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基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析
1
作者
马福仙
魏健生
+1 位作者
耿云芬
张汉尧
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2023年第1期175-181,共7页
为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因...
为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因组全长155800 bp,是典型的四分结构,由1对长为29296 bp的IR、1个长为16864 bp的SSC和1个长86399 bp的LSC组成;该基因组包括84个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因;系统进化分析显示,哈巴乌头和中甸乌头聚在同一个分支;叶绿体基因组密码子的3个位置上GC含量依次为GC1(46.65%)>GC2(39.71%)>GC3(29.01%),说明其偏好以A/U结尾;有效密码子数(ENC)范围为36.77~58.98,ENC值>45的编码序列有36个,说明密码子偏性低;中性绘图等分析显示哈巴乌头叶绿体基因组密码子偏好性受选择的影响较大;最优密码子有14个,均以A/U结尾。本研究为哈巴乌头叶绿体基因工程、种源鉴定等研究提供参考依据。
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关键词
哈巴乌头
Illumina测序
叶绿体基因组
密码子偏好性
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职称材料
松华坝水库天然林植物多样性调查研究
2
作者
夏嘉禹
刘强
+4 位作者
吴训锋
唐宗英
王博轶
赵亚玲
和丽华
《林业调查规划》
2024年第1期156-162,共7页
根据松华坝水库天然林群落的不同海拔梯度以及不同坡向设置36个典型样方进行调查。对松华坝水库物种组成、种子植物区系、群落各层次物种的重要值以及植物多样性进行分析。结果表明:调查到维管植物300种;乔木层云南松种群占绝对优势;水...
根据松华坝水库天然林群落的不同海拔梯度以及不同坡向设置36个典型样方进行调查。对松华坝水库物种组成、种子植物区系、群落各层次物种的重要值以及植物多样性进行分析。结果表明:调查到维管植物300种;乔木层云南松种群占绝对优势;水库天然林从乔木到灌木再到草本,植物多样性水平递增;随着海拔的上升,植物多样性水平先升高再降低;从阳坡到半阴坡再到阴坡,植被多样性水平先升高再降低。
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关键词
松华坝水库天然林群落
物种组成
种子植物区系
植物多样性
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职称材料
极危植物西藏白皮松引种育苗技术研究
3
作者
罗利彬
苏震雷
+3 位作者
张庆
泽仁卓玛
杨波
魏健生
《林业调查规划》
2024年第5期36-41,共6页
对不同浓度赤霉素处理下的西藏白皮松种子出苗量以及不同育苗基质的西藏白皮松幼苗苗高和地径两个指标进行差异性综合评价。使用3种浓度为800、1000、1200 mg/L的赤霉素处理种子,设置空白对照组CK。以云南松森林腐殖土、耕作土、红土、...
对不同浓度赤霉素处理下的西藏白皮松种子出苗量以及不同育苗基质的西藏白皮松幼苗苗高和地径两个指标进行差异性综合评价。使用3种浓度为800、1000、1200 mg/L的赤霉素处理种子,设置空白对照组CK。以云南松森林腐殖土、耕作土、红土、菌包土为育苗基质原材料,加入少量珍珠岩、蛭石,按照同体积称重方式配制成3种育苗基质,设置空白对照组CK,按照随机区组3次重复试验设计方法,布置育苗基质对西藏白皮松育苗影响的田间试验。结果表明,赤霉素浓度为1000 mg/L时,出苗率效果最好。根据3期的实验调查,4种不同的育苗基质对西藏白皮松幼苗的生长量差异显著。基质2(森林腐殖土+泥炭土+蛭石)的理化性质为幼苗提供了充足的生长条件,对幼苗的生长量影响最大,其次为基质3(红土+森林腐殖土+珍珠岩),基质1(红土+耕作土+森林腐殖土)的表现欠佳。
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关键词
西藏白皮松
种子育苗
育苗基质
苗木质量
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职称材料
题名
基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析
1
作者
马福仙
魏健生
耿云芬
张汉尧
机构
西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业
局
重点实验室
云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室
哈巴雪山省级自然保护区管护局
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2023年第1期175-181,共7页
基金
昆明市国际(对外)科技合作基地(GHJD-2020031)
云南省产业技术领军人才(YNWR-CYJS-2018-037)
“气候变化影响下哈巴雪山珍稀濒危植物种质资源保存与人工繁育技术研究项目”共同资助。
文摘
为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因组全长155800 bp,是典型的四分结构,由1对长为29296 bp的IR、1个长为16864 bp的SSC和1个长86399 bp的LSC组成;该基因组包括84个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因;系统进化分析显示,哈巴乌头和中甸乌头聚在同一个分支;叶绿体基因组密码子的3个位置上GC含量依次为GC1(46.65%)>GC2(39.71%)>GC3(29.01%),说明其偏好以A/U结尾;有效密码子数(ENC)范围为36.77~58.98,ENC值>45的编码序列有36个,说明密码子偏性低;中性绘图等分析显示哈巴乌头叶绿体基因组密码子偏好性受选择的影响较大;最优密码子有14个,均以A/U结尾。本研究为哈巴乌头叶绿体基因工程、种源鉴定等研究提供参考依据。
关键词
哈巴乌头
Illumina测序
叶绿体基因组
密码子偏好性
Keywords
Aconitum habaense
Illumina sequencing
chloroplast genome
codon usage bias
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
松华坝水库天然林植物多样性调查研究
2
作者
夏嘉禹
刘强
吴训锋
唐宗英
王博轶
赵亚玲
和丽华
机构
云南林业职业技术学院
云南云绪林业规划管理有限公司
哈巴雪山省级自然保护区管护局
出处
《林业调查规划》
2024年第1期156-162,共7页
基金
云南林业职业技术学院校级科研项目(KY(QN)202115)。
文摘
根据松华坝水库天然林群落的不同海拔梯度以及不同坡向设置36个典型样方进行调查。对松华坝水库物种组成、种子植物区系、群落各层次物种的重要值以及植物多样性进行分析。结果表明:调查到维管植物300种;乔木层云南松种群占绝对优势;水库天然林从乔木到灌木再到草本,植物多样性水平递增;随着海拔的上升,植物多样性水平先升高再降低;从阳坡到半阴坡再到阴坡,植被多样性水平先升高再降低。
关键词
松华坝水库天然林群落
物种组成
种子植物区系
植物多样性
Keywords
natural forest communities in Songhuaba Reservoir
species composition
seed plant flora
plant diversity
分类号
S718.551 [农业科学—林学]
Q16 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
极危植物西藏白皮松引种育苗技术研究
3
作者
罗利彬
苏震雷
张庆
泽仁卓玛
杨波
魏健生
机构
迪庆藏族自治州林草种苗和国有林场管理工作站
迪庆藏族自治州林业双中心
云南省
哈巴雪山省级自然保护区管护局
出处
《林业调查规划》
2024年第5期36-41,共6页
文摘
对不同浓度赤霉素处理下的西藏白皮松种子出苗量以及不同育苗基质的西藏白皮松幼苗苗高和地径两个指标进行差异性综合评价。使用3种浓度为800、1000、1200 mg/L的赤霉素处理种子,设置空白对照组CK。以云南松森林腐殖土、耕作土、红土、菌包土为育苗基质原材料,加入少量珍珠岩、蛭石,按照同体积称重方式配制成3种育苗基质,设置空白对照组CK,按照随机区组3次重复试验设计方法,布置育苗基质对西藏白皮松育苗影响的田间试验。结果表明,赤霉素浓度为1000 mg/L时,出苗率效果最好。根据3期的实验调查,4种不同的育苗基质对西藏白皮松幼苗的生长量差异显著。基质2(森林腐殖土+泥炭土+蛭石)的理化性质为幼苗提供了充足的生长条件,对幼苗的生长量影响最大,其次为基质3(红土+森林腐殖土+珍珠岩),基质1(红土+耕作土+森林腐殖土)的表现欠佳。
关键词
西藏白皮松
种子育苗
育苗基质
苗木质量
Keywords
Pinus gerardiana
seed seedling
seedling matrix
seedling quality
分类号
S722.7 [农业科学—林木遗传育种]
S723.1 [农业科学—林木遗传育种]
S791.243 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析
马福仙
魏健生
耿云芬
张汉尧
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2023
0
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下载PDF
职称材料
2
松华坝水库天然林植物多样性调查研究
夏嘉禹
刘强
吴训锋
唐宗英
王博轶
赵亚玲
和丽华
《林业调查规划》
2024
0
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职称材料
3
极危植物西藏白皮松引种育苗技术研究
罗利彬
苏震雷
张庆
泽仁卓玛
杨波
魏健生
《林业调查规划》
2024
0
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参考文献
引证文献
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