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宫颈癌中转移相关基因MTA1高表达的临床意义及其协同表达基因的生物信息学分析
被引量：
8
1
作者
范淑英
李春晓
+6 位作者
林锋
李慧
南楠
周春霞
钱海利
王海娟
张颖
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期363-367,共5页
目的分析转移相关基因MTA1高表达与宫颈癌临床转移的相关性,并筛选MTA1协同表达基因网络中的潜在干预靶点基因。方法应用SPSS软件分析TCGA-CESC数据集中MTA1与宫颈癌转移和病理分级的相关性,应用edge R软件分析该数据集中MTA1高表达组...
目的分析转移相关基因MTA1高表达与宫颈癌临床转移的相关性,并筛选MTA1协同表达基因网络中的潜在干预靶点基因。方法应用SPSS软件分析TCGA-CESC数据集中MTA1与宫颈癌转移和病理分级的相关性,应用edge R软件分析该数据集中MTA1高表达组与低表达组的全转录组差异表达基因,应用DAVID平台对这些差异表达基因进行聚类分析,应用STRING在线平台和Cytospace软件对这些基因进行互作网络分析,筛选关键的网络节点基因。结果TCGA-CESC宫颈癌数据库中MTA1表达水平与肿瘤临床转移和病理分级呈显著正相关(P<0.01),在不同MTA1表达水平的宫颈癌转录组中存在显著且较一致的差异表达基因集,这些基因主要聚集在癌症通路、干细胞通路、细胞转移、细胞分化等方面,与肿瘤的恶性生物学行为显著相关。基因筛选显示,宫颈癌中与MTA1协同表达的Agt、Acta1、Fpr2、Pmch和RGS18等基因是差异表达基因集中最重要的节点基因,这些基因聚集在GPCR相关通路。结论 MTA1高表达与宫颈癌转移显著相关,且与肿瘤细胞的干细胞通路、趋化因子受体通路、细胞转移、细胞分化等基因调控网络活化相关。MTA1的协同表达基因网络中的节点基因可能参与了宫颈癌的转移调控,并最有可能成为宫颈癌治疗的分子靶点。
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关键词
转移相关基因1
宫颈肿瘤
计算机生物学
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题名
宫颈癌中转移相关基因MTA1高表达的临床意义及其协同表达基因的生物信息学分析
被引量：
8
1
作者
范淑英
李春晓
林锋
李慧
南楠
周春霞
钱海利
王海娟
张颖
机构
唐山市开滦总医院妇产科
中国医学科学院北京协和医学院肿瘤
医院
分子肿瘤学国家重点实验室
首都医科大学附属北京妇产
医院
妇科微创中心
出处
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期363-367,共5页
基金
国家自然科学基金(81572842,81372159)
北京市自然科学基金(7132071)
北京市卫生系统高层次卫生技术人才学科骨干项目(2015-3-090)~~
文摘
目的分析转移相关基因MTA1高表达与宫颈癌临床转移的相关性,并筛选MTA1协同表达基因网络中的潜在干预靶点基因。方法应用SPSS软件分析TCGA-CESC数据集中MTA1与宫颈癌转移和病理分级的相关性,应用edge R软件分析该数据集中MTA1高表达组与低表达组的全转录组差异表达基因,应用DAVID平台对这些差异表达基因进行聚类分析,应用STRING在线平台和Cytospace软件对这些基因进行互作网络分析,筛选关键的网络节点基因。结果TCGA-CESC宫颈癌数据库中MTA1表达水平与肿瘤临床转移和病理分级呈显著正相关(P<0.01),在不同MTA1表达水平的宫颈癌转录组中存在显著且较一致的差异表达基因集,这些基因主要聚集在癌症通路、干细胞通路、细胞转移、细胞分化等方面,与肿瘤的恶性生物学行为显著相关。基因筛选显示,宫颈癌中与MTA1协同表达的Agt、Acta1、Fpr2、Pmch和RGS18等基因是差异表达基因集中最重要的节点基因,这些基因聚集在GPCR相关通路。结论 MTA1高表达与宫颈癌转移显著相关,且与肿瘤细胞的干细胞通路、趋化因子受体通路、细胞转移、细胞分化等基因调控网络活化相关。MTA1的协同表达基因网络中的节点基因可能参与了宫颈癌的转移调控,并最有可能成为宫颈癌治疗的分子靶点。
关键词
转移相关基因1
宫颈肿瘤
计算机生物学
Keywords
metastasis-associated gene 1
uterine cervical neoplasms
computational biology
分类号
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
宫颈癌中转移相关基因MTA1高表达的临床意义及其协同表达基因的生物信息学分析
范淑英
李春晓
林锋
李慧
南楠
周春霞
钱海利
王海娟
张颖
《解放军医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
8
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