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lncRNA GAS5基因多态性与多囊卵巢综合征发病风险的相关性研究
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作者 陆玉兰 庞晓霞 +2 位作者 陈兴鸿 韦玉霞 刘纯宏 《中国病理生理杂志》 北大核心 2025年第2期348-353,共6页
目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)生长阻滞特异性转录物5(GAS5)基因多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)发病的关联性。方法:选取2018年5月~2019年5月在广西右江民族医学院附属医院生殖医学中心确诊的236例PCOS患者作为病例组,同时选取同期性... 目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)生长阻滞特异性转录物5(GAS5)基因多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)发病的关联性。方法:选取2018年5月~2019年5月在广西右江民族医学院附属医院生殖医学中心确诊的236例PCOS患者作为病例组,同时选取同期性别、年龄相匹配的277例健康女性作为对照组,采用iMLDR单核苷酸多态性(SNP)分型方法检测GAS5基因rs145204276 I/D、rs55829688 C/T和rs6790 G/A位点基因型。采用logistic回归分析GAS5基因多态性与PCOS的相关性。结果:GAS5基因rs145204276 I/D位点多态性在对照组和PCOS组之间差异有统计学意义,logistic回归分析结果显示,与I/I基因型相比,I/D和D/D基因型以及显性模型I/D+D/D具有较低的PCOS发病风险[I/D vs I/I:OR(95%CI)=0.61(0.42,0.88),P=0.009;D/D vs I/I:OR(95%CI)=0.44(0.23,0.84),P=0.013;I/D+D/D vs I/I:OR(95%CI)=0.57(0.40,0.81),P=0.002];与I等位基因相比,D等位基因显著降低PCOS的发病风险[D vs I:OR(95%CI)=0.62(0.47,0.82),P=0.001]。rs55829688 C/T和rs6790 G/A位点多态性在对照组和PCOS组之间比较差异均无统计学意义(P>0.05)。单倍型联合分析显示D-T-A单倍型在对照组和PCOS组间的分布差异有统计学意义[OR(95%CI)=0.61(0.45,0.84),P=0.002]。结论:GAS5基因rs145204276 I/D位点多态性可能与PCOS遗传易感性相关,即携带D等位基因的个体可能具有较低的PCOS发病风险。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征 单核苷酸多态性 长链非编码RNA 生长阻滞特异性转录物5
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广西人群LncRNA-GAS5基因rs6790A/G和rs1951625A/G位点多态性分布 被引量:2
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作者 刘纯宏 王艳 +5 位作者 石凤 陆玉兰 黄华佗 王春芳 韦叶生 蓝艳(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第20期2495-2499,共5页
目的:研究分析广西人群LncRNA-GAS5基因rs6790A/G和rs1951625A/G位点多态性的分布特征,并比较其与其他不同地区人群的分布差异。方法:采用SNPscan技术对289例广西人rs6790A/G和rs1951625A/G位点进行基因分型检测,并与国际千人基因组计... 目的:研究分析广西人群LncRNA-GAS5基因rs6790A/G和rs1951625A/G位点多态性的分布特征,并比较其与其他不同地区人群的分布差异。方法:采用SNPscan技术对289例广西人rs6790A/G和rs1951625A/G位点进行基因分型检测,并与国际千人基因组计划数据库公布的中国南方汉族人群(CHS)、日本人群(JPT)、欧洲人群(CEU)、非洲人群(AFR)和美洲人群(AMR)的分布数据进行比较,分析不同种族人群rs6790A/G和rs1951625A/G位点基因型及等位基因频率的分布差异。结果:rs6790A/G位点AA、GA和GG 3种基因型分布频率分别为15.6%、48.1%和36.3%;rs1951625A/G位点AA、GA和GG 3种基因型分布频率分别为8.3%、38.1%和53.6%。2个位点的基因型和等位基因频率在广西人群不同性别间的差异均无统计学意义(P>0.05)。广西人群rs6790A/G位点的基因型和等位基因频率与JPT、CEU、ARF和AMR人群差异均有统计学意义(P<0.05),与CHS人群差异无统计学意义(P>0.05);广西人群rs1951625A/G位点的基因型和等位基因频率与AFR人群差异有统计学意义(P<0.05),与CHS、JPT、CEU和AMR人群差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:广西人群LncRNA-GAS5基因rs6790A/G和rs1951625A/G位点存在基因多态性,且其在不同人群间存在不同程度的差异。 展开更多
关键词 LncRNA-GAS5基因 基因多态性 广西人群
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c.1311C>T和c.1004C>A与广西G6PD缺乏症的发病风险相关性
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作者 石凤 滕元姬 +5 位作者 何丽桥 李兰 李光景 仇雯丽 王春芳 王俊利 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2022年第1期165-168,共4页
目的探究广西人群葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因单核苷酸多态性(SNP)位点c.1311C>T和c.1004C>A与G6PD缺乏症的发病风险相关性。方法随机选取417例G6PD缺乏症患者作为病例组,295例健康人群作为对照组。使用SNPscan^(TM)多重SNP方... 目的探究广西人群葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因单核苷酸多态性(SNP)位点c.1311C>T和c.1004C>A与G6PD缺乏症的发病风险相关性。方法随机选取417例G6PD缺乏症患者作为病例组,295例健康人群作为对照组。使用SNPscan^(TM)多重SNP方法对c.1311C>T和c.1004C>A进行基因分型,通过SHEsis分析两位点单倍型频率。结果在病例组和对照组中,c.1311C>T位点的基因型TT,CC+CT和等位基因T的分布频率差异具有统计学意义[TT vs CC:(P=0.001,OR=0.373,95%CI=0.204~0.683);TT vs CC+CT:(P=0.001,OR=0.371,95%CI=0.203~0.678);T vs C:(P=0.002,OR=0.601,95%CI=0.435~0.829)];而c.1004 C>A位点的基因型和等位基因分布频率差异不具有统计学意义(P>0.05)。速率法检测结果显示:相对于基因型CC,c.1311C>T位点的基因型CT增加G6PD酶表达水平,基因型TT降低G6PD酶表达水平(P<0.05),单倍型结果显示C-C和T-C与G6PD发病风险有关(P<0.05)。结论在广西人群中,c.1311C>T位点基因型TT、CC+CT和等位基因T与G6PD缺乏症的发病风险降低具有相关性。 展开更多
关键词 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶 单核苷酸多态性 c.1311C>T c.1004C>A
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基于TCGA数据库筛选调控mRNA表达的子宫颈癌相关基因
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作者 石凤 陈志鸿 +3 位作者 李光景 陈升才 罗小琼 王俊利 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期312-317,共6页
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选调控子宫颈癌发生发展的遗传突变基因,并探讨突变基因的临床价值。方法从TCGA数据库下载子宫颈癌相关单核苷酸多态性数据和表达谱数据。通过R软件进行差异表达分析。通过DAVID软件对差异表达基... 目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选调控子宫颈癌发生发展的遗传突变基因,并探讨突变基因的临床价值。方法从TCGA数据库下载子宫颈癌相关单核苷酸多态性数据和表达谱数据。通过R软件进行差异表达分析。通过DAVID软件对差异表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并使用String和Cytoscape进行蛋白网络互作分析。筛选与蛋白表达水平相关的突变基因并绘制生存曲线。结果GO和KEGG富集分析显示突变基因负调控RNA聚合酶Ⅱ启动子区域、参与Notch信号通路及多种致癌过程。DNAH17、FBXW7和SYNE23个突变基因与相应的mRNA表达水平显著相关(P分别为0.020、0.029、0.031)。SYNE2高表达显著降低子宫颈癌患者的无病生存期(P=0.008)。结论DNAH17、FBXW7和SYNE2基因突变可调控mRNA的表达水平,为子宫颈癌的遗传突变风险提供重要的生物信息学理论依据。 展开更多
关键词 生物信息学 子宫颈癌 单核苷酸多态性
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RGS6在肿瘤中的研究进展
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作者 吴小勤 黄宏宝 +1 位作者 吴雪铭 龙喜带 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第4期454-457,共4页
G蛋白信号传导调节蛋白6(regulator of G protein signaling 6,RGS6)是G蛋白信号传导通路负性调节因子家族的重要成员,在肝、心、脑、肠等多个器官均有表达,表达产物包含C-端结构域、N-端结构域、GGL结构域等多个功能结构域,在调节G蛋... G蛋白信号传导调节蛋白6(regulator of G protein signaling 6,RGS6)是G蛋白信号传导通路负性调节因子家族的重要成员,在肝、心、脑、肠等多个器官均有表达,表达产物包含C-端结构域、N-端结构域、GGL结构域等多个功能结构域,在调节G蛋白信号通路中起重要作用,其表达或功能失调参与多种类型肿瘤的发生、发展,该文就近年来RGS6在肿瘤中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 肿瘤 G蛋白信号传导调节蛋白6 文献综述
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