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主成分分析与聚类分析在民族分化研究中的应用比较 被引量:21
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作者 张瑞杰 郭政 +2 位作者 李霞 薛雅丽 傅松滨 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2002年第4期201-203,共3页
目的 比较主成分分析与聚类分析两种聚类方法对 13个人群进行分类的结果。方法 采用两种数值分类方法并用Y染色体的 12种单体型的双等位基因频率数据 ,对朝鲜族等 13个人群进行分类 ,分析群体间的关系 ,并阐明民族的起源。结果 两种... 目的 比较主成分分析与聚类分析两种聚类方法对 13个人群进行分类的结果。方法 采用两种数值分类方法并用Y染色体的 12种单体型的双等位基因频率数据 ,对朝鲜族等 13个人群进行分类 ,分析群体间的关系 ,并阐明民族的起源。结果 两种分类方法得到的结果不尽相同。主成分分析可以减少无关指标的影响 ,但是在简化数据降低维数的过程中又有可能丢失信息。聚类分析充分利用原始数据信息 ,但无法排除无关指标的“噪音”干扰。结论 主成分分析与聚类分析都适宜做多维复杂数据的分类研究 ,但在实际应用中 ,应运用两种分类方法得到的结果结合领域知识给出客观、合理的结论。 展开更多
关键词 主成分分析 聚类分析 民族分化研究 单体型 双等位基因频率
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介导多药耐药的ABC转运蛋白超家族与MTX耐药性的关系研究 被引量:9
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作者 张春玉 冯源熙 +1 位作者 李璞 傅松滨 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期1201-1205,共5页
细胞耐药性的产生是导致肿瘤化疗失败的重要因素,尤其是多药耐药是目前研究的一个重点。ABC转运蛋白超家族成员介导药物的外排,与多药耐药密切相关。为了解该家族成员与MTX耐药的相关性,进一步探讨MTX的耐药机制,应用SuperArray基因芯片... 细胞耐药性的产生是导致肿瘤化疗失败的重要因素,尤其是多药耐药是目前研究的一个重点。ABC转运蛋白超家族成员介导药物的外排,与多药耐药密切相关。为了解该家族成员与MTX耐药的相关性,进一步探讨MTX的耐药机制,应用SuperArray基因芯片对MTX耐药前后编码ABC转运蛋白超家族成员的mdr1、mrp1、mrp2、mrp3、mrp5、mrp6和abcg27个基因进行检测,并对MRP1和MRP5蛋白表达进行了验证。结果显示,与MTX耐药性相关的ABC转运蛋白超家族成员主要为多药耐药相关蛋白,其中mrp1和mrp5呈现高表达,并且,在MTX抗性细胞中,MRP5在mRNA及蛋白水平的表达均明显增强,提示其在MTX耐药机制中起重要作用,可能为潜在的药物作用靶点。 展开更多
关键词 多药耐药 ABC转运蛋白超家族 MTX耐药性 SuperArray WESTERN BLOT MRP1 mrp5
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野生型P53、P16基因协同对肺腺癌细胞系生长抑制作用的研究 被引量:5
3
作者 闫承慧 王柏秋 +2 位作者 吴焱 傅松滨 李璞 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期1-4,共4页
为了探讨野生型P5 3基因及P16基因在恶性肿瘤基因治疗中的作用 ,用腺病毒为载体将野生型P5 3基因转入高、低转移的肺腺癌细胞系Anip973、AGZY83 -a和经野生型P16基因质粒转染的高、低转移肺腺癌细胞系Anip973(Anip973P16 )、AGZY83-a(AG... 为了探讨野生型P5 3基因及P16基因在恶性肿瘤基因治疗中的作用 ,用腺病毒为载体将野生型P5 3基因转入高、低转移的肺腺癌细胞系Anip973、AGZY83 -a和经野生型P16基因质粒转染的高、低转移肺腺癌细胞系Anip973(Anip973P16 )、AGZY83-a(AGZY83-aP16 )。对各组转染细胞进行生长曲线、MTT生长抑制率、原位末端标记、Western -blotting等技术检测分析。结果发现 (1)野生型P5 3蛋白的过表达对上述肺腺癌细胞系均呈现出较强的生长抑制作用。 (2 )野生型P5 3蛋白的过表达对高转移肺癌细胞系Anip973的抑制作用明显高于低转移细胞系AGZY83 -a。 (3)野生型p5 3蛋白的过表达对经野生型P16基因转染的高、低转移的肺癌细胞Anip973、AGZY83-a抑制作用明显高于未经P16基因转染的细胞。野生型P5 3基因可以作为肺腺癌基因治疗的候选基因。肿瘤抑制基因P5 3、P16的联合转染可能是对肺腺癌进行基因治疗的有效手段。 展开更多
关键词 野生型P53基因 P16基因 腺病毒 高转移肺癌细胞系 ANIP973 低转移肺癌细胞系AGZY83-a
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rab5a基因在肿瘤转移中的作用研究 被引量:6
4
作者 史忠诚 于旸 +1 位作者 李钰 傅松滨 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期694-698,共5页
为研究rab5a基因在肿瘤转移机制中的作用,将该基因稳定转染至低转移肺腺癌细胞系AGZY83-a中,采用Superarray肿瘤转移相关基因微芯片分析rab5a对肿瘤转移相关基因的表达影响。共获得了5个差异表达基因,rab5a基因促进s100a4的表达,同时抑... 为研究rab5a基因在肿瘤转移机制中的作用,将该基因稳定转染至低转移肺腺癌细胞系AGZY83-a中,采用Superarray肿瘤转移相关基因微芯片分析rab5a对肿瘤转移相关基因的表达影响。共获得了5个差异表达基因,rab5a基因促进s100a4的表达,同时抑制了nm23ar、ac1、cst3、col4a2等基因的表达,并分别在RNA及蛋白水平进行验证,确认rab5a基因影响了肿瘤转移的多个途径,促进了肿瘤细胞转移能力增强。 展开更多
关键词 RAB5A基因 肿瘤转移 微芯片
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13q14断裂重排与非小细胞肺癌转移潜能关系的研究 被引量:1
5
作者 黄昀 杨焕杰 +2 位作者 金焰 李慧敏 傅松滨 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期531-534,共4页
发生转移的肿瘤细胞经常存在染色体数目异常和结构畸变,在多种有转移潜能的肿瘤细胞中都涉及到13q14的异常。以往研究表明,在同一组织来源但转移潜能不同的肺腺癌细胞系AGZY83a和Anip973中存在13q14的断裂重排。采用mRNA差异展示技术(mR... 发生转移的肿瘤细胞经常存在染色体数目异常和结构畸变,在多种有转移潜能的肿瘤细胞中都涉及到13q14的异常。以往研究表明,在同一组织来源但转移潜能不同的肺腺癌细胞系AGZY83a和Anip973中存在13q14的断裂重排。采用mRNA差异展示技术(mRNADD)分析这一对细胞系得到的差异表达基因BRI基因位于13q14。为了进一步分析肺癌细胞的转移潜能与13q14断裂重排间的关系,采用13q涂染探针对具有不同转移潜能的非小细胞肺癌细胞系PAa、SPC1A和95D中期分裂相进行G显带后的荧光原位杂交分析。结果发现,在3个肺癌细胞系中有多种13号染色体长臂的结构异常,其中此3个细胞系均涉及13q3233的频发断裂。但是低转移肺癌细胞系PAa、SPC1A均未涉及13q14的断裂,而高转移肺癌细胞系95D的两种细胞克隆均可见13q14的断裂。提示13q14断裂点与肺癌细胞的转移能力有一定的相关性,两者之间的遗传学意义需要进一步研究探索。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 染色体重排 转移 染色体涂染 荧光原位杂交
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动脉粥样硬化性脑梗死的亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性研究 被引量:2
6
作者 赵永波 杜丽华 +1 位作者 滕路 张贵寅 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 2000年第4期247-249,共3页
目的 探讨亚甲基四氢叶酸还原酶 (MTHFR)基因C6 77T多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的关系。方法 采用聚合酶链式反应和限制片断长度多态性 (PCR RFLP)技术 ,检测 6 2例动脉粥样硬化性脑梗死患者和 79名健康对照者的C6 77T突变的基因型... 目的 探讨亚甲基四氢叶酸还原酶 (MTHFR)基因C6 77T多态性与动脉粥样硬化性脑梗死的关系。方法 采用聚合酶链式反应和限制片断长度多态性 (PCR RFLP)技术 ,检测 6 2例动脉粥样硬化性脑梗死患者和 79名健康对照者的C6 77T突变的基因型。结果 MTHFR基因C6 77T突变型等位基因 (V)频率在患者组和对照组间比较 ,差异有显著性意义 (χ2 =4.41,P <0 .0 5 ) ;3种基因型频率在两组人群中差异均无显著性意义。基因型频率的相对危险分析 ,AV基因型比AA基因型患脑梗死的危险高 1.76倍 ;VV基因型比AA基因型患脑梗死的危险高 3.2 5倍。结论 MTHFR基因C6 77T突变型等位基因与动脉粥样硬化性脑梗死有一定的关联 。 展开更多
关键词 脑梗塞 脑动脉硬化 四氢叶酸脱氢酶 基因
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SDT作用大鼠C6胶质瘤细胞AIF凋亡途径的研究 被引量:3
7
作者 徐勇刚 王智 +3 位作者 张健 王杰 傅松滨 岳武 《畜牧兽医科技信息》 2013年第10期25-27,共3页
为探讨SDT作用大鼠C6胶质瘤细胞产生凋亡是否存在凋亡诱导因子(AIF)的凋亡途径,其凋亡途径为何。本研究培养大鼠C6胶质瘤细胞,采用MTT法测五组细胞(对照组、HMME、超声、SDT、SDT+Z—VAD.fmk)处理后各时段(6、12、24、48、72h... 为探讨SDT作用大鼠C6胶质瘤细胞产生凋亡是否存在凋亡诱导因子(AIF)的凋亡途径,其凋亡途径为何。本研究培养大鼠C6胶质瘤细胞,采用MTT法测五组细胞(对照组、HMME、超声、SDT、SDT+Z—VAD.fmk)处理后各时段(6、12、24、48、72h)的抑瘤率;透射电镜观察五组细胞处理后6h的亚细胞结构变化;Westernblot分析五组细胞处理后1、6、12、24h,各时段的AIF变化;免疫荧光细胞化学分析五组细胞处理后6h,AIF的位置变化;DNA电泳分析五组细胞处置后6h的细胞凋亡情况。实验结果表明SDT致大鼠C6胶质瘤细胞凋亡过程中,AIF参与其中。其凋亡途径为,SDT致使线粒体膜通透性增加,位于线粒体膜间隙的AIF从线粒体转位至细胞质中,然后AIF又转位至细胞核周围和细胞核中,致使DNA呈大片段(~50Kbp)断裂,引起大鼠C6胶质瘤细胞凋亡。 展开更多
关键词 C6胶质瘤细胞 声动力 凋亡 凋亡诱导因子
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肿瘤抗血管生成治疗耐药机制 被引量:1
8
作者 闫旭 郭影 +2 位作者 孙冬琳 吴楠 金焰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期911-919,共9页
血管生成指的是通过内皮细胞的迁移、增殖和分化,从现有血管网络中形成新的血管网络的过程。这一过程对于实体肿瘤的生长和扩散至关重要,尤其是在肿瘤体积超过2 mm^(3)之后,新生的血管网络为肿瘤提供了至关重要的氧气、营养及生长因子... 血管生成指的是通过内皮细胞的迁移、增殖和分化,从现有血管网络中形成新的血管网络的过程。这一过程对于实体肿瘤的生长和扩散至关重要,尤其是在肿瘤体积超过2 mm^(3)之后,新生的血管网络为肿瘤提供了至关重要的氧气、营养及生长因子。抗血管生成已经成为临床常用靶向治疗肿瘤的方案之一。首个抗血管生成药物贝伐单抗已广泛应用于多种实体肿瘤治疗,但由于获得性耐药现象,疗效仅能维持1~2年。即使血管内皮细胞的基因组相对稳定,不易产生耐药性,但临床实践中仍观察到多种类型的耐药现象,这表明抗血管生成治疗的耐药问题仍然是一个具有挑战性的研究领域。本文主要综述了肿瘤抗血管生成治疗耐药机制的最新进展,并探讨了抗肿瘤血管生成治疗的新前景,以期为临床实践提供有力的理论支持和指导。 展开更多
关键词 肿瘤耐药 抗血管生成 血管共选择 血管拟态 血管套叠
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真核生物mRNA应激状态下的帽-非依赖性翻译
9
作者 刘子昂 金焰 吴楠 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期1-9,共9页
在真核生物中,mRNA翻译过程包括起始、延伸和终止。其中,翻译的起始阶段最为重要且复杂,它决定了mRNA能否被有效翻译成蛋白质。根据翻译起始机制的不同,真核生物mRNA翻译可以分为传统的帽-依赖性翻译和替代机制帽-非依赖性翻译。当外部... 在真核生物中,mRNA翻译过程包括起始、延伸和终止。其中,翻译的起始阶段最为重要且复杂,它决定了mRNA能否被有效翻译成蛋白质。根据翻译起始机制的不同,真核生物mRNA翻译可以分为传统的帽-依赖性翻译和替代机制帽-非依赖性翻译。当外部环境的刺激或细胞自身的改变使细胞处于应激状态时,传统的帽-依赖性翻译被抑制或下调,替代机制帽-非依赖性翻译得以启动,以保证翻译的顺利进行。真核生物在应激状态下为了维持蛋白质合成的需求,采用多种翻译起始机制来实现帽-非依赖性翻译。其中较常见的是IRES(internal ribosome entry site)、m6A修饰和CITE(cap-independent translation enhancer)所启动的翻译。这些机制允许核糖体在mRNA的特殊区域内部进行启动,而不依赖于传统的m7G帽结构。通过这些机制,真核生物可以在应激状态下仍然进行蛋白质合成,以满足细胞的需要。本文在总结传统帽-依赖性翻译研究进展基础上,着重介绍IRES、m6A和CITE所启动的帽-非依赖性翻译,为更好地探索细胞应激状态下的翻译机制提供参考,为未来的翻译研究和应用提供更多的思路。 展开更多
关键词 真核生物mRNA 帽-非依赖性翻译 内部核糖体进入位点 N6-甲基腺苷 帽-非依赖性翻译增强子
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MTHFR基因多态性与动脉粥样硬化性脑梗塞的关系 被引量:9
10
作者 滕路 赵永波 +2 位作者 王新春 陈白滨 张贵寅 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1999年第6期13-16,共4页
采用PCR- RFLP技术,检测了62 例动脉粥样硬化性脑梗塞患者和79 名对照者的C677T 突变的基因型。结果发现, MTHFR基因C677T 突变型等位基因(V)频率在实验组和对照组中,有显著性差异(χ2= 4.41... 采用PCR- RFLP技术,检测了62 例动脉粥样硬化性脑梗塞患者和79 名对照者的C677T 突变的基因型。结果发现, MTHFR基因C677T 突变型等位基因(V)频率在实验组和对照组中,有显著性差异(χ2= 4.41,P< 0.05);三种基因型频率在两组人群中均无显著性差异。基因型频率的相对风险分析,AV基因型比AA 基因型患脑梗塞风险高1.76 倍;VV 基因型比AA 基因型患脑梗塞风险高3.25 倍。结果表明, MTHFR 基因C677T 突变型等位基因与动脉粥样硬化性脑梗塞有一定的关联,突变基因型增加了动脉粥样硬化脑梗塞的发病风险。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 脑梗塞 MTHFR基因 多态性
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中国鄂温克、鄂伦春、达斡尔族永生细胞系的建立与保存 被引量:5
11
作者 薛雅丽 王琦 +8 位作者 史忠诚 刘岸 张钰 黄小义 黄承滨 陈白滨 杨焕杰 傅松滨 李璞 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期157-158,共2页
本文采用EBV(Epstein BarrVirus)上清液转化B淋巴细胞 ,并加入环胞霉素A(CyclosporineA)抑制T淋巴细胞 ,成功地对中国东北地区鄂温克族、鄂伦春族及达斡尔族的部分个体建立了永生细胞系 ,其中鄂温克族49株 ,鄂伦春族40株 ,达斡尔族51株 ... 本文采用EBV(Epstein BarrVirus)上清液转化B淋巴细胞 ,并加入环胞霉素A(CyclosporineA)抑制T淋巴细胞 ,成功地对中国东北地区鄂温克族、鄂伦春族及达斡尔族的部分个体建立了永生细胞系 ,其中鄂温克族49株 ,鄂伦春族40株 ,达斡尔族51株 ,总计140株。永久保存我国特有民族的基因组 。 展开更多
关键词 永生细胞系 EBV 少数民族 鄂温克族 鄂伦春族
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载脂蛋白E基因多态性与2型糖尿病脑梗死的关系 被引量:5
12
作者 周君 薛雅丽 +3 位作者 关亚新 杨印东 傅松滨 张巾超 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期35-38,共4页
为研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与中国东北汉族2型糖尿病合并脑梗死的关系,采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性(PCR RFLP)技术,检测了208例个体的ApoE基因多态性,其中对照(CON)组69例,2型糖尿病无大血管病变(T2DM)组67例和2型糖... 为研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与中国东北汉族2型糖尿病合并脑梗死的关系,采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性(PCR RFLP)技术,检测了208例个体的ApoE基因多态性,其中对照(CON)组69例,2型糖尿病无大血管病变(T2DM)组67例和2型糖尿病合并脑梗死(T2DMCI)组72例;同时测定了其中70例T2DMCI患者的血脂含量。CON组等位基因频率为:ε29.6%、ε382.4%、ε48.1%,基因型频率为:ε2ε313.2%、ε3ε367 6%、ε3ε416.2%;T2DM组等位基因频率为:ε210.5%、ε384.3%、ε45.2%,基因型频率为:ε2ε319.4%、ε3ε370.1%、ε3ε49%;T2DMCI组等位基因频率为:ε211.8%、ε384.7%、ε43.5%,基因型频率为:ε2ε315.2%、ε3ε375%、ε3ε44.2%。3组间等位基因和基因型频率的差异经检验无统计学意义。T2DMCI患者中各基因型之间的血浆总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL C)水平亦无显著性差异。在中国东北汉族人群中,未发现ApoE基因多态性与T2DMCI之间存在关联,亦未发现ApoE基因多态性与T2DMCI患者的TC、TG、HDL C和LDL C水平之间存在关联。 展开更多
关键词 载脂蛋白E 基因多态性 2型糖尿病 脑梗死
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不同转移能力的肺腺癌细胞系金属蛋白酶活性分析 被引量:4
13
作者 闫承慧 吴焱 +1 位作者 金焰 傅松滨 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期239-240,共2页
为了探讨肺腺癌细胞系中金属蛋白酶的活性与其转移能力之间的相关性 ,选取9个转移能力不同的肺腺癌细胞系 ,分别对它们所分泌的金属蛋白酶MMP -2、MMP -9进行活性分析。结果发现 ,金属蛋白酶的活性与肺腺癌细胞系的转移能力有一定的相关... 为了探讨肺腺癌细胞系中金属蛋白酶的活性与其转移能力之间的相关性 ,选取9个转移能力不同的肺腺癌细胞系 ,分别对它们所分泌的金属蛋白酶MMP -2、MMP -9进行活性分析。结果发现 ,金属蛋白酶的活性与肺腺癌细胞系的转移能力有一定的相关性 ,其中MMP -9的活性与肺腺癌细胞系的转移相关性更显著。 展开更多
关键词 肺腺癌 金属蛋白酶 转移能力
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基于癌症基因组图谱计划多组学数据构建胶质母细胞瘤六基因预后模型 被引量:4
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作者 雷常贵 贾学渊 孙文靖 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期665-679,I0002-I0011,共25页
胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)是最常见的原发性颅内肿瘤,恶性程度极高,患者预后极差。为了识别GBM预后生物标记物,建立预后模型,本研究通过分析癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中GBM的表达谱数据,筛选出不... 胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)是最常见的原发性颅内肿瘤,恶性程度极高,患者预后极差。为了识别GBM预后生物标记物,建立预后模型,本研究通过分析癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中GBM的表达谱数据,筛选出不同生存期GBM患者差异基因。利用GISTIC软件和Kaplan-Meier(KM)生存分析方法分析TCGA数据库中的GBM拷贝数变异数据,识别影响生存的扩增基因(survival-associated amplified gene,SAG)。取短生存期组上调基因和SAG两者的交集基因,进行单因素Cox回归和迭代Lasso回归筛选重要候选基因并建立预后模型;计算预后评分,根据预后评分中位数将患者分为高风险组和低风险组。用ROC曲线判断模型的优良,KM生存分析高低风险组预后差异,并用GEO、CGGA和Rembrandt数据库3个外部数据集进行验证。多因素Cox回归分析判断预后评分的预后独立性。结果显示,GBM不同生存期差异分析得到上调基因426个,下调基因65个。短生存期组上调基因与SAG交集得到47个基因。经过筛选,最终确定六基因(EN2、PPBP、LRRC61、SEL1L3、CPA4、DDIT4L)预后模型。TCGA实验组和3个外部验证组模型的ROC曲线下面积均大于0.6,甚至达到0.912。KM分析显示高低风险组的预后都存在差异(P<0.05)。在多因素Cox回归分析中,六基因预后评分是GBM患者预后的独立影响因素(P<0.05)。通过一系列分析,本研究确立了六基因(EN2、PPBP、LRRC61、SEL1L3、CPA4、DDIT4L)的GBM预后模型,模型具有很好的预测能力,可作为预测GBM患者的独立预后标志物。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 多组学数据 六基因组合 预后模型 癌症基因组图谱计划
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人类逆转录病毒的长末段重复序列(HRTVLTR)的表达与肺癌转移的关系
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作者 连祺周 庄建良 +1 位作者 路刚 夏建川 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期1123-1128,共6页
肺癌是最常见的恶性肿瘤之一 .肺腺癌很容易发生转移 .实验以 17例肺癌 (5例肺腺癌、1例腺鳞癌、7例肺鳞癌及 4例小细胞末分化癌 )的原发灶、癌旁正常组织及转移淋巴结为材料 ,采用PCR及非放射性标记的 RNA斑点杂交分析 L TR在基因组的... 肺癌是最常见的恶性肿瘤之一 .肺腺癌很容易发生转移 .实验以 17例肺癌 (5例肺腺癌、1例腺鳞癌、7例肺鳞癌及 4例小细胞末分化癌 )的原发灶、癌旁正常组织及转移淋巴结为材料 ,采用PCR及非放射性标记的 RNA斑点杂交分析 L TR在基因组的存在及其表达情况 .研究结果发现 :LTR序列在 17例肺癌病人的正常组织及肿瘤组织的基因组中普遍存在 ,L TR致肺癌转移与其插入基因组中无关 ;L TR致肺癌转移与其表达增高有关 ,而且其高表达与小细胞肺癌的转移无关 ,而与非小细胞肺癌的转移密切相关 .提示 L TR参与了非小细胞肺癌的转移过程 . 展开更多
关键词 逆转录病毒 长末段重复序列 基因表达 肺癌转移 肺腺癌 MRNA差异显示技术
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