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基于蒙特卡洛模拟方法医生综合治疗质量的分级研究
被引量：
1
1
作者
王佳莹
蒋皓
+4 位作者
李习
张美奇
王心雨
苏少飞
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2017年第5期718-720,725,共4页
目的利用综合质量得分和蒙特卡洛模拟方法进行医生治疗质量分级研究,获得治疗质量分级最优的医生,为科学评价医生治疗水平、医院管理绩效考核及提高医生的治疗质量提供依据。方法利用多水平潜变量模型计算医生综合治疗质量得分,基于蒙...
目的利用综合质量得分和蒙特卡洛模拟方法进行医生治疗质量分级研究,获得治疗质量分级最优的医生,为科学评价医生治疗水平、医院管理绩效考核及提高医生的治疗质量提供依据。方法利用多水平潜变量模型计算医生综合治疗质量得分,基于蒙特卡洛模拟方法产生复制数据集,设定划分医生最优治疗质量组和非最优治疗质量组的阈值γ,计算临界点为(2γ-1)×100%置信区间下限的第九十百分位数。结果模拟产生1000个复制数据集,设定的阈值为0.9;计算得到临界点为80%置信区间下限的第九十百分位数,1000次分析后获得临界点为6.41104;35位乳腺癌手术医生分为两组即最优治疗质量组和非最优治疗质量组,3位医生构成最优治疗质量组。结论利用临床治疗过程的评价指标获得综合治疗质量得分可全面反映治疗质量,基于蒙特卡洛模拟的医生综合治疗质量分级科学合理;医生分级既满足患者选择医生的需求,又为医院管理绩效考核及提高治疗质量提供依据。
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关键词
乳腺癌
治疗质量
蒙特卡洛模拟方法
医生分级
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职称材料
基于WGCNA识别IgG介导的西红柿不耐受枢纽蛋白
被引量：
1
2
作者
张薇
孙琳
+1 位作者
王玉鹏
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2021年第3期322-326,共5页
目的基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别IgG介导的西红柿不耐受相关蛋白质共表达模块及枢纽蛋白,为其发生机制研究提供依据。方法收集IgG介导的西红柿不耐受患者及健康对照血清样...
目的基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别IgG介导的西红柿不耐受相关蛋白质共表达模块及枢纽蛋白,为其发生机制研究提供依据。方法收集IgG介导的西红柿不耐受患者及健康对照血清样本,使用DIA全扫描蛋白质组学定性定量技术获得蛋白质表达数据;利用WGCNA方法构建共表达网络,识别与IgG介导的西红柿不耐受相关的模块,并进行模块GO功能注释及KEGG通路富集分析;利用Cytoscape获得IgG介导的西红柿不耐受相关模块的枢纽蛋白。结果获得IgG介导的西红柿不耐受相关的蛋白质模块两个,分别为blue模块和turquoise模块。blue模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为-0.90;GO富集分析发现,该模块中蛋白主要参与脂蛋白重构、脂质代谢等相关生物过程以及蛋白质级联激活、补体激活等免疫调节过程;KEGG分析富集到5条通路,包括胆固醇代谢通路、PPAR信号通路、补体和凝血级联通路、类维生素A代谢和运输通路、维生素和辅酶因子代谢通路。turquoise模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为0.72;GO富集分析发现,该模块主要与蛋白质级联激活、补体激活经典途径、体液免疫应答、受体介导的内吞,血小板脱颗粒、抗氧化活性等生物过程有关;KEGG分析富集到2条通路,补体和凝血级联通路、吞噬体通路。筛选出IgG介导的西红柿不耐受相关模块中的枢纽蛋白为APOA1、APOA4、APOC3、APOA2、APOC1、C3、HRG、FGB、HP、TF。结论WGCNA方法进行IgG介导的西红柿不耐受蛋白质表达数据分析发现:脂质、胆固醇代谢等过程的改变可能是其发生的重要环节;获得的载脂蛋白类蛋白质及其他枢纽蛋白是其潜在关键调控蛋白;本研究从系统生物学的角度,为IgG介导的西红柿不耐受发生机制探索提供了依据和研究方向。
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关键词
加权基因共表达网络分析
共表达网络分析
IgG介导西红柿不耐受
枢纽蛋白
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职称材料
基于PLS-DA的IgG介导的鸡肉不耐受差异蛋白筛选及通路识别
3
作者
赵思渊
孙琳
+1 位作者
田伟
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2023年第5期651-653,659,共4页
目的筛选鸡肉不耐受患者与健康人之间的差异蛋白,富集分析识别差异蛋白的相关通路,为探讨鸡肉不耐受发生机制提供依据。方法收集鸡肉不耐受患者及健康对照的血清样本,利用DIA技术平台对样本进行蛋白组学检测;PLS-DA结合PPI分析筛选具有...
目的筛选鸡肉不耐受患者与健康人之间的差异蛋白,富集分析识别差异蛋白的相关通路,为探讨鸡肉不耐受发生机制提供依据。方法收集鸡肉不耐受患者及健康对照的血清样本,利用DIA技术平台对样本进行蛋白组学检测;PLS-DA结合PPI分析筛选具有相互作用的蛋白质,Cytoscape获得鸡肉不耐受患者与对照组间的差异蛋白;GO和KEGG富集分析获得差异蛋白的生物学通路与代谢通路。结果血清样本的蛋白表达数据检测结果,共获得2210种蛋白质。PLS-DA分析筛选出和鸡肉不耐受相关的蛋白质786个,结合蛋白互作分析获得PPI网络,聚类后得到两个主要的模块:cluster1和cluster2;cluster1包括18个蛋白质,cluster 2包括12个蛋白质。两模块蛋白质进行重要性排序,筛选出鸡肉不耐受患者与健康对照间的差异蛋白为:ORM1、FGB、SERPINF2、HRG、A2M、ORM2和QSOX1。前五个为上调蛋白质,后两个为下调蛋白质。cluster1评分为10.12,GO富集分析发现差异蛋白主要参与血小板脱颗粒、肽链内切酶活性的负调节、炎症反应等生物学通路,KEGG分析富集到补体和凝血级联通路;cluster 2评分6.00,共包括12个蛋白质,GO富集分析发现差异蛋白与急性期反应、血小板脱颗粒、固有免疫应答等生物学通路有关,KEGG分析富集到补体和凝血级联通路、阮病毒病和系统性红斑狼疮的疾病通路。结论本研究筛选出7个与IgG介导的鸡肉不耐受相关的差异蛋白,其参与的生物学和代谢通路与机体免疫、炎症过程有关,在免疫、炎症发生发展中可能起重要作用,将为探讨鸡肉不耐受发生机制提供依据。
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关键词
鸡肉不耐受
差异蛋白
蛋白组学
PLS-DA
蛋白质互作
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职称材料
题名
基于蒙特卡洛模拟方法医生综合治疗质量的分级研究
被引量：
1
1
作者
王佳莹
蒋皓
李习
张美奇
王心雨
苏少飞
刘美娜
机构
哈尔滨医科大学流行病与卫生统计学系
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2017年第5期718-720,725,共4页
基金
国家自然基金(81573255)
文摘
目的利用综合质量得分和蒙特卡洛模拟方法进行医生治疗质量分级研究,获得治疗质量分级最优的医生,为科学评价医生治疗水平、医院管理绩效考核及提高医生的治疗质量提供依据。方法利用多水平潜变量模型计算医生综合治疗质量得分,基于蒙特卡洛模拟方法产生复制数据集,设定划分医生最优治疗质量组和非最优治疗质量组的阈值γ,计算临界点为(2γ-1)×100%置信区间下限的第九十百分位数。结果模拟产生1000个复制数据集,设定的阈值为0.9;计算得到临界点为80%置信区间下限的第九十百分位数,1000次分析后获得临界点为6.41104;35位乳腺癌手术医生分为两组即最优治疗质量组和非最优治疗质量组,3位医生构成最优治疗质量组。结论利用临床治疗过程的评价指标获得综合治疗质量得分可全面反映治疗质量,基于蒙特卡洛模拟的医生综合治疗质量分级科学合理;医生分级既满足患者选择医生的需求,又为医院管理绩效考核及提高治疗质量提供依据。
关键词
乳腺癌
治疗质量
蒙特卡洛模拟方法
医生分级
Keywords
Breast cancer
Quality of care
Monte Carlo method
Grading of doctors
分类号
R197.3 [医药卫生—卫生事业管理]
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职称材料
题名
基于WGCNA识别IgG介导的西红柿不耐受枢纽蛋白
被引量：
1
2
作者
张薇
孙琳
王玉鹏
刘美娜
机构
哈尔滨医科大学流行病与卫生统计学系
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2021年第3期322-326,共5页
基金
国家重大专项课题(2016ZX08011005)
国家自然科学基金青年科学基金项目(82003556)
国家自然基金面上基金(82073666)。
文摘
目的基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法识别IgG介导的西红柿不耐受相关蛋白质共表达模块及枢纽蛋白,为其发生机制研究提供依据。方法收集IgG介导的西红柿不耐受患者及健康对照血清样本,使用DIA全扫描蛋白质组学定性定量技术获得蛋白质表达数据;利用WGCNA方法构建共表达网络,识别与IgG介导的西红柿不耐受相关的模块,并进行模块GO功能注释及KEGG通路富集分析;利用Cytoscape获得IgG介导的西红柿不耐受相关模块的枢纽蛋白。结果获得IgG介导的西红柿不耐受相关的蛋白质模块两个,分别为blue模块和turquoise模块。blue模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为-0.90;GO富集分析发现,该模块中蛋白主要参与脂蛋白重构、脂质代谢等相关生物过程以及蛋白质级联激活、补体激活等免疫调节过程;KEGG分析富集到5条通路,包括胆固醇代谢通路、PPAR信号通路、补体和凝血级联通路、类维生素A代谢和运输通路、维生素和辅酶因子代谢通路。turquoise模块与IgG介导的西红柿不耐受相关系数为0.72;GO富集分析发现,该模块主要与蛋白质级联激活、补体激活经典途径、体液免疫应答、受体介导的内吞,血小板脱颗粒、抗氧化活性等生物过程有关;KEGG分析富集到2条通路,补体和凝血级联通路、吞噬体通路。筛选出IgG介导的西红柿不耐受相关模块中的枢纽蛋白为APOA1、APOA4、APOC3、APOA2、APOC1、C3、HRG、FGB、HP、TF。结论WGCNA方法进行IgG介导的西红柿不耐受蛋白质表达数据分析发现:脂质、胆固醇代谢等过程的改变可能是其发生的重要环节;获得的载脂蛋白类蛋白质及其他枢纽蛋白是其潜在关键调控蛋白;本研究从系统生物学的角度,为IgG介导的西红柿不耐受发生机制探索提供了依据和研究方向。
关键词
加权基因共表达网络分析
共表达网络分析
IgG介导西红柿不耐受
枢纽蛋白
Keywords
WGCNA
Co-expression network analysis
IgG mediated tomato intolerance
Hub protein
分类号
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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职称材料
题名
基于PLS-DA的IgG介导的鸡肉不耐受差异蛋白筛选及通路识别
3
作者
赵思渊
孙琳
田伟
刘美娜
机构
哈尔滨医科大学流行病与卫生统计学系
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2023年第5期651-653,659,共4页
基金
国家重大专项课题(2016ZX08011005)。
文摘
目的筛选鸡肉不耐受患者与健康人之间的差异蛋白,富集分析识别差异蛋白的相关通路,为探讨鸡肉不耐受发生机制提供依据。方法收集鸡肉不耐受患者及健康对照的血清样本,利用DIA技术平台对样本进行蛋白组学检测;PLS-DA结合PPI分析筛选具有相互作用的蛋白质,Cytoscape获得鸡肉不耐受患者与对照组间的差异蛋白;GO和KEGG富集分析获得差异蛋白的生物学通路与代谢通路。结果血清样本的蛋白表达数据检测结果,共获得2210种蛋白质。PLS-DA分析筛选出和鸡肉不耐受相关的蛋白质786个,结合蛋白互作分析获得PPI网络,聚类后得到两个主要的模块:cluster1和cluster2;cluster1包括18个蛋白质,cluster 2包括12个蛋白质。两模块蛋白质进行重要性排序,筛选出鸡肉不耐受患者与健康对照间的差异蛋白为:ORM1、FGB、SERPINF2、HRG、A2M、ORM2和QSOX1。前五个为上调蛋白质,后两个为下调蛋白质。cluster1评分为10.12,GO富集分析发现差异蛋白主要参与血小板脱颗粒、肽链内切酶活性的负调节、炎症反应等生物学通路,KEGG分析富集到补体和凝血级联通路;cluster 2评分6.00,共包括12个蛋白质,GO富集分析发现差异蛋白与急性期反应、血小板脱颗粒、固有免疫应答等生物学通路有关,KEGG分析富集到补体和凝血级联通路、阮病毒病和系统性红斑狼疮的疾病通路。结论本研究筛选出7个与IgG介导的鸡肉不耐受相关的差异蛋白,其参与的生物学和代谢通路与机体免疫、炎症过程有关,在免疫、炎症发生发展中可能起重要作用,将为探讨鸡肉不耐受发生机制提供依据。
关键词
鸡肉不耐受
差异蛋白
蛋白组学
PLS-DA
蛋白质互作
Keywords
Chicken intolerance
Differential protein
Proteomics
PLS-DA
Protein interaction analysis
分类号
R195.1 [医药卫生—卫生统计学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于蒙特卡洛模拟方法医生综合治疗质量的分级研究
王佳莹
蒋皓
李习
张美奇
王心雨
苏少飞
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2017
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于WGCNA识别IgG介导的西红柿不耐受枢纽蛋白
张薇
孙琳
王玉鹏
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2021
1
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职称材料
3
基于PLS-DA的IgG介导的鸡肉不耐受差异蛋白筛选及通路识别
赵思渊
孙琳
田伟
刘美娜
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2023
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