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rDNA-ITS序列分析鉴定皮肤癣菌的应用评价
被引量:
3
1
作者
夏继宁
张能华
+1 位作者
范建国
项晶
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1648-1650,共3页
目的:探讨对核糖体RNA(ribosomal RNA,rDNA)内转录间隔区(internal transcribed space,ITS)的基因扩增测序技术在皮肤癣菌鉴定中的应用价值。方法:从39株临床收集的皮肤癣菌临床标本和经培养后的标本中分别提取DNA,应用通用引物ITS1和I...
目的:探讨对核糖体RNA(ribosomal RNA,rDNA)内转录间隔区(internal transcribed space,ITS)的基因扩增测序技术在皮肤癣菌鉴定中的应用价值。方法:从39株临床收集的皮肤癣菌临床标本和经培养后的标本中分别提取DNA,应用通用引物ITS1和ITS4进行PCR扩增和基因测序,测序结果在NCBI的基因库中查询,通过BLAST工具比对分析进行rDNA-ITS序列分析分子鉴定。同时根据形态特征、生长特性以及生理生化指标对经培养后的标本进行表型鉴定,并与分子鉴定结果相比较。结果:两组标本均成功扩增到ITS靶基因,经测序分析,临床标本和经培养后标本r DNA-ITS序列分析结果一致,与表型鉴定结果相吻合。结论:直接从临床标本中提取致病菌DNA并进行ITS基因序列扩增和测序分析可快速、有效鉴定皮肤癣菌。
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关键词
皮肤癣菌
内转录间隔区
菌种鉴定
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职称材料
题名
rDNA-ITS序列分析鉴定皮肤癣菌的应用评价
被引量:
3
1
作者
夏继宁
张能华
范建国
项晶
机构
嘉兴市中医医院皮肤科
嘉兴市
中医医院
检验科
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1648-1650,共3页
基金
嘉兴市科技局科技计划项目(2014AY21033-4)
文摘
目的:探讨对核糖体RNA(ribosomal RNA,rDNA)内转录间隔区(internal transcribed space,ITS)的基因扩增测序技术在皮肤癣菌鉴定中的应用价值。方法:从39株临床收集的皮肤癣菌临床标本和经培养后的标本中分别提取DNA,应用通用引物ITS1和ITS4进行PCR扩增和基因测序,测序结果在NCBI的基因库中查询,通过BLAST工具比对分析进行rDNA-ITS序列分析分子鉴定。同时根据形态特征、生长特性以及生理生化指标对经培养后的标本进行表型鉴定,并与分子鉴定结果相比较。结果:两组标本均成功扩增到ITS靶基因,经测序分析,临床标本和经培养后标本r DNA-ITS序列分析结果一致,与表型鉴定结果相吻合。结论:直接从临床标本中提取致病菌DNA并进行ITS基因序列扩增和测序分析可快速、有效鉴定皮肤癣菌。
关键词
皮肤癣菌
内转录间隔区
菌种鉴定
分类号
R692 [医药卫生—泌尿科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
rDNA-ITS序列分析鉴定皮肤癣菌的应用评价
夏继宁
张能华
范建国
项晶
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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