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题名NRDPT:下一代测序数据的处理方法
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作者
张骏
殷陶
陈玲慧
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机构
上海交通大学计算机科学与工程系生物智能与信息实验室
台湾交通大学多媒体工程研究所
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出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
2012年第24期258-261,265,共5页
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文摘
随着下一代基因测序技术的发展,其数据处理面临着越来越高的要求和挑战,基因测序软件厂商的基本数据处理程序已经不能满足实验要求。为此,提出一种新的数据处理方法(NRDPT)。在第3代基因测序原理的基础上,根据边缘信息和霍夫变换重新设计图像的处理步骤,给出新的基因簇定位算法,并设计两步配准算法。实验结果表明,与传统的直接配准方法相比,该方法能使配准速度提升约9倍。
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关键词
下一代测序
基因测序
开源软件
图像处理
图像配准
图像分析
信号处理
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Keywords
Next Generation Sequencing（NGS）
DNA sequencing
open source software
image processing
image alignment
image analysis
signal processing
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分类号
TN911.73
[电子电信—通信与信息系统]
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