏栎的株高和地径生长量减少26.39%~59.46%、9.16%~59.06%,叶片超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的活性增加了18.70%~56.98%、65.04%~121.14%。而过氧化物酶(POD)和抗坏血酸过氧化物酶(APX)的活性降低了20.41%~75.51%、7.84%~35.29%;相较于T1处理,各处理叶片中丙二醛(MDA)、过氧化氢(H_(2)O_(2))和脯氨酸(Pro)的含量减少了20.68%~65.51%、46.50%~107.00%、16.50%~107.25%,而随着土壤水分的增加可溶性糖(SS)的含量增加了15.46%~54.76%、可溶性蛋白(SP)降低了6.06%~42.42%。转录组分析在不同水分梯度下共鉴定出差异表达基因605个。这些DEGs富集在倍半萜和三萜、苯丙烷的生物合成中。此外,发现了苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)和肉桂醇脱氢酶(CAD)等关键基因的表达,在苯丙氨酸生物合成中起着至关重要的调节作用。【结论】土壤水分减少会对夏栎的生长产生负面影响,夏栎叶片通过积累渗透调节物质(Pro)来维持细胞内渗透平衡,激活抗氧化酶系统(CAT、SOD)以有效清除活性氧并减少膜脂过氧化,从而增强其耐受性。此外,在土壤水分减少的环境下,苯丙烷生物合成途径中的PAL基因的表达受到显著诱导,可能在夏栎响应不同水分梯度变化、调节其生理适应过程中发挥重要作用,为深入理解夏栎水分适应机制及筛选关键功能基因提供了理论依据。 展开更多
关键词 夏栎 不同水分处理 生长生理特性 转录组分析
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青花椒雄蕊调控基因ZaPI的克隆、鉴定与表达模式分析 被引量:1
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作者 张秋月 马乐洵 +5 位作者 郑皓 吴涵 王凯 龚伟 王景燕 惠文凯 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期73-84,165,共13页
【目的】探究青花椒雄蕊分化关键B类基因及其核酸和蛋白序列特性,并分析其在雌雄花分化过程的表达模式,为青花椒花芽性别分化的遗传调控机制提供候选基因和数据支撑。【方法】基于青花椒转录组和基因组数据库,提取雌雄花分化过程中差异... 【目的】探究青花椒雄蕊分化关键B类基因及其核酸和蛋白序列特性,并分析其在雌雄花分化过程的表达模式,为青花椒花芽性别分化的遗传调控机制提供候选基因和数据支撑。【方法】基于青花椒转录组和基因组数据库,提取雌雄花分化过程中差异表达的所有B类MADS-box家族基因,并分析获取关键成员;克隆关键成员基因编码序列,全面剖析核酸和蛋白序列特性;并解析其在11种不同组织器官以及雌雄花分化过程的表达模式。【结果】青花椒雌雄花分化过程的差异基因中共有11个B类MADS-box家族基因,其中Zardc17043(ZaPI)的表达量最高,且在雄花中极显著特异表达。该ZaPI编码序列全长624 bp,共编码207个氨基酸,含有77个氨基酸组成的MADS-box结构域和84个氨基酸组成的K-box结构域,蛋白相对分子量为24.29 kD,是位于11号染色体包含4个外显子和3个内含子且定位于细胞核的亲水性蛋白;系统进化分析显示,青花椒ZaPI与同为芸香科(Rutaceae)的克莱门柚(Citrus clementina)和甜橙(Citrus sinensis)亲缘关系最近。此外,青花椒ZaPI基因编码序列共预测到54个转录因子结合位点,主要涉及植物生殖生长和抗逆过程等多种调控途径。顺式作用元件分析发现,ZaPI启动子区富含光信号、植物激素、逆境胁迫等相关的顺式作用元件。同时,该基因在根茎叶刺等营养器官中几乎不表达,雌花分化过程的表达量也相对较低,但在雄花分化过程中呈极显著上调趋势。【结论】研究所获得的ZaPI基因与雄蕊的分化显著相关,可能与植物激素等多种信号分子互作参与了青花椒的雄蕊形成过程。研究所获结果对于进一步探究青花椒雄蕊形成的分子机制,培育高产青花椒种质资源提供了丰富的理论支撑。 展开更多
关键词 性别分化 MADS基因家族 B类基因 青花椒 生物信息学分析
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