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基于生物信息学识别肝细胞癌中的PANoptosis相关lncRNAs并构建预后模型
1
作者
何锐
郑秀娟
+4 位作者
王宁宁
李旭颖
李明其
辇士晶
王克维
《遗传》
北大核心
2025年第4期456-475,共20页
PANoptosis是一种新的促炎程序性细胞死亡的方式,参与多种癌症的发生发展过程,但其在肝癌发生发展过程中的机制尚未被阐明。近年来的研究表明,长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)在多种癌症的发生发展中起到了关键作用。本...
PANoptosis是一种新的促炎程序性细胞死亡的方式,参与多种癌症的发生发展过程,但其在肝癌发生发展过程中的机制尚未被阐明。近年来的研究表明,长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)在多种癌症的发生发展中起到了关键作用。本研究分别从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据中检索了肝癌数据集。结合肝癌数据集和前人的研究基础,通过相关性分析得到了PANoptosis相关lnc RNAs。一致性聚类分析发现,肝细胞癌患者可以分为两种不同的亚型,即Cluster 1亚型和Cluster 2亚型。与Cluster 2亚型相比,Cluster 1亚型具有更好的预后和更高水平的免疫浸润。然后,对PANoptosis相关lnc RNAs进行了Lasso-Cox降维分析,构建了风险评估模型用于预测肝细胞癌患者预后。Kaplan-Meier分析显示,低风险组患者生存率较高,受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)和校准曲线证实了模型具有良好的预测能力。这些发现有助于人们更加深入地理解PANoptosis相关lnc RNAs在肝细胞癌发生发展中起到的关键作用,为后续的肝细胞癌治疗提供潜在的生物标志物和治疗靶点。
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关键词
泛凋亡
细胞凋亡
细胞焦亡
坏死性凋亡
长链非编码RNA
肝细胞癌
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职称材料
题名
基于生物信息学识别肝细胞癌中的PANoptosis相关lncRNAs并构建预后模型
1
作者
何锐
郑秀娟
王宁宁
李旭颖
李明其
辇士晶
王克维
机构
哈尔滨医科大学中国疾病预防控制中心地方病预防控制中心
出处
《遗传》
北大核心
2025年第4期456-475,共20页
基金
国家自然科学基金项目(编号:81773367)
哈尔滨医科大学研究生科研与实践创新基金(编号:YJSCX2023-123HYD)资助。
文摘
PANoptosis是一种新的促炎程序性细胞死亡的方式,参与多种癌症的发生发展过程,但其在肝癌发生发展过程中的机制尚未被阐明。近年来的研究表明,长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)在多种癌症的发生发展中起到了关键作用。本研究分别从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据中检索了肝癌数据集。结合肝癌数据集和前人的研究基础,通过相关性分析得到了PANoptosis相关lnc RNAs。一致性聚类分析发现,肝细胞癌患者可以分为两种不同的亚型,即Cluster 1亚型和Cluster 2亚型。与Cluster 2亚型相比,Cluster 1亚型具有更好的预后和更高水平的免疫浸润。然后,对PANoptosis相关lnc RNAs进行了Lasso-Cox降维分析,构建了风险评估模型用于预测肝细胞癌患者预后。Kaplan-Meier分析显示,低风险组患者生存率较高,受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)和校准曲线证实了模型具有良好的预测能力。这些发现有助于人们更加深入地理解PANoptosis相关lnc RNAs在肝细胞癌发生发展中起到的关键作用,为后续的肝细胞癌治疗提供潜在的生物标志物和治疗靶点。
关键词
泛凋亡
细胞凋亡
细胞焦亡
坏死性凋亡
长链非编码RNA
肝细胞癌
Keywords
PANoptosis
apoptosis
pyroptosis
necroptosis
lncRNA
hepatocellular carcinoma
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
基于生物信息学识别肝细胞癌中的PANoptosis相关lncRNAs并构建预后模型
何锐
郑秀娟
王宁宁
李旭颖
李明其
辇士晶
王克维
《遗传》
北大核心
2025
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