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基于网络药理学与分子对接的丹皮酚治疗结直肠癌的分子机制研究
被引量：
1
1
作者
高吴陆怡
王静艳
+3 位作者
舒岑皓
尚德淑
韩锁
商宇
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第11期992-998,共7页
目的基于网络药理学与分子对接探讨丹皮酚治疗结直肠癌的靶点与作用机制。方法通过PubChem、SwissTargetPrediction和TargetNet数据库检索丹皮酚的药物靶点,使用Genecards、OMIM和TTD数据库检索结直肠癌的疾病靶点,通过Venny在线工具获...
目的基于网络药理学与分子对接探讨丹皮酚治疗结直肠癌的靶点与作用机制。方法通过PubChem、SwissTargetPrediction和TargetNet数据库检索丹皮酚的药物靶点,使用Genecards、OMIM和TTD数据库检索结直肠癌的疾病靶点,通过Venny在线工具获得交集靶点。利用Metascape数据库完成交集靶点的基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组数据库(KEGG)信号通路富集分析。交集靶点经STRING数据库与Cytoscape软件分析其相互作用关系并筛选枢纽节点。采用LeDock与CB-Dock2软件完成丹皮酚与枢纽节点的分子对接,以筛选丹皮酚的核心药物靶点。结果经筛选得到21个药物靶点。富集分析结果显示,丹皮酚发挥作用的分子机制涉及癌症通路、Ras信号和Rap1信号等通路,而其涉及的生物过程包括细胞对缺氧的反应以及调控激酶活性等。蛋白质-蛋白质相互作用分析发现9个靶点为蛋白质相互作用的枢纽。分子对接结果显示,丹皮酚和枢纽节点中的SRC、EP300、MMP9具有最高亲和力,提示SRC、EP300以及MMP9可能是丹皮酚治疗结直肠癌的核心靶点。结论丹皮酚可能通过靶向SRC、EP300与MMP9,调控Ras、Rap1等信号通路与激酶活性等生物过程,进而发挥治疗结直肠癌的作用。
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关键词
结直肠癌
丹皮酚
网络药理学
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学与分子对接的丹皮酚治疗结直肠癌的分子机制研究
被引量：
1
1
作者
高吴陆怡
王静艳
舒岑皓
尚德淑
韩锁
商宇
机构
佳木斯
大学
基础医学院微生态-免疫调节网络与相关疾病重点实验室
佳木斯
大学
附属第
一
医院
康复医学科
中国
医科大
学生命科学学院发育细胞生物学教研室
哈尔滨医科大学附属第四医院中心导管室
出处
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第11期992-998,共7页
基金
黑龙江省省属高等学校基本科研业务费项目(2019-KYYWF-1340)。
文摘
目的基于网络药理学与分子对接探讨丹皮酚治疗结直肠癌的靶点与作用机制。方法通过PubChem、SwissTargetPrediction和TargetNet数据库检索丹皮酚的药物靶点,使用Genecards、OMIM和TTD数据库检索结直肠癌的疾病靶点,通过Venny在线工具获得交集靶点。利用Metascape数据库完成交集靶点的基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组数据库(KEGG)信号通路富集分析。交集靶点经STRING数据库与Cytoscape软件分析其相互作用关系并筛选枢纽节点。采用LeDock与CB-Dock2软件完成丹皮酚与枢纽节点的分子对接,以筛选丹皮酚的核心药物靶点。结果经筛选得到21个药物靶点。富集分析结果显示,丹皮酚发挥作用的分子机制涉及癌症通路、Ras信号和Rap1信号等通路,而其涉及的生物过程包括细胞对缺氧的反应以及调控激酶活性等。蛋白质-蛋白质相互作用分析发现9个靶点为蛋白质相互作用的枢纽。分子对接结果显示,丹皮酚和枢纽节点中的SRC、EP300、MMP9具有最高亲和力,提示SRC、EP300以及MMP9可能是丹皮酚治疗结直肠癌的核心靶点。结论丹皮酚可能通过靶向SRC、EP300与MMP9,调控Ras、Rap1等信号通路与激酶活性等生物过程,进而发挥治疗结直肠癌的作用。
关键词
结直肠癌
丹皮酚
网络药理学
分子对接
Keywords
colorectal cancer
paeonol
network pharmacology
molecular docking
分类号
R258 [医药卫生—中医内科学]
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1
基于网络药理学与分子对接的丹皮酚治疗结直肠癌的分子机制研究
高吴陆怡
王静艳
舒岑皓
尚德淑
韩锁
商宇
《中国医科大学学报》
CAS
北大核心
2023
1
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