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高粱TGA基因响应孢堆黑粉菌(Sporisorium reilianum)侵染表达和DNA变异分析
1
作者
刘卓君
柴文婷
+9 位作者
任毅乐
王新宇
朱立勋
赵珊珊
杨博慧
范佳利
李新凤
赵威军
吕晋慧
张春来
《生物技术通报》
北大核心
2025年第5期90-103,共14页
【目的】TGA基因亚家族是bZIP转录因子家族中十分重要的成员。鉴定高粱基因组TGA基因家族成员,进行基因表达和自然等位变异分析,筛选出响应孢堆黑粉菌侵染的TGA基因和顺式作用元件。【方法】在高粱全基因组鉴定SbTGAs基因家族成员,并进...
【目的】TGA基因亚家族是bZIP转录因子家族中十分重要的成员。鉴定高粱基因组TGA基因家族成员,进行基因表达和自然等位变异分析,筛选出响应孢堆黑粉菌侵染的TGA基因和顺式作用元件。【方法】在高粱全基因组鉴定SbTGAs基因家族成员,并进行染色体定位、基因结构、蛋白理化性质、进化关系、顺式作用元件和共线性分析,分析在丝黑穗病菌侵染下SbTGAs的转录表达特性,检测在高粱种质自然群体的DNA变异。【结果】高粱基因组中共有17个SbTGAs家族成员,均含有DOG1结构域,多数有bZIP结构域,定位于细胞核,大部分的SbTGA基因内含子数量为3‒12,聚类分析表明,高粱TGA基因家族基因可分为5个亚族。玉米与高粱15个TGA基因存在共线性,亲缘关系更近。基因表达分析表明,SbTGA2.1b在高粱的根和叶中显著表达,丝黑穗病菌侵染后,SbTGA2.1b的表达在抗、感丝黑穗病品系显著诱导;SbTGA2.2、SbTGA5和SbTGA6.6g的表达在感病株受抑制;在高粱种质检测到SbTGA2.1a和SbTGA6.6g等5个基因多个非同义SNP变异和插入缺失(INDEL)变异。【结论】SbTGA2.1b等响应孢堆黑粉菌侵染,存在非同义SNP变异和INDEL变异高粱种质,为高粱抗丝黑穗病的分子育种提供依据。
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关键词
高粱
TGA
孢堆黑粉菌
基因表达
DNA变异
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题名
高粱TGA基因响应孢堆黑粉菌(Sporisorium reilianum)侵染表达和DNA变异分析
1
作者
刘卓君
柴文婷
任毅乐
王新宇
朱立勋
赵珊珊
杨博慧
范佳利
李新凤
赵威军
吕晋慧
张春来
机构
山西
农业大学农学院
山西省
/教育部共建作物高产优质协同创新中心
山西
农业大学高粱研究所
山西
农业大学林学院
后稷山西省实验室
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第5期90-103,共14页
基金
国家自然科学基金项目(31971994,31470285)
山西省教育厅研究生实践创新(2023SJ109)
+1 种基金
山西农科院博士基金项目(ybsjj1404)
山西省教育厅重点专业建设项目(J20220211)。
文摘
【目的】TGA基因亚家族是bZIP转录因子家族中十分重要的成员。鉴定高粱基因组TGA基因家族成员,进行基因表达和自然等位变异分析,筛选出响应孢堆黑粉菌侵染的TGA基因和顺式作用元件。【方法】在高粱全基因组鉴定SbTGAs基因家族成员,并进行染色体定位、基因结构、蛋白理化性质、进化关系、顺式作用元件和共线性分析,分析在丝黑穗病菌侵染下SbTGAs的转录表达特性,检测在高粱种质自然群体的DNA变异。【结果】高粱基因组中共有17个SbTGAs家族成员,均含有DOG1结构域,多数有bZIP结构域,定位于细胞核,大部分的SbTGA基因内含子数量为3‒12,聚类分析表明,高粱TGA基因家族基因可分为5个亚族。玉米与高粱15个TGA基因存在共线性,亲缘关系更近。基因表达分析表明,SbTGA2.1b在高粱的根和叶中显著表达,丝黑穗病菌侵染后,SbTGA2.1b的表达在抗、感丝黑穗病品系显著诱导;SbTGA2.2、SbTGA5和SbTGA6.6g的表达在感病株受抑制;在高粱种质检测到SbTGA2.1a和SbTGA6.6g等5个基因多个非同义SNP变异和插入缺失(INDEL)变异。【结论】SbTGA2.1b等响应孢堆黑粉菌侵染,存在非同义SNP变异和INDEL变异高粱种质,为高粱抗丝黑穗病的分子育种提供依据。
关键词
高粱
TGA
孢堆黑粉菌
基因表达
DNA变异
Keywords
sorghum
TGA
head smut fungus Sporisorium reilianum
gene expression
DNA variation
分类号
S435.15 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高粱TGA基因响应孢堆黑粉菌(Sporisorium reilianum)侵染表达和DNA变异分析
刘卓君
柴文婷
任毅乐
王新宇
朱立勋
赵珊珊
杨博慧
范佳利
李新凤
赵威军
吕晋慧
张春来
《生物技术通报》
北大核心
2025
0
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