为考察不同乳酸菌对黑果腺肋花楸汁发酵成分及抗氧化活性的影响,该研究选取6株乳酸菌(植物乳植杆菌LP-G18、嗜酸乳杆菌LA-G80、干酪乳杆菌LC-G11、鼠李糖乳杆菌LR-G14、罗伊氏乳杆菌JYLB-291、副干酪乳杆JLPF-176)发酵黑果腺肋花楸汁,...为考察不同乳酸菌对黑果腺肋花楸汁发酵成分及抗氧化活性的影响,该研究选取6株乳酸菌(植物乳植杆菌LP-G18、嗜酸乳杆菌LA-G80、干酪乳杆菌LC-G11、鼠李糖乳杆菌LR-G14、罗伊氏乳杆菌JYLB-291、副干酪乳杆JLPF-176)发酵黑果腺肋花楸汁,并对发酵后黑果腺肋花楸汁的乳酸菌数、理化指标、色泽、生物活性物质及体外抗氧化活性进行分析,并对其品质指标进行相关性分析。结果表明,与对照相比,乳酸菌发酵可以增加乳酸菌数(均高于8.50 lg CFU/mL),降低pH、增加总酸、总黄酮和总多酚、总花色苷含量及主要黄酮、酚类和花色苷类化合物含量,降低还原糖含量及可溶性固形物含量,改善色泽,提升体外抗氧化活性。综合来看,菌株LR-G14,LC-G11及JLPF-176的抗氧化活性较佳。相关性分析表明,总黄酮、总多酚、丁香酸和肉桂酸与体外抗氧化活性呈显著正相关(P<0.05)。展开更多
目的利用生物软件和数据库对耐高温解淀粉芽孢杆菌BA-DES4的基因组数据进行处理、注释和分析,并在基因水平上对菌株特征进行功能注释。方法通过京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本体论(ge...目的利用生物软件和数据库对耐高温解淀粉芽孢杆菌BA-DES4的基因组数据进行处理、注释和分析,并在基因水平上对菌株特征进行功能注释。方法通过京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本体论(gene ontology,GO)等代谢信号通路,蛋白质同源组(clusters of orthologous groups of proteins,COG)、非冗余蛋白质(non-redundant protein,NR)数据库等分析,分别与预测得到的基因序列做比对,获得基因功能注释表。将预测得到基因的蛋白序列与COG、KEGG和GO数据库进行蛋白质序列对蛋白质序列库比对(basic local alignment search tool:protein,BLASTP)比对分析,从而实现基因注释信息预测及功能预测。结果通过数据库分析可知其碱基数目为4188731,GC含量占比为46.18%,编码的蛋白基因4445条,基因总长度为3696380 bp。对基因组蛋白编码基因进行功能注释可知,COG注释基因中占比最高的功能为G(碳水化合物的转运和代谢),其次为K(转录),表明COG数据库编码的蛋白基因主要参与细胞的基本功能。GO注释中,基因种类和数目最多的为生物学过程;碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)注释中,水解酶占比最高;KEGG注释中,碳水化合物代谢数目最多;在环境信息中,信息转导占比最多。耐高温解淀粉芽孢杆菌BA-DES4共11条编码纤维素酶的基因,β-葡萄糖苷酶和内切葡聚糖酶为基因编码的酶。结论本研究对耐高温解淀粉芽孢杆菌BA-DES4的基因组数据进行处理、注释和分析,进一步探索菌株研究潜力,以便更好地探究菌株产纤维素的调控机制,为后续实验提供理论基础。展开更多
文摘为考察不同乳酸菌对黑果腺肋花楸汁发酵成分及抗氧化活性的影响,该研究选取6株乳酸菌(植物乳植杆菌LP-G18、嗜酸乳杆菌LA-G80、干酪乳杆菌LC-G11、鼠李糖乳杆菌LR-G14、罗伊氏乳杆菌JYLB-291、副干酪乳杆JLPF-176)发酵黑果腺肋花楸汁,并对发酵后黑果腺肋花楸汁的乳酸菌数、理化指标、色泽、生物活性物质及体外抗氧化活性进行分析,并对其品质指标进行相关性分析。结果表明,与对照相比,乳酸菌发酵可以增加乳酸菌数(均高于8.50 lg CFU/mL),降低pH、增加总酸、总黄酮和总多酚、总花色苷含量及主要黄酮、酚类和花色苷类化合物含量,降低还原糖含量及可溶性固形物含量,改善色泽,提升体外抗氧化活性。综合来看,菌株LR-G14,LC-G11及JLPF-176的抗氧化活性较佳。相关性分析表明,总黄酮、总多酚、丁香酸和肉桂酸与体外抗氧化活性呈显著正相关(P<0.05)。
文摘目的利用生物软件和数据库对耐高温解淀粉芽孢杆菌BA-DES4的基因组数据进行处理、注释和分析,并在基因水平上对菌株特征进行功能注释。方法通过京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)和基因本体论(gene ontology,GO)等代谢信号通路,蛋白质同源组(clusters of orthologous groups of proteins,COG)、非冗余蛋白质(non-redundant protein,NR)数据库等分析,分别与预测得到的基因序列做比对,获得基因功能注释表。将预测得到基因的蛋白序列与COG、KEGG和GO数据库进行蛋白质序列对蛋白质序列库比对(basic local alignment search tool:protein,BLASTP)比对分析,从而实现基因注释信息预测及功能预测。结果通过数据库分析可知其碱基数目为4188731,GC含量占比为46.18%,编码的蛋白基因4445条,基因总长度为3696380 bp。对基因组蛋白编码基因进行功能注释可知,COG注释基因中占比最高的功能为G(碳水化合物的转运和代谢),其次为K(转录),表明COG数据库编码的蛋白基因主要参与细胞的基本功能。GO注释中,基因种类和数目最多的为生物学过程;碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)注释中,水解酶占比最高;KEGG注释中,碳水化合物代谢数目最多;在环境信息中,信息转导占比最多。耐高温解淀粉芽孢杆菌BA-DES4共11条编码纤维素酶的基因,β-葡萄糖苷酶和内切葡聚糖酶为基因编码的酶。结论本研究对耐高温解淀粉芽孢杆菌BA-DES4的基因组数据进行处理、注释和分析,进一步探索菌株研究潜力,以便更好地探究菌株产纤维素的调控机制,为后续实验提供理论基础。