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中国在翻译后修饰的生物信息学研究领域的进展与前瞻 被引量:6
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作者 刘泽先 蔡煜东 +11 位作者 郭雪江 李骜 李婷婷 邱建丁 任间 施绍萍 宋江宁 王明会 谢鹭 薛宇 张子丁 赵兴明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期621-634,共14页
翻译后修饰在调控蛋白质构象变化、活性以及功能方面具有重要作用,并参与了几乎所有细胞通路和过程。蛋白质翻译后修饰的鉴定是阐明细胞内分子机理的基础。相对于劳动密集的、耗费时间的实验工作,利用各种生物信息学方法开展翻译后修饰... 翻译后修饰在调控蛋白质构象变化、活性以及功能方面具有重要作用,并参与了几乎所有细胞通路和过程。蛋白质翻译后修饰的鉴定是阐明细胞内分子机理的基础。相对于劳动密集的、耗费时间的实验工作,利用各种生物信息学方法开展翻译后修饰预测,能够提供准确、简便和快速的研究方案,并产生有价值的信息为进一步实验研究提供参考。文章主要综述了中国生物信息学者在翻译后修饰生物信息学领域所取得的研究进展,包括修饰底物与位点预测的计算方法学设计与完善、在线或本地化工具的设计与维护、修饰相关数据库及数据资源的构建及基于修饰蛋白质组学数据的生物信息学分析。通过比较国内外的同类研究,发现优势和不足,并对未来的研究作出前瞻。 展开更多
关键词 翻译后修饰 共价修饰 修饰组学 磷酸化
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一种基于聚集超级节点的P2P网络信任模型 被引量:39
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作者 田春岐 江建慧 +1 位作者 胡治国 李峰 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第2期345-355,共11页
针对对等网(Peer-to-Peer,P2P)中节点之间由于兴趣爱好差异大、相互发生重复交易的可能性较小从而难以有效建立信任关系的现状,文中提出一种新的基于超级节点的P2P网络信任模型.该模型中节点以兴趣相似而聚簇,节点之间信任关系被划分为... 针对对等网(Peer-to-Peer,P2P)中节点之间由于兴趣爱好差异大、相互发生重复交易的可能性较小从而难以有效建立信任关系的现状,文中提出一种新的基于超级节点的P2P网络信任模型.该模型中节点以兴趣相似而聚簇,节点之间信任关系被划分为3种类型并被给予了各自的解决方案.同时,对于推荐信任信息中存在的虚假的、误导性的和不公正反馈的问题,文中还提出基于节点相似性的反馈信息过滤算法予以有效解决.最后的仿真实验结果表明,该信任模型不但具有抗恶意节点攻击的强壮性,同时在资源查询时具有较低的查询开销和失败率. 展开更多
关键词 对等网 信任 信誉 超级节点 局部信任度
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一种加入时间维的船舶轨迹高效离线压缩算法研究 被引量:14
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作者 徐凯 邱家瑜 李燕 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2017年第B11期498-502,共5页
全球船舶轨迹大数据加工的一个重要步骤是对船舶轨迹进行压缩。以经典船舶轨迹离线压缩算法思路为基础,探讨了传统算法在压缩效果和压缩效率方面存在的问题。例如,经典Douglas-Peucker压缩算法没有考虑时间维,导致压缩后的数据对船舶的... 全球船舶轨迹大数据加工的一个重要步骤是对船舶轨迹进行压缩。以经典船舶轨迹离线压缩算法思路为基础,探讨了传统算法在压缩效果和压缩效率方面存在的问题。例如,经典Douglas-Peucker压缩算法没有考虑时间维,导致压缩后的数据对船舶的速度与航行状态信息的保留效果不佳。但是,动态Douglas-Peucker算法虽然考虑了时间维,却因此增加了计算量,导致压缩效率不高。在上述算法的基础上,将考虑时间维的轨迹压缩算法对应到向量空间中,利用向量的内积、外积的几何性质,对算法压缩效率和效果进行了改善,并提出了快速Douglas-Peucker算法。经过实验验证,该算法较经典算法效率提高了约30%以上,压缩效果比已有算法更优。 展开更多
关键词 船舶轨迹 船舶自动识别系统 轨迹压缩 时空序列 道格拉斯-普克算法
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基于多核处理器的K线程低能耗的任务调度优化算法 被引量:2
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作者 王科特 王力生 廖新考 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2015年第2期18-23,共6页
针对具有独立DVFS的多核处理器系统,提出了一种K线程低能耗模型的并行任务调度优化算法(Tasks Optimization based on Energy-Effectiveness Model,TO-EEM)。与传统的并行任务节能调度相比,该算法的主要目标是不仅通过降低处理器频率来... 针对具有独立DVFS的多核处理器系统,提出了一种K线程低能耗模型的并行任务调度优化算法(Tasks Optimization based on Energy-Effectiveness Model,TO-EEM)。与传统的并行任务节能调度相比,该算法的主要目标是不仅通过降低处理器频率来减少处理器瞬时功耗,而且结合并行任务间的同步互斥所造成的线程阻塞情况,合理分配线程资源来减少线程同步时间,优化并行性能;保证任务在一定的并行加速比性能前提下,提高资源利用率,减少能耗,达到程序能耗和性能之间的折衷。文中进行了大量模拟实验,结果证明提出的任务优化模型算法节能效果明显,能有效降低处理器的功耗,并始终保持线性加速比。 展开更多
关键词 多核 能耗优化模型 多线程 多任务并行 资源利用率 同步
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构建自组网络中基于兴趣群组的激励机制 被引量:2
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作者 田春岐 黄震华 邹仕洪 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2466-2469,共4页
提出一种基于兴趣群组的有效抗攻击性自组网络信任激励模型IGTrust,通过采用经济学中收益与损失概念,屏蔽了不同评价主体对同一行为评价的差异性.IGTrust将信任关系划分为三种类型,以节点获得的相对收益作为信任评估依据,结合交易信息... 提出一种基于兴趣群组的有效抗攻击性自组网络信任激励模型IGTrust,通过采用经济学中收益与损失概念,屏蔽了不同评价主体对同一行为评价的差异性.IGTrust将信任关系划分为三种类型,以节点获得的相对收益作为信任评估依据,结合交易信息量、折扣因子、时间维度等参数给予了各自的解决方案.仿真实验结果表明,IGTrust在抗恶意节点攻击与资源查询性能等方面均有良好性能. 展开更多
关键词 对等网 信任 兴趣群组 信誉
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一种基于蓝牙的数据同步的方法 被引量:3
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作者 王力生 霍雷 《计算机应用与软件》 CSCD 北大核心 2005年第2期65-66,共2页
介绍国际流行的数据同步的通用标准———SyncML和在无线个人局域网中实现基于蓝牙的数据同步方法 :将SyncML与对象交换协议 (OBEX)绑定 ,并介绍了绑定中所涉及的关键技术。
关键词 无线个人局域网 蓝牙技术 无线通信 数据同步 同步标记语言
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基于直方图对的无损数据隐藏在指纹图像中的应用
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作者 刘凤梅 童学锋 宣国荣 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2008年第20期5155-5158,共4页
指纹识别技术是最早的通过计算机实现的身份识别手段,在今天也是应用最为广泛的生物特征识别技术,但是该识别技术仅针对指纹图像本身。研究了在确保指纹图像不变的情况下隐藏信息,从而来提高识别的正确率。主要讲述了指纹图像(JPEG)的... 指纹识别技术是最早的通过计算机实现的身份识别手段,在今天也是应用最为广泛的生物特征识别技术,但是该识别技术仅针对指纹图像本身。研究了在确保指纹图像不变的情况下隐藏信息,从而来提高识别的正确率。主要讲述了指纹图像(JPEG)的无损数据隐藏,采用的方法是直方图对,该方法的核心是构造直方图对从而嵌入信息。实验结果表明,该方法对指纹图像的纹理特征破坏小,嵌入后的图像的视觉失真也较小,图像质量较高,几乎不影响指纹图像的识别,同时可以把嵌入的信息和指纹识别结合起来从而提高身份认证的效率。 展开更多
关键词 指纹图像 JPEG 无损数据隐藏 直方图对 数字水印 信息隐藏
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IHE集成模式的Petri网建模
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作者 张荣超 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2009年第23期5408-5411,共4页
为了高效地实现采用集成化医疗卫生企业(IHE)技术框架的医疗信息的集成,解决医疗信息系统间的互操作性问题,建立了IHE集成模式和Petri网之间的映射关系,进而构建了基于Petri网的IHE集成模式的工作流模型。利用Java语言开发的开源软件平... 为了高效地实现采用集成化医疗卫生企业(IHE)技术框架的医疗信息的集成,解决医疗信息系统间的互操作性问题,建立了IHE集成模式和Petri网之间的映射关系,进而构建了基于Petri网的IHE集成模式的工作流模型。利用Java语言开发的开源软件平台独立的Petri网编辑器(PIPE2),生成了系统Petri网模型的可达图,为进一步分析模型的动态性质并验证系统的正确性奠定了基础。 展开更多
关键词 集成化医疗卫生企业 技术框架 集成模式 工作流模型 PETRI网模型
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