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5个猪种DKK2基因结构变异DKK2-I1-sv89的多态性研究
1
作者
龙菊烟
卢圣菲
+5 位作者
田姣
牛熙
陈霞
黄世会
冉雪琴
王嘉福
《河南农业科学》
北大核心
2025年第4期129-135,共7页
前期基因组学分析结果表明,猪Dickkopf-2(DKK2)基因内含子1中存在一个结构变异(89 bp,DKK2-I1-sv89),为探究该结构变异(SV)在不同猪品种中多态性分布以及对基因表达的影响,针对该SV序列设计特异性引物,通过PCR验证DKK2-I1-sv89在贵州地...
前期基因组学分析结果表明,猪Dickkopf-2(DKK2)基因内含子1中存在一个结构变异(89 bp,DKK2-I1-sv89),为探究该结构变异(SV)在不同猪品种中多态性分布以及对基因表达的影响,针对该SV序列设计特异性引物,通过PCR验证DKK2-I1-sv89在贵州地方猪种(香猪、黔北黑猪、柯乐猪、江口萝卜猪)和欧洲猪种(大白猪)共5个猪品种中的群体分布;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测不同基因型之间香猪卵巢组织中DKK2基因的表达差异;采用生物信息学分析DKK2-I1-sv89结构变异区存在的功能元件。结果表明,香猪和黔北黑猪检测到3种基因型(插入型Ⅱ、杂合型DI与野生型DD),大白猪仅检测到1种基因型(DD),柯乐猪、黔北黑猪检测到2种基因型(DI和DD)。5个猪种比较,4个贵州地方猪种的插入型等位基因(Ⅰ等位基因)频率均高于大白猪。生物信息学分析结果显示,DKK2-I1-sv89结构变异区含有1个内含子剪接增强子(ISE)和13个RNA结合蛋白(RBP)结合位点,定量性状位点(QTL)分析显示,该SV位点的QTL与繁殖、肉质和健康性状相关。进一步检测了Ⅱ型、DI型和DD型香猪卵巢组织中DKK2基因表达量,结果显示,Ⅱ型基因型极显著高于DI型和DD型,DI型和DD型无统计学差异。综上,DKK2-I1-sv89的多态性分布频率在贵州地方猪品种和欧洲猪种中有差异,且该SV的插入有利于DKK2基因在卵巢中的表达,可作为区分欧洲猪种和贵州地方猪种的分子标记。
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关键词
猪
DKK2基因
结构变异
多态性
基因表达
在线阅读
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职称材料
过表达杜仲EuDIR1基因对番茄灰霉病的抗性影响研究
被引量：
1
2
作者
徐艳
杨金玉
+2 位作者
陈炳竹
赵德刚
赵懿琛
《种子》
北大核心
2024年第2期10-17,29,共9页
Dirigent(DIR)蛋白在木质素的合成中发挥重要作用,同时还能提高植物对各种病原体的抗性。本研究以克隆的杜仲Dirigent1基因(EuDIR1)为基础,构建EuDIR1过表达载体遗传转化番茄,获得转基因植株后分析EuDIR1基因在番茄抗灰霉病中的作用。...
Dirigent(DIR)蛋白在木质素的合成中发挥重要作用,同时还能提高植物对各种病原体的抗性。本研究以克隆的杜仲Dirigent1基因(EuDIR1)为基础,构建EuDIR1过表达载体遗传转化番茄,获得转基因植株后分析EuDIR1基因在番茄抗灰霉病中的作用。结果表明,与野生型和转空载番茄相比,接种灰霉菌后过表达EuDIR1基因的番茄发病更晚,病斑直径显著小于野生型与转空载植株,说明EuDIR1显著提高了番茄植株对灰霉病的抗性。过表达EuDIR1基因还可提高番茄植株接菌前后的保护酶活性与番茄病程相关蛋白(PRs)的基因表达,从而增强植株对灰霉病的抗性。此外,EuDIR1基因过表达后番茄叶片和茎的木质素含量都显著增加,且木质部导管附近的细胞壁显著增厚,推测EuDIR1基因可能通过增加番茄中木质素的含量,增厚番茄木质部导管附近的细胞壁来增强番茄对灰霉病的抗性。本研究揭示EuDIR1基因在番茄抗灰霉病中的功能,可为番茄抗病育种提供理论依据和利用途径。
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关键词
EuDIR1基因
番茄
灰霉病
木质素
抗病
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职称材料
杜仲翅果果实形态和含胶量与产地环境相关性分析
被引量：
1
3
作者
曲鹏坤
陈锡
赵德刚
《林业科技情报》
2024年第2期60-63,共4页
该研究选择我国7个杜仲产地的杜仲为研究对象,采用随机取样的方法,利用SPSS软件进行统计分析。结果表明:不同产地果实形态和含胶量存在显著差异,贵州剑河最高为13.16%,河北保定最低为9.34%,含胶量与所在环境气候条件密切相关,纬度越高,...
该研究选择我国7个杜仲产地的杜仲为研究对象,采用随机取样的方法,利用SPSS软件进行统计分析。结果表明:不同产地果实形态和含胶量存在显著差异,贵州剑河最高为13.16%,河北保定最低为9.34%,含胶量与所在环境气候条件密切相关,纬度越高,年日照时数越长,翅果含胶量越低;无霜期越长,翅果含胶率越高。
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关键词
杜仲
翅果
杜仲胶
差异性分析
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职称材料
题名
5个猪种DKK2基因结构变异DKK2-I1-sv89的多态性研究
1
作者
龙菊烟
卢圣菲
田姣
牛熙
陈霞
黄世会
冉雪琴
王嘉福
机构
贵州
大学生命科学学院/农业生物
工程
研究
院/山地
植物
资源
保护与保护种质创新教育部重点实验室
贵州
电子科技职业学院
贵州
省农业生物
工程
重点实验室
喀斯特
山区
植物
资源
利用与
育种
国家地方联合工程研究中心
(
贵州
)
贵州
大学动物科学学院/高原山地动物遗传
育种
与繁殖教育部重点实验室
出处
《河南农业科学》
北大核心
2025年第4期129-135,共7页
基金
贵州省普通高等学校青年人才成长项目(黔教合字[2022]152号)
贵州大学引进人才科研项目(贵大人基合字[2023]43号)
+2 种基金
国家自然科学基金项目(32360810,31960641)
贵州省科技创新人才团队项目(黔科合平台人才[2019]5615)
贵州省“百”层次创新型人才培养项目(黔科合人才[2016]4012)。
文摘
前期基因组学分析结果表明,猪Dickkopf-2(DKK2)基因内含子1中存在一个结构变异(89 bp,DKK2-I1-sv89),为探究该结构变异(SV)在不同猪品种中多态性分布以及对基因表达的影响,针对该SV序列设计特异性引物,通过PCR验证DKK2-I1-sv89在贵州地方猪种(香猪、黔北黑猪、柯乐猪、江口萝卜猪)和欧洲猪种(大白猪)共5个猪品种中的群体分布;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测不同基因型之间香猪卵巢组织中DKK2基因的表达差异;采用生物信息学分析DKK2-I1-sv89结构变异区存在的功能元件。结果表明,香猪和黔北黑猪检测到3种基因型(插入型Ⅱ、杂合型DI与野生型DD),大白猪仅检测到1种基因型(DD),柯乐猪、黔北黑猪检测到2种基因型(DI和DD)。5个猪种比较,4个贵州地方猪种的插入型等位基因(Ⅰ等位基因)频率均高于大白猪。生物信息学分析结果显示,DKK2-I1-sv89结构变异区含有1个内含子剪接增强子(ISE)和13个RNA结合蛋白(RBP)结合位点,定量性状位点(QTL)分析显示,该SV位点的QTL与繁殖、肉质和健康性状相关。进一步检测了Ⅱ型、DI型和DD型香猪卵巢组织中DKK2基因表达量,结果显示,Ⅱ型基因型极显著高于DI型和DD型,DI型和DD型无统计学差异。综上,DKK2-I1-sv89的多态性分布频率在贵州地方猪品种和欧洲猪种中有差异,且该SV的插入有利于DKK2基因在卵巢中的表达,可作为区分欧洲猪种和贵州地方猪种的分子标记。
关键词
猪
DKK2基因
结构变异
多态性
基因表达
Keywords
Pig
DKK2 gene
Structural variation
Polymorphism
Gene expression
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
过表达杜仲EuDIR1基因对番茄灰霉病的抗性影响研究
被引量：
1
2
作者
徐艳
杨金玉
陈炳竹
赵德刚
赵懿琛
机构
贵州
大学生命科学学院/茶学院/山地
植物
资源
保护与种质创新教育部重点实验室
贵州
省农业生物
工程
重点实验室
喀斯特
山区
植物
资源
利用与
育种
国家地方联合工程研究中心
(
贵州
)
贵州
省农业科学院农业生物技术重点实验室/
植物
保育技术应用
工程
研究
中心
出处
《种子》
北大核心
2024年第2期10-17,29,共9页
基金
中央引导地方科技发展资金(黔科合中引地[2023]009)
国家自然科学基金(31870285,31660076)
+1 种基金
贵州省农业科学院人才专项([2022]02号)
贵州省人才办贵州省特色植物种质资源利用与创新人才基地(RCJD2018-14)。
文摘
Dirigent(DIR)蛋白在木质素的合成中发挥重要作用,同时还能提高植物对各种病原体的抗性。本研究以克隆的杜仲Dirigent1基因(EuDIR1)为基础,构建EuDIR1过表达载体遗传转化番茄,获得转基因植株后分析EuDIR1基因在番茄抗灰霉病中的作用。结果表明,与野生型和转空载番茄相比,接种灰霉菌后过表达EuDIR1基因的番茄发病更晚,病斑直径显著小于野生型与转空载植株,说明EuDIR1显著提高了番茄植株对灰霉病的抗性。过表达EuDIR1基因还可提高番茄植株接菌前后的保护酶活性与番茄病程相关蛋白(PRs)的基因表达,从而增强植株对灰霉病的抗性。此外,EuDIR1基因过表达后番茄叶片和茎的木质素含量都显著增加,且木质部导管附近的细胞壁显著增厚,推测EuDIR1基因可能通过增加番茄中木质素的含量,增厚番茄木质部导管附近的细胞壁来增强番茄对灰霉病的抗性。本研究揭示EuDIR1基因在番茄抗灰霉病中的功能,可为番茄抗病育种提供理论依据和利用途径。
关键词
EuDIR1基因
番茄
灰霉病
木质素
抗病
Keywords
EuDIR1 gene
tomato
Botrytis cinerea
lignin
disease resistance
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
杜仲翅果果实形态和含胶量与产地环境相关性分析
被引量：
1
3
作者
曲鹏坤
陈锡
赵德刚
机构
贵州
省农业科学院
植物
保育技术应用
工程
中心
、
贵州
省农业生物技术重点实验室
贵州
大学生命科学学院/农业生物
工程
研究
院
出处
《林业科技情报》
2024年第2期60-63,共4页
基金
贵州省农业科学院人才专项(黔农科院人才专项[2022]02号)
贵州省人才办贵州省特色植物种质资源利用与创新人才基地(RCJD2018-14)。
文摘
该研究选择我国7个杜仲产地的杜仲为研究对象,采用随机取样的方法,利用SPSS软件进行统计分析。结果表明:不同产地果实形态和含胶量存在显著差异,贵州剑河最高为13.16%,河北保定最低为9.34%,含胶量与所在环境气候条件密切相关,纬度越高,年日照时数越长,翅果含胶量越低;无霜期越长,翅果含胶率越高。
关键词
杜仲
翅果
杜仲胶
差异性分析
Keywords
Eucommia ulmoides Oliv.
samara
gutta-percha
difference analysis
分类号
S794.9 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
5个猪种DKK2基因结构变异DKK2-I1-sv89的多态性研究
龙菊烟
卢圣菲
田姣
牛熙
陈霞
黄世会
冉雪琴
王嘉福
《河南农业科学》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
过表达杜仲EuDIR1基因对番茄灰霉病的抗性影响研究
徐艳
杨金玉
陈炳竹
赵德刚
赵懿琛
《种子》
北大核心
2024
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
杜仲翅果果实形态和含胶量与产地环境相关性分析
曲鹏坤
陈锡
赵德刚
《林业科技情报》
2024
1
在线阅读
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职称材料
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