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基于生物信息学识别肝细胞癌中的PANoptosis相关lncRNAs并构建预后模型
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作者 何锐 郑秀娟 +4 位作者 王宁宁 李旭颖 李明其 辇士晶 王克维 《遗传》 北大核心 2025年第4期456-475,共20页
PANoptosis是一种新的促炎程序性细胞死亡的方式,参与多种癌症的发生发展过程,但其在肝癌发生发展过程中的机制尚未被阐明。近年来的研究表明,长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)在多种癌症的发生发展中起到了关键作用。本... PANoptosis是一种新的促炎程序性细胞死亡的方式,参与多种癌症的发生发展过程,但其在肝癌发生发展过程中的机制尚未被阐明。近年来的研究表明,长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lnc RNAs)在多种癌症的发生发展中起到了关键作用。本研究分别从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据中检索了肝癌数据集。结合肝癌数据集和前人的研究基础,通过相关性分析得到了PANoptosis相关lnc RNAs。一致性聚类分析发现,肝细胞癌患者可以分为两种不同的亚型,即Cluster 1亚型和Cluster 2亚型。与Cluster 2亚型相比,Cluster 1亚型具有更好的预后和更高水平的免疫浸润。然后,对PANoptosis相关lnc RNAs进行了Lasso-Cox降维分析,构建了风险评估模型用于预测肝细胞癌患者预后。Kaplan-Meier分析显示,低风险组患者生存率较高,受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)和校准曲线证实了模型具有良好的预测能力。这些发现有助于人们更加深入地理解PANoptosis相关lnc RNAs在肝细胞癌发生发展中起到的关键作用,为后续的肝细胞癌治疗提供潜在的生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 泛凋亡 细胞凋亡 细胞焦亡 坏死性凋亡 长链非编码RNA 肝细胞癌
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