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百日草几丁质酶基因片段克隆及其序列分析
被引量:
1
1
作者
张振鲁
张佳诗
+5 位作者
隋丽
李启云
王金刚
盛岩
杜茜
汪洋洲
《安徽农业科学》
CAS
2013年第25期10256-10258,10398,共4页
[目的]克隆百日草几丁质酶的基因片段,并对其序列进行分析。[方法]以百日草"梦境"系列为材料,提取其叶片总RNA,并根据其他植物几丁质酶基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR克隆百日草几丁质酶基因片段(ZEchi),并对该基因序...
[目的]克隆百日草几丁质酶的基因片段,并对其序列进行分析。[方法]以百日草"梦境"系列为材料,提取其叶片总RNA,并根据其他植物几丁质酶基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR克隆百日草几丁质酶基因片段(ZEchi),并对该基因序列进行分析。[结果]克隆得到的片段长度为227 bp,共编码75个氨基酸残基;核苷酸同源性分析表明,ZEchi与已报道的其他植物几丁质酶基因同源性达70%以上,其中与葡萄的同源性最高,为74%;氨基酸同源性分析表明,该几丁质酶多肽属于18家族几丁质酶,且与已报道的其他植物几丁质酶氨基酸序列具有70%以上的相似性;氨基酸聚类分析表明,该几丁质酶多肽与白车轴草和蒺藜苜蓿的几丁质酶聚类;生物信息学分析表明,由该基因片段编码的多肽为非跨膜蛋白,主要含α螺旋和随机线圈螺旋等二级结构。[结论]该研究为进一步研究几丁质酶基因的功能奠定了基础。
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关键词
百日草
几丁质酶基因
克隆
序列分析
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职称材料
题名
百日草几丁质酶基因片段克隆及其序列分析
被引量:
1
1
作者
张振鲁
张佳诗
隋丽
李启云
王金刚
盛岩
杜茜
汪洋洲
机构
中国人民大学环境
学院
吉林省农业科学院植物保护研究所/农业部东北农作物有害生物综合治理重点实验室
东北
农业
大学园艺
学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2013年第25期10256-10258,10398,共4页
基金
农业部转基因重大专项(2013ZX08004-004)
吉林省科技厅科技条件与平台建设--吉林省科技基础条件平台建设项目(20122105)
吉林省农科院植保所青年基金项目(zbs2010-01)
文摘
[目的]克隆百日草几丁质酶的基因片段,并对其序列进行分析。[方法]以百日草"梦境"系列为材料,提取其叶片总RNA,并根据其他植物几丁质酶基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR克隆百日草几丁质酶基因片段(ZEchi),并对该基因序列进行分析。[结果]克隆得到的片段长度为227 bp,共编码75个氨基酸残基;核苷酸同源性分析表明,ZEchi与已报道的其他植物几丁质酶基因同源性达70%以上,其中与葡萄的同源性最高,为74%;氨基酸同源性分析表明,该几丁质酶多肽属于18家族几丁质酶,且与已报道的其他植物几丁质酶氨基酸序列具有70%以上的相似性;氨基酸聚类分析表明,该几丁质酶多肽与白车轴草和蒺藜苜蓿的几丁质酶聚类;生物信息学分析表明,由该基因片段编码的多肽为非跨膜蛋白,主要含α螺旋和随机线圈螺旋等二级结构。[结论]该研究为进一步研究几丁质酶基因的功能奠定了基础。
关键词
百日草
几丁质酶基因
克隆
序列分析
Keywords
Zinnia elegans
Chitinase gene
Clone
Sequence analysis
分类号
S681.9 [农业科学—观赏园艺]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
百日草几丁质酶基因片段克隆及其序列分析
张振鲁
张佳诗
隋丽
李启云
王金刚
盛岩
杜茜
汪洋洲
《安徽农业科学》
CAS
2013
1
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